比較ゲノム的アプローチを用いた真核生物ヘリカーゼ様遺伝子群の体系的機能解析

使用比较基因组方法对真核解旋酶样基因进行系统功能分析

基本信息

批准号：
12206084
负责人：
浴俊彦
金额：
--
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

1.我々が出芽酵母ゲノムの解析から新規に見出したヘリカーゼ様遺伝子のうち、増殖に必須でない遺伝子(YDR332W,YDR291W,YGL064C,YHR031C,YIR002C,YLR419W,YLR247C,YKL017C,YNL218W,YOL095W)、および遺伝子産物がRNA-dependent ATPaseであることを独自に実証した増殖必須遺伝子YDL084Wの合計11個について、lexAシステムを利用した酵母two-hybrid法によって、酵母ゲノムライブラリーから相互作用を持つ蛋白質のスクリーニングを行った。解析が不可能であったYIR002Cを除く10個の遺伝子のうちで、現在までにYKL017Cがそれ自身と、YNL218Wが少なくとも5個の遺伝子産物(YNL218W,SNF1,YMR102C,TEM1など)と相互作用することなどを見出した。特にYNL218Wについては詳細な生理機能の解析を進めている。2.ゲノム配列データベースから相同性解析によってヘリカーゼ様蛋白質を網羅的に同定し、比較生物学的解析を行った結果、(1)バクテリア、古細菌と真核生物との間ではファミリー構成に明確な違いが存在すること、(2)真核生物間の配列比較から、種特異的な遺伝子群と多様化したサブファミリーが存在することを明らかにした。3.多細胞生物におけるヘリカーゼ様蛋白質群の生理機能を網羅的に解明することを目的として、遺伝子機能破壊のためのRNAi実験系の立ち上げを行った。モデルとしてYDL084Wの線虫ホモログ(C26D10.2)の機能破壊を行ったところ、胚性致死となり、種を超えて真核細胞の増殖に必須な機能を果たしていることが示唆された。現在、約120個の線虫ヘリカーゼ様遺伝子について、feeding RNAiによる解析を進めている。これまでに発生の遅延、形態異常などの興味深い表現型を示す遺伝子が存在することを確認している。

1. Among the helicase-like genes we newly discovered from analysis of the budding yeast genome, we screened for proteins with interacting interactions from the yeast genome library for a total of 11 genes (YDR332W, YDR291W, YGL064C, YHR031C, YIR002C, YLR419W, YLR247C, YKL017C, YNL218W，YOL095W）和使用Lexa系统的酵母两杂化方法进行相互作用的蛋白质。在无法分析的YIR002C以外的10个基因中，已经发现YKL017C与自身相互作用，至少有5种基因产物（YNL218W，SNF1，YMR102C，TEM1等）。特别是，正在分析YNL218W的详细生理功能。 2. We comprehensively identify helicase-like proteins by homology analysis from a genomic sequence database, and comparative biological analysis revealed (1) that there are clear differences in family composition between bacteria, archaeal bacterium and eukaryotes, and (2) sequence comparisons between eukaryotes reveal that species-specific gene groups and diversified subfamilies exist. 3。为了全面阐明多细胞生物中解旋酶样蛋白的生理功能，我们启动了一个用于基因功能破坏的RNAi实验系统。 YDL084W线虫同源物（C26D10.2）的功能被破坏为模型，结果是胚胎致死的，这表明它具有在物种跨物种的真核细胞增殖的基本功能。目前，使用喂食RNAi分析了大约120个线虫样式基因。我们已经证实，到目前为止，已经存在表现出有趣表型的基因，例如延迟发育和形态异常。