病原細菌のゲノム進化におけるレトロンとインテグロンの役割

逆转录子和整合子在病原菌基因组进化中的作用

基本信息

批准号：
16013236
负责人：
島本整
金额：
$ 3.2万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は,転移性遺伝因子と考えられているレトロンとインテグロンが病原細菌のゲノム進化にどのような役割を果たしているのかを明らかにすることを目的としている。流行性コレラの原因となるVibrio cholerae O1/O139株(コレラ菌)には普遍的にレトロンが存在しているのに対して,コレラを引き起こさないnon-O1/non-O139株では一部の例外を除いてレトロンが存在しておらず,レトロン領域にゲノム構造の多様性が認められた。さらに例外的にnon-O1/non-O139株で発見されたレトロンでは,レトロン領域の前後で数多くの変異が見つかっており,ゲノムのレトロン領域の多様性が明らかになった。一方,V.cholerae,病原性大腸菌(enterotoxigenic Escherlchia coli ETEC),腸管侵入性大腸菌(enteroinvasive E.coil, EIEC), Salmonellaなどから数多くのインテグロンを検出し,インテグロン内の遺伝子カセット(薬剤耐性遺伝子)の構造解析を行った。その結果,これまでに知られていなかった新たな遺伝子を複数発見し,同じ細菌種内でもインテグロンによるゲノム構造の違いを示すことができた。特に,サルモネラでは,新たな遺伝子構成のクラス2インテグロンを発見した。さらに,これまでV.choleraeにおいてのみ存在が報告されていた接合伝達性トランスポゾンの一種であるSXT elementをV.fluvialisで発見し,詳しい解析を行った。SXT elementには複数の薬剤耐性遺伝子が含まれており,細菌の多剤耐性の伝播に関与していると考えられており,V.cholerae以外の多種の細菌で発見された意義は大きい。

这项研究旨在阐明雷隆和整合子如何被认为是转移性遗传因素，它们在致病细菌的进化中起作用。引起时尚霍乱的Virio Cholerae O1/O139股票（霍乱细菌）具有通用的逆转录，但非O1/non-O139股票中的某些例外不引起霍乱。基因组结构的多样性在背区域被识别。此外，在非O1/非O139股份中发现的反龙中，发现了许多突变，在retroN区域之前和之后发现了许多突变，揭示了基因组回值区域的多样性。同时，V.胆碱，致病性大肠（肠毒素大肠杆菌ETEC），肠道浸润大肠杆菌（肠毒素E.Coil，EIEC，沙门氏菌，沙门氏菌等都检测到了许多整合子等。进行了分析。结果，到目前为止尚不知道多个新基因，即使在同一细菌物种中也可以显示整合子的基因组结构。特别是，沙门氏菌发现了一种新的基因构型2类积分。此外，在V.Fluvialis中发现了仅在V.Cholerae中报告的一种连接传输转座子的SXT元素，并进行了详细的分析。 SXT元素包含多种耐药基因，被认为与细菌多药物耐药性的传播有关，并且在V.Cholerae以外的各种细菌中发现的意义很重要。

项目成果

期刊论文数量（12）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

The first characterization of extended-spectrum β-lactamase-producing Salmonella in Japan

DOI：
10.1093/jac/dkh300
发表时间：
2004-07-01
期刊：
JOURNAL OF ANTIMICROBIAL CHEMOTHERAPY
影响因子：
5.2
作者：
Ahmed, AM;Nakano, H;Shimamoto, T
通讯作者：
Shimamoto, T

A variant type of Vibrio cholerae SXT element in a multidrug-resistant strain of Vibrio fluvialis

DOI：
10.1016/j.femsle.2004.11.012
发表时间：
2005-01-15
期刊：
FEMS MICROBIOLOGY LETTERS
影响因子：
2.1
作者：
Ahmed, AM;Shinoda, S;Shimamoto, T
通讯作者：
Shimamoto, T

Molecular characterization of a multidrug-resistant strain of enteroinvasive Escherichia coli O164 isolated in Japan

DOI：
10.1099/jmm.0.45908-0
发表时间：
2005-03-01
期刊：
JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY
影响因子：
3
作者：
Ahmed, AM;Miyoshi, S;Shimamoto, T
通讯作者：
Shimamoto, T

Plasmid-encoded class 1 integron carrying sat, phosphoserine phosphatase gene and aadA2 from enterotoxigenic Escherichia coli O159 in Japan

质粒编码的 1 类整合子，携带来自日本产肠毒素大肠杆菌 O159 的 sat、磷酸丝氨酸磷酸酶基因和 aadA2

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
FEMS Microbiology Letters 235
影响因子：
0
作者：
Okuda;K.;Hayashi;H.;Nishiyama;Y.;Ashraf M.Ahmed
通讯作者：
Ashraf M.Ahmed

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通讯作者：
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通讯作者：
B. A. Venmathi Maran