線虫転写因子群の系統的遺伝子破壊株を用いた網羅的ゲノム機能解析

使用线虫转录因子的系统基因破坏菌株进行全面的基因组功能分析

基本信息

批准号：
12202048
负责人：
三谷昌平
金额：
--
依托单位：
Tokyo Women's Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12202048/
关键词：
線虫転写因子ゲノム遺伝子破壊株

项目摘要

<背景と目的>線虫C.elegansでは細胞系譜や形態の記載が完成しており、ゲノムやcDNAの塩基配列情報が整備されている。発現バターンやホモロジーなどの情報により着目する遺伝子の機能を逆遺伝学的手法を用いた解析することが有用と思われる。逆遺伝学的手法の代表的なものとしては、RNA干渉法と欠失変異体分離法とに分けられる。我々は、後者の手法を用いて、発生解析に供することができるような転写因子を中心とした変異体分離を進めている。<検討結果>(1)変異体分離:転写因子については、63遺伝子の変異体を分離済である。その他にも、共同研究および、国際的線虫遺伝子ノックアウトコンソーシアムの活動による変異体分離を行っており、累計113遺伝子に至っている。さらに、解凍待ち、およびSib-screening中の変異体後補が65遺伝子あり、近日中に分離できると期待される。(2)系統的表現型解析:転写因子群の中で、線虫で6個あるCutクラスホメオボックスに着目し、変異体分離と発現解析を行っている。初期胚で多数の細胞に発現し、後に少数のニューロンでの特異的発現に移行していくバターンが多い。今後、詳細な表現型解析を行う予定である。(3)神経系を中心に細胞標識を作成している。現在までに、発現細胞既知の26種類のプロモーターについての発現コントラクトができている。また、上述の転写因子等で特異的発現バターンの遺伝子について、正確な発現細胞の同定を行い、細胞標識や強制発現のツールに加えて行く予定である。<考察>線虫の欠失変異体分離は、極めて非効率的な実験であった。我々は、効率良く分離する技術を開発し、変異体分離を進めている。平成12年秋より、線虫遺伝子ノックアウトコンソーシアムに加盟しており、ノックアウトストレインを用いたゲノム機能解析全般に貢献したい。

<背景和目的>在秀丽隐杆线虫中描述了细胞谱系和形态，并且已经制备了基因组和cDNA碱基序列信息。分析侧重于使用诸如表达BATARN和同源性使用逆遗传技术的信息的基因的功能将很有用。典型的反向遗传技术可以分为RNA干扰法和缺失突变分离方法。我们将后一种方法用于分离突变体，重点是可用于发育分析的转录因子。 <结果>（1）突变分离：对于转录因子，已经分离出63个基因的突变体。此外，我们通过国际线虫基因敲除联盟的活性进行了突变体的联合研究和分离，导致累计总共113个基因。此外，有65个邮政补充剂基因等待解冻和筛查，预计将很快隔离。（2）系统的表型分析：在转录因子组中，进行突变分离和表达分析，重点是线虫中的六个切割类同源物氧。许多Bataans在早期胚胎中以大量细胞表达，然后在少数神经元中过渡到特定表达。将来将进行详细的表型分析。（3）细胞标记主要是在神经系统中创建的。迄今为止，已经为26个已知细胞的启动子签订了表达合同。此外，上述转录因子等将准确地识别出表达的细胞，并将用作细胞标记和强制表达的工具。 <讨论>在线虫中隔离缺失突变体是一个极低效率的实验。我们正在开发有效的分离技术，并正在努力分离突变体。自2000年秋天以来，我们一直是线虫基因基因敲除联盟的成员，我们想使用基因组菌株为所有基因组函数分析做出贡献。