エピジェネティック変化からみた造血器腫瘍発がん機構の解析

从表观遗传学变化角度分析造血系统肿瘤的致癌机制

• 批准号: 06F06464
• 负责人: 松岡 雅雄
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06F06464/
• 关键词: エピジェネティック; DNAメチル化; 発がん; 白血病; マイクロアレイ

1)Methylated CpG island amplification/representative difference assay(MCA/RDA)法を用いて正常Bリンパ球と比較して慢性リンパ性白血病細胞(CLL)細胞、悪性リンパ腫細胞(diffuse large cell lymphoma)において高・低メチル化しているDNA断片を網羅的に単離したところ、低メチル化DNAが多く同定された。低メチル化が集積した領域(1p36,7p22.3,9q34,17q21,19p13.3,22q13.3)はBリンパ球で転写が亢進している部分と一致していた。この結果から転写がメチル化に影響を与えていることが示唆された。2)低メチル化が集積している領域にコードされる遺伝子群を検索したところTNF受容体ファミリークラスターが存在しており、CLL細胞株で、それらの遺伝子発現が増強されていることをRT-PCRで確認した。その中でBリンパ球の増殖に関連していることが予想される遺伝子に関してノックダウンの実験を行ったが、増殖に関して変化は認められなかった。3)Bリンパ球系の腫瘍細胞で同様の低メチル化パターンが認められたことから細胞特異的な転写様式がメチル化に影響を与えていることが示唆された。このような領域特異的な転写調節機構に関してインスレーターのようなゲノムコンポーネントの存在が考えられる。

1）采用甲基化CpG岛扩增/代表性差异测定（MCA/RDA）方法检测慢性淋巴细胞白血病（CLL）细胞和恶性淋巴瘤细胞（弥漫性大细胞淋巴瘤）与正常B淋巴细胞相比甲基化时的高低水平。 DNA片段被全面分离，鉴定出许多低甲基化的DNA。积累低甲基化的区域（1p36、7p22.3、9q34、17q21、19p13.3、22q13.3）与 B 淋巴细胞中转录增强的区域一致。该结果表明转录影响甲基化。 2）当我们搜索在甲基化累积的区域编码的基因组时，我们发现存在TNF受体家族簇，并通过PCR进行RT-确认。其中，对预测与B淋巴细胞增殖相关的基因进行了敲低实验，但没有观察到增殖方面的变化。 3）在B淋巴肿瘤细胞中观察到类似的低甲基化模式，表明细胞特异性转录模式影响甲基化。绝缘子等基因组成分的存在被认为参与了此类区域特异性转录调控机制。

项目成果

Ars Insulator Identified in Sea Urchin Possesses an Activity to Ensure the Transgene Expression in Mouse Cells.

在海胆中鉴定出的 Ars 绝缘子具有确保转基因在小鼠细胞中表达的活性。

• 发表时间: 2006
• 期刊: J Biochem 139(4)
• 作者: Zhao T;Yasunaga J-I;Satou Y;Nakao M;Takahashi M;Fujii M;Matsuoka M.;Suemori K;Shimura K.;Mitchell MS.;Yoshida M.;Hino S.;Tajima S.
• 通讯作者: Tajima S.