Prevalence and comparative molecular epidemiologic analysis of enteric bacteria in south Asia and Africa

南亚和非洲肠道细菌的患病率和比较分子流行病学分析

基本信息

批准号：
19406015
负责人：
YAMASAKI Shinji
金额：
$ 10.82万
依托单位：
Osaka Prefecture University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

インド、ケニアでの主要な下痢原因菌と考えられる下痢原性大腸菌とコレラ菌について解析した。下痢症患者便をマッコンキー寒天培地で培養し得られたコロニーからボイルテンプレートを作製しReal-time PCRで下痢原性大腸菌の病原因子を網羅的に解析した。インドでは、ipaH遺伝子陽性菌(腸管組織侵入性大腸菌)が最も陽性率が高く、次にeaeA遺伝子陽性菌(腸管病原性大腸菌)の順であったが、ケニアではelt遺伝子陽性菌(腸管毒素原生大腸菌)の陽性率が最も高く、次にaagR遺伝子陽性菌(腸管凝集性大腸菌)であった。我が国で陽性率の高いcdt遺伝子陽性大腸菌がインドやケニアではあまり検出されなかった。一方、コレラ菌に関しては、バングラデシュで見つかったハイブリッド型O1コレラ菌(エルトールバリアント)はインドでは1990年に既に分離されており1995年以降分離されたO1コレラ菌は全てハイブリッド型(エルトールバリアント)であることが明らかとなった。ケニアでのコレラの流行で分離されたコレラ菌もエルトールバリアントであり、エルトールバリアントがアフリカ、ケニアでも広く流行に関わっていることが明らかとなった。

我们分析了致腹泻大肠杆菌和霍乱弧菌，它们被认为是印度和肯尼亚腹泻的主要原因。以腹泻患者粪便在麦康凯琼脂上培养菌落制备煮沸模板，采用实时荧光定量PCR对致泻大肠埃希菌的致病因素进行综合分析。在印度，ipaH基因阳性菌（肠道组织侵袭性大肠杆菌）的阳性率最高，其次是eaeA基因阳性菌（肠致病性大肠杆菌），但在肯尼亚，elt基因阳性菌（产肠毒素大肠杆菌）则为阳性。阳性率最高的是大肠杆菌，其次是aagR基因阳性菌（肠聚集性大肠杆菌）。 CDT基因阳性大肠杆菌在日本的阳性率很高，但在印度和肯尼亚却很少检测到。另一方面，关于霍乱弧菌，在孟加拉国发现的杂交型O1型霍乱弧菌（El Tor变种）已于1990年在印度分离出来，并且自1995年以来分离出的所有O1型霍乱弧菌均为杂交型（El Tor变种）。很清楚肯尼亚霍乱暴发期间分离出的霍乱弧菌也是El Tor变种，并且已经明确El Tor变种也广泛参与非洲和肯尼亚的流行病。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Genetic diversity of cytolethal distending toxin (CDT) phage genome in Cdt-I-producing Escherichia coli.

产 Cdt-I 大肠杆菌中细胞致死膨胀毒素 (CDT) 噬菌体基因组的遗传多样性。

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
A. Hinenoya;M. Asakura;A. Nagita;N. Sugimoto;T. Tsukamoto;Shah M. Faruque;G.B. Nair;T. Ramamurthy;S. Yamasaki
通讯作者：
S. Yamasaki

S. Yamasaki. The 6th Annual Meeting Showa International Symposium for Life Sciences, Current Topics of Infectious Diseases in Japan and Asia「Molecular epidemiology of Vibrio cholerae and Campylobacters isolated in Asian countries」September 19th 2009, Show

S. Yamasaki，第六届昭和国际生命科学研讨会，日本和亚洲传染病的当前主题“亚洲国家分离的霍乱弧菌和弯曲杆菌的分子流行病学”，2009 年 9 月 19 日，展示