迅速冷却によるグルタチオン合成酵素反応中の準安定構造のX線結晶解析
快速冷却谷胱甘肽合成酶反应过程中亚稳态结构的 X 射线晶体学
基本信息
- 批准号:06760085
- 负责人:
- 金额:$ 0.64万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
- 财政年份:1994
- 资助国家:日本
- 起止时间:1994 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
1.グルタチオン合成酵素にγグルタミルシステイン依存性ATP加水分解活性があることを見いだした。この活性は、通常本来のグルタチオン合成活性の2%以下に押さえられているものの、活性中心を覆っていると考えられるフレキシブルループを削除することによってその割合が上昇した。すなわち、フレキシブルループは、アシルリン酸中間体とグリシンとの反応を制御していると考えられる。2.このATP加水分解活性に注目し、反応途中の酵素基質複合体をX線結晶解析で捕捉することを目的として以下の系を構築した。すなわち、caged-ATPと呼ばれる光照射によって外れる保護基を導入されたATPとγグルタミルシステインをグルタチオン合成酵素と共存させて結晶化し、得られた複合体酵素の結晶にフラッシュを照射することで反応を開始直後、結晶を迅速に冷却することによって反応を停止させ、その状態をX線結晶構造解析するものである。(1)結晶中においてグルタチオン合成酵素によって触媒されるγグルタミルシステイン依存性のATP加水分解反応を、HPLCを用いて定量した。次いで、グルタチオン合成酵素とcaged-ATP及びγグルタミルシステインとの複合体結晶を作成し、フラッシュフォトリシスによってcaged-ATPからATPを放出させた後、20℃にて反応させたところ、結晶状態のグルタチオン合成酵素によって、70時間後に60%のATPがADPに、4日後には、90%のATPがADPに変換されていることが判明した。(2)反応開始直後と反応終了時の結晶を0℃に冷やすことでほぼ反応を停止させ、その状態のX線回折強度を測定した。その結果、酵素によって加水分解される直前のATPの構造を捉えることに成功した。また、ATPの加水分解にともない166番目と167番目のグリシン残基が大きく構造変化することが観測された。
1.我们发现谷胱甘肽合酶具有γ-谷氨酰半胱氨酸依赖性ATP水解活性。尽管这种活性通常被抑制到原始谷胱甘肽合成活性的 2% 以下,但通过删除被认为覆盖活性中心的柔性环,该比率得以增加。也就是说,柔性环被认为控制酰基磷酸中间体和甘氨酸之间的反应。 2.针对ATP水解活性,我们构建了以下系统,旨在通过X射线晶体学捕获反应过程中的酶-底物复合物。具体来说,ATP(具有可通过光照射去除的被称为笼状-ATP的保护基团)和γ-谷氨酰半胱氨酸在谷胱甘肽合成酶的共存下结晶,并且用闪光灯照射所得的复合酶晶体以引发反应开始后,立即通过快速冷却晶体来停止反应,并通过X射线晶体结构分析来分析所得状态。 (1)使用HPLC对晶体中谷胱甘肽合成酶催化的γ-谷氨酰半胱氨酸依赖性ATP水解反应进行定量。接下来,制作了谷胱甘肽合成酶、笼状-ATP和γ-谷氨酰半胱氨酸的复合晶体,通过闪光光解从笼状-ATP中释放出ATP后,在20℃下进行反应,得到结晶状谷胱甘肽。发现70小时后60%的ATP被合成酶转化为ADP,4天后90%的ATP转化为ADP。 (2)在反应开始后和反应结束时将结晶冷却至0℃,使反应几乎停止,测定该状态下的X射线衍射强度。结果,他们成功捕获了 ATP 被酶水解之前的结构。此外,还观察到第 166 位和第 167 位甘氨酸残基因 ATP 水解而发生重大结构变化。
项目成果
期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
加藤博章: "Flexible Loop That Is Novel Catalytic Machinery in a Ligase. Atomic Structure and Function of the Loopless Glutathione Synthetase" Biochemistry. 33. 4995-4999 (1994)
Hiroaki Kato:“柔性环是连接酶中的新型催化机制。无环谷胱甘肽合成酶的原子结构和功能”生物化学 33. 4995-4999 (1994)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
加藤 博章其他文献
Lafitidine-induced increase in intracellular Ca2+ concentrations in PC12 and endothelial cells.
拉菲替丁诱导 PC12 和内皮细胞细胞内 Ca2+ 浓度增加。
- DOI:
- 发表时间:
2005 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Kashiwayama;Y.;Tsugumi Nakanishi;Takao Hibi;Hiroyuki Shibata;Tatsuya Uzumaki;Kentaro Ifuku;Toru Komatsu et al.;Mamoru Matsubara;Tasuku Ueno et al.;加藤 博章;Yu Gabe et al.;Kazuki Kiyose et al.;Takuya Terai et al.;Takatoshi Yogo et al.;Mako Kamiya et al.;Kensuke Komatsu et al.;Eita Sasaki et al.;Yasuteru Urano et al.;Eri Kawabata et al.;Shigeki Hattori et al.;Tasuku Ueno et al.;Kenjiro Hanaoka et al.;Daisuke Nagata et al.;Suguru Kenmoku et al.;Yu Gabe et al.;Horie et al.;Kunieda et al.;Minowa et al.;Kunieda et al. - 通讯作者:
Kunieda et al.
