逆転写酵素遺伝子を含むレトロンによる病原性発現調節とゲノム多様性との関係

逆转录酶基因逆转录子致病性表达的调控及其与基因组多样性的关系

• 批准号: 20018019
• 负责人: 島本 整
• 金额: $ 5.38万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20018019/
• 关键词: 逆転写酵素; レトロン; コレラ菌; Vibrio mimicus; 病原性; 可動性遺伝因子; マイクロアレイ

(1) 種々の病原細菌からのレトロンの単離・同定Vibrio cholerae non-O1, non-O139株であるN-11a株およびコレラ菌の類縁菌であるV.mimicus CS18株より新たなレトロンを単離し,解析を行った。V.cholerae N-11a株のレトロン-Vc154とV.mimicus CS30株のレトロン-Vm129由来のmsDNA-Vc154とmsDNA-Vm129は,いずれもDNA部分に複数のステム・ループ構造を持つ新たなタイプのmsDNAであった。これらのmsDNAは,病原性など細菌の生体調節機構に関与するアプタマーなどの機能を有していると推測された。(2) コレラ菌におけるレトロンとゲノム多様性との関係V. cholerae non-O1, non-O139株であるN-1b株は,O1, O139株が保有するレトロン-Vc95とは異なるレトロン-Vc81を保有していた。ゲノム上での挿入部位を調べたところ,レトロン-Vc81はレトロン-Vc95とまったく同じ部位に置換して挿入されていることが明らかになった。さらに,データベースにゲノム配列が登録されているV.cholerae V52株にも同じ領域に別のレトロン-Vc137が存在していることを発見した。以上の結果よりV.choleraeのレトロン挿入部位はゲノムの多様性をもたらしていると考えられた。(3) 薬剤耐性菌における薬剤耐性遺伝子を含む可動性遺伝因子の解析エジプトの家畜由来の細菌,魚の養殖場の環境由来菌,パレスチナの入院患者由来の臨床株,アフリカからの輸入動物由来株など数多くの薬剤耐性菌を解析し,新たな薬剤耐性遺伝子を含む種々の耐性遺伝子を検出し,解析した。それらの遺伝子の多くがインテグロンなどの可動性遺伝因子に含まれていた。

(1)多种病原菌逆转录子的分离鉴定从霍乱弧菌非O1、非O139菌株N-11a和霍乱弧菌相关菌V.mimicus CS18菌株中分离鉴定新的逆转录子并进行分析。源自霍乱弧菌N-11a菌株的retrotron-Vc154和拟态弧菌CS30菌株的retron-Vm129的msDNA-Vc154和msDNA-Vm129都是DNA部分具有多个茎环结构的新型msDNA。据推测，这些msDNA具有适体等功能，参与细菌的致病性等生物调节机制。 (2)霍乱弧菌逆转录子与基因组多样性的关系 N-1b株是非O1、非O139株，其携带的逆转录子-Vc81与O1、O139株所具有的逆转录子-Vc95不同。拥有。对基因组上插入位点的检查表明，retron-Vc81 的插入位点与 retron-Vc95 完全相同。此外，我们发现霍乱弧菌V52菌株的同一区域中存在另一个逆转录子-Vc137，该菌株的基因组序列已在数据库中注册。基于上述结果，霍乱弧菌的逆转录子插入位点被认为是造成基因组多样性的原因。 （3）耐药菌中包括耐药基因在内的可移动遗传元件分析：埃及牲畜来源的细菌、养鱼场环境来源的细菌、巴勒斯坦住院病人来源的临床菌株、非洲进口动物来源的菌株等。对大量耐药菌进行了分析，对包括新耐药基因在内的多种耐药基因进行了检测和分析。其中许多基因包含在可移动遗传元件中，例如整合子。

项目成果

Association of a novel retron with a mobile genetic element integrated into the dihydrouridine synthase gene of Vibrio mimicus

新型逆转录子与整合到拟态弧菌二氢尿苷合酶基因中的可移动遗传元件的关联

• 发表时间: 2008
• 作者: 大澤春彦;他;Tadashi Shimamoto
• 通讯作者: Tadashi Shimamoto

Antibiotic resistance of the Japanese probiotic bacteria

日本益生菌的抗生素耐药性

• 发表时间: 2009
• 作者: Miyaki K;Lwin H;Masaki K;Song Y;Takahashi Y;Muramatsu M;Nakayama T;Ahmed M.Hammad
• 通讯作者: Ahmed M.Hammad

Characterization of integrons and antimicrobial resistance genes in clinical isolates of Gram-negative bacteria from Palestinian hospitals

• DOI: 10.1111/j.1348-0421.2009.00168.x
• 发表时间: 2009-11-01
• 期刊: MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY
• 影响因子: 2.6
• 作者: Hussein, Amjad I. A.;Ahmed, Ashraf M.;Shimamoto, Tadashi
• 通讯作者: Shimamoto, Tadashi

Isolation and molecular characterization of multidrug-resistant Gram-negative bacteria from imported flamingos in Japan

日本进口火烈鸟多重耐药革兰氏阴性菌的分离和分子鉴定

• 发表时间: 2009
• 期刊: Acta Veterinaria Scandinavica 51
• 作者: Kato N;Miki T;et.al.;Maiko Sato
• 通讯作者: Maiko Sato

レトロンによるコレラ菌の病原性発現制御機構の解析

逆转录子分析霍乱弧菌致病性表达调控机制

• 发表时间: 2009
• 作者: Tabara Y;Mild T;et.al.;Ahmed M. Hammad;島本整
• 通讯作者: 島本整