プロテオーム解析による統合失調症と双極性障害の病態に共通する分子の探索

使用蛋白质组分析寻找精神分裂症和双相情感障碍病理学中常见的分子

基本信息

批准号：
20659181
负责人：
尾崎紀夫
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

リンパ芽球様細胞株は性別および年齢を一致させた統合失調症患者と対照健常者の末梢血液よりリンパ球細胞を単離し,エプスタイン・バールウイルスを用いて作成した.サンプルの調製は同一培養条件で21日間の継代培養を行った細胞からタンパク質を抽出した.2D-DIGE法を用いてタンパク質の発現差異解析を行い,PMF法により分子の同定を行った.さらに,同定されたタンパク質についてDAVIDを用いて同定分子の生体内における機能分類を行い,GSEAによって分類された項目の評価を行った.性別および年齢の一致した統合失調症患者および健常者の末梢血液由来リンパ芽球様細胞株のうち,増殖の優れなかった細胞株は解析対象から除外し,患者・対照群それぞれ29例について2D-DIGE法によるタンパク質の網羅的発現差異解析を行った.各群において発現を認めた平均スポット数は,患者群1102.8±13.3個,対照群1102.6±16.2個であり,両群間に有意な差は認められなかった.検出された全1174個のスポットについて発現量を比較検討した結果,両群間において発現変化の認められたスポット数は20個であった(Student's t-test, p<0.05).発現変化の認められた20個のスポットについては,PMF法によるタンパク質の同定を行い,1つのスポットから複数のタンパク質の可能性が見出されたものを含め,22個のタンパク質を同定した.同定した22種類の分子についてDAVIDを用いて機能分類を行った.PANTHER Biological Processのデータベースに基づいてGSEAを行った結果,有意差の認められた項目は,"protein metabolism and modification"(7 genes), "ligand-mediated signaling"(5 genes), "apoptosis"(4 genes)であった。

使用 Epstein-Barr 病毒从性别和年龄匹配的精神分裂症患者和健康对照的外周血中分离淋巴细胞来创建淋巴母细胞系，并在相同的培养条件下从传代培养 21 天的细胞中提取蛋白质。 -D。我们使用IGE方法进行蛋白质的差异表达分析，并使用PMF方法鉴定分子。此外，我们使用DAVID对鉴定的分子进行功能分类，并使用GSEA对项目进行性别和年龄匹配的整合评级。共济失调患者和健康人的外周血来源的淋巴母细胞系中，排除增殖不良的细胞系，采用2D-DIGE方法对患者组和对照组各29例进行蛋白质综合分析我们进行了差异表达分析，每组中表达的斑点的平均数量为。对照组有1102.8±13.3个斑点，对照组有1102.6±16.2个斑点，两组之间没有观察到显着差异。通过比较所有检测到的1174个斑点的表达水平，发现观察到表达变化的点数量为 20 个（学生的t检验，p<0.05）。对于观察到表达变化的20个点，使用PMF方法鉴定蛋白质，包括从一个点发现多种蛋白质的可能性的蛋白质。鉴定出22种类型。使用DAVID对鉴定出的分子进行功能分类。根据PANTHER Biological Process数据库进行GSEA，结果发现有显着差异的项目是“蛋白质”和“蛋白质”。修饰”（7 个基因）、“配体介导的信号传导”（5 个基因）和“细胞凋亡”（4 个基因）。