車両運動統合制御における理論限界の明確化と達成(機械力学,計測,自動制御)
车辆综合运动控制(机械动力学、测量、自动控制)理论极限的阐明和实现
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
小野 英一;服部 義和;相澤 博昭;加藤 博章;田川 真一;丹羽 悟 - 通讯作者:
丹羽 悟
ナノディスクに挿入したP糖タンパク質CmABCB1のATPase活性に対する脂質成分の影響
脂质成分对插入纳米圆盘的 P-糖蛋白 CmABCB1 ATP 酶活性的影响
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
陳 月;潘 東青;加藤 博章 - 通讯作者:
加藤 博章
A General Synthesis of N-Reverse-Prenyl Indoles
N-反异戊二烯吲哚的一般合成
- DOI:
- 发表时间:
2004 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Kashiwayama;Y.;Tsugumi Nakanishi;Takao Hibi;Hiroyuki Shibata;Tatsuya Uzumaki;Kentaro Ifuku;Toru Komatsu et al.;Mamoru Matsubara;Tasuku Ueno et al.;加藤 博章;Yu Gabe et al.;Kazuki Kiyose et al.;Takuya Terai et al.;Takatoshi Yogo et al.;Mako Kamiya et al.;Kensuke Komatsu et al.;Eita Sasaki et al.;Yasuteru Urano et al.;Eri Kawabata et al.;Shigeki Hattori et al.;Tasuku Ueno et al.;Kenjiro Hanaoka et al.;Daisuke Nagata et al.;Suguru Kenmoku et al.;Yu Gabe et al.;Horie et al.;Kunieda et al.;Minowa et al.;Kunieda et al.;Minowa et al.;K.Yoshizawa;K.Yoshizawa;K.Yoshizawa;W.I.Li;Kubota et al.;T.Shioiri;F.Yokokawa - 通讯作者:
F.Yokokawa
多剤排出トランスポーターCmABCB1と基質アナログの結晶構造解析
多药外排转运蛋白 CmABCB1 和底物类似物的晶体结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
水沼 諒;小田島 圭;三和 空知;潘 東青;瀧川 紘;中津 亨;高須 清誠;加藤 博章 - 通讯作者:
加藤 博章
加藤 博章的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('加藤 博章', 18)}}的其他基金
化学的捕捉による多剤排出輸送体の多様な動的基質認識メカニズムの分子構造基盤
化学捕获多药外排转运蛋白多种动态底物识别机制的分子结构基础
- 批准号:
24K01637 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
国際緊急援助活動と日本外交―1987―1993
国际紧急救援活动与日本外交 - 1987-1993
- 批准号:
15J02529 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
糖鎖修飾によるタンパク質構造安定化機構の構造生物学的研究
糖基化蛋白质结构稳定机制的结构生物学研究
- 批准号:
17046008 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
X線解析を目指した多剤耐性ポンプMDR1の大量発現系の構築と結晶化
用于X射线分析的多药耐药泵MDR1大规模表达系统的构建和结晶
- 批准号:
16659012 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
ゲンジボタル・ルシフェラーゼ反応中間体アナログ複合体のX線結晶構造解析
源氏萤火虫荧光素酶反应中间体类似物复合物的X射线晶体结构分析
- 批准号:
13024275 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
糖鎖が構造形成におよぼす要因の解析と膜タンパク質結晶化への応用
影响糖链结构形成的因素分析及其在膜蛋白结晶中的应用
- 批准号:
13033044 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ゲンジボタル・ルシフェラーゼ反応中間体アナログ複合体のX線結晶構造解析
源氏萤火虫荧光素酶反应中间体类似物复合物的X射线晶体结构分析
- 批准号:
12045269 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
膜タンパク質結晶化の支援法の開発-ABCタンパク質を中心に
膜蛋白结晶支持方法的开发——以ABC蛋白为中心
- 批准号:
11169222 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
X線結晶解析とタンパク質工学的方法によるアスパラギン合成酵素の活性中心の決定
利用 X 射线晶体学和蛋白质工程方法测定天冬酰胺合酶的活性中心
- 批准号:
08660108 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
合成酵素によるATPの基質活性化機構-アスパラギン合成酵素のX線結晶解析
合成酶的 ATP 底物激活机制 - 天冬酰胺合成酶的 X 射线晶体分析
- 批准号:
07660110 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
相似海外基金
Development of chemicals that control the glutathione metabolism and oxidative stress and their use for chemical biology
控制谷胱甘肽代谢和氧化应激的化学品的开发及其在化学生物学中的应用
- 批准号:
19310143 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Time-resolved X-ray crystallographic studies of enzyme reaction
酶反应的时间分辨 X 射线晶体学研究
- 批准号:
11660115 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
アミド結合の形成を触媒するリガーゼ酵素の立体構造と反応の制御
催化酰胺键形成的连接酶的三维结构和反应的控制
- 批准号:
08272211 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
アミド結合の形成を触媒するリガーゼ酵素の立体構造と反応の制御
催化酰胺键形成的连接酶的三维结构和反应的控制
- 批准号:
08272211 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
合成酵素によるATPの基質活性化機構-アスパラギン合成酵素のX線結晶解析
合成酶的 ATP 底物激活机制 - 天冬酰胺合成酶的 X 射线晶体分析
- 批准号:
07660110 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)