病原細菌のゲノム進化における逆転写酵素とレトロエレメントの役割

逆转录酶和逆转录元件在病原菌基因组进化中的作用

基本信息

批准号：
15013241
负责人：
島本整
金额：
$ 2.5万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

細菌逆転写酵素は,細胞内でcDNA産物であるmulticopy single-stranded DNA(msDNA)と呼ばれるRNA-DNA複合体の合成に必須の酵素である。細菌逆転写酵素遺伝子(ret)は,ゲノム上でmsDNAの配列をコードする領域とともにレトロンと呼ばれるオペロンを形成しており,一種のレトロエレメントであると考えられている。本研究では,転移性遺伝因子の一種と考えられるレトロンが細菌のゲノム進化にどのように寄与しているのか,また他の転移性因子との関連性などについて明らかにすることを目的としている。これまでの解析で,新たにSalmonella enterica serovar Typhimurium由来のレトロンの詳細な解析を行い,msDNA-St85の構造解析を行った。このレトロンは,S.Typhimuriumの多剤耐性株であるDT104株にも見つかっており,この株では複数の薬剤耐性遺伝子を含むpathogenicity islandとレトロンが隣接して存在している。薬剤耐性遺伝子の転移に関与しているインテグロンの場合,転移遺伝子カセットの形成に逆転写酵素が関与しているという説があることからインテグロンの解析も同時に行っている。これまでにVibrio fluvialis, salmonella,毒素源性大腸菌(ETEC),腸管侵入性大腸菌(EIEC)などから新たなインテグロンを単離・解析している。

细菌逆转酶是一种必需酶，称为多拷贝单链DNA（MSDNA），这是一种细胞中的cDNA产物。细菌逆转酶基因（RET）与编码基因组上MSDNA序列的区域形成了一个名为Reton的操纵子，被认为是一种复古的错误。这项研究旨在阐明雷隆如何被认为是一种转移性遗传因素，这有助于细菌基因组进化以及与其他转移性因素的相关性。在先前的分析中，进行了源自沙门氏菌血清伤寒的新分析的反元分析，并进行了MSDNA-ST85的结构分析。该逆转录元素已在二磷的聚合物耐药性DT104菌株中发现，该菌株具有致病性岛和反龙，其中包含多种药物耐药基因。与药物耐药基因转移有关的综合量也同时分析了整合子，因为有一种理论认为逆转与转移酶的形成有关。迄今为止，已从弧菌，沙门氏菌，毒素神经皮大肠杆菌（ETEC）和肠道侵入式大肠杆菌（EIEC）中分离出新的整合子。

项目成果

期刊论文数量（6）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Ashraf M.Ahmed: "msDNA-St85, a multicopy single-stranded DNA isolated from Salmonella enterica serovar Typhimurium LT2 with the genomic analysis of its retron"FEMS Microbiology Letters. 224. 291-297 (2003)

Ashraf M.Ahmed：“msDNA-St85，一种从肠沙门氏菌鼠伤寒血清型 LT2 中分离出来的多拷贝单链 DNA，并对其逆转录子进行了基因组分析”FEMS 微生物学快报。

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Ashraf M.Ahmed: "New aminoglycoside acetyltransferase gene, aac(3)-Id, in class I integron from a multiresistant strain of Vibrio fluvialis isolated from an infant aged 6 month"Journal of Antimicrobial Chemotherapy. (In press).

Ashraf M.Ahmed：“新的氨基糖苷乙酰转移酶基因，aac(3)-Id，位于从 6 个月婴儿分离出的多重耐药河弧菌菌株的 I 类整合子中”《抗菌化疗杂志》。

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影响因子：
0
作者：
通讯作者：

島本整: "細菌の逆転写酵素およびmsDNAの構造と機能"日本細菌学雑誌. 58. 441-445 (2003)

Sei Shimamoto：“细菌逆转录酶和 msDNA 的结构和功能”日本细菌学杂志 58. 441-445 (2003)。

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B. A. Venmathi Maran