ソフトな分子間相互作用を認識できるペプチドプローブの開発と応用

识别软分子间相互作用的肽探针的开发及应用

基本信息

  • 批准号:
    16048202
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.3万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

膜上でのソフトな分子間相互作用はtwo-hybrid法や免疫沈降法などでは解析できないことが問題である。そこで本研究ではソフトな分子間相互作用を特異的に阻害できるペプチドプローブをファージディスプレイライブラリーから同定することを試みる。細胞膜に対しペプチドのファージディスプレイライブラリーを作用させて、特異的に少数のみのファージが結合する条件を実現する。そこにアゴニストなどの刺激を与えた場合に刺激を受けたタンパク質が構造変化し分子間相互作用を起こすことにより排除されたファージを得る。そしてそのファージから得られたペプチドがソフトな分子間相互作用を阻害あるいは探知できるプローブとして利用できるかどうか検証する。まずモデル実験としてはGタンパク質共役受容体と共役するGタンパク質のαサブユニットを人工的に融合させたものを発現させた細胞膜を用いた。酸添加条件で溶出したファージから8種類、アセチルコリン添加条件で溶出したファージから2種類のペプチド配列を得た。そのうち、酸添加条件で溶出したファージ1種類とアセチルコリン添加条件で溶出したファージ2種類は12残基中、同一の箇所で4残基が一致し、2残基は類縁のアミノ酸であった。そこでこれら3種のペプチド配列でもっとも相同性が高い部分の配列をもつ6量体ペプチドを化学合成しリガンド活性を示すかどうか調べた。するとこのペプチドは1μMのカルバコールの存在下でさらに受容体の活性化を20%程度促進するアロステリックリガンドとしての性質を示した
问题在于,无法使用两种杂交方法或免疫沉淀方法分析膜上的软子间相互作用。因此,在这项研究中,我们试图确定可以特异性抑制噬菌体显示库中软分子间相互作用的肽探针。在细胞膜上实现了肽库的噬菌体显示库,以达到只有少数噬菌体被特异性结合的条件。当刺激诸如激动剂之类的刺激时,刺激的蛋白质变化结构并引起分子间相互作用以获得已消除的噬菌体。然后验证是否可以将从噬菌体获得的肽用作可以抑制或检测软分子间相互作用的探针。首先,作为模型实验,使用了与G蛋白与G蛋白偶联受体的G蛋白α亚基的人为融合表示的细胞膜。在酸中添加条件下洗脱了八种类型的噬菌体,并从在乙酰胆碱添加条件下洗脱的噬菌体获得了两种类型的肽序列。其中,一种在酸性添加条件下洗脱的噬菌体和两种在乙酰胆碱添加条件下洗脱的噬菌体,四个残基在12个残基的同一位置重合,两个残基是相关的氨基酸。因此,将这三个肽序列的最同源序列的六聚体肽化学合成以确定它们是否表现出配体活性。因此,该肽表现出变构配体的特性,该配体在1μm卡巴醇存在下进一步促进受体激活约20%。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mapping of Functional Sites on the Primary Structure of the Contractile Tail Sheath Protein of Becteriophage T4 by Mutation Analysis
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S.Takeda;M.Suzuki;T.;Yamada;N.Kageyama;F.Arisaka
  • 通讯作者:
    F.Arisaka
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S.Takeda;T.Okada;M.Okamura;T.Haga;J.Tanaka;N.Minamino
  • 通讯作者:
    N.Minamino
G蛋白質共役受容体機能の解析方法
G蛋白偶联受体功能分析方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小池太吾;武田茂樹
  • 通讯作者:
    武田茂樹
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    H.Suga;S.Takeda;T.Okada;M.Okamura;T.Haga
  • 通讯作者:
    T.Haga
Crystallization and preliminary X-ray analysis of gene product 44 from becteriophage Mu
噬菌体 Mu 基因产物 44 的结晶和初步 X 射线分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Y.Kondou;D.Kitazawa;S.Takeda;E.Yamashita;M.Mizuguchi;K.Kawano;T.Tsukihara
  • 通讯作者:
    T.Tsukihara
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    2020
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    0
  • 作者:
    河村 達郎;二村 友史;SHANG Erchang ;室井 誠;JANNING Petra ;上野 雅佳;WILKE Julian ;武田 茂樹;近藤 恭光;ZIEGLER Slava ;渡辺 信元;WALDMANN Herbert;長田 裕之;椎名瞳,尾崎綾栞,多森翔馬,野崎優香,髙澤涼子,佐々木和教,石黒斉,宮城洋平,長嶋洋治,田沼靖一,大野茂男,秋本和憲
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  • 发表时间:
    2020
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    河村 達郎;二村 友史;SHANG Erchang ;室井 誠;JANNING Petra ;上野 雅佳;WILKE Julian ;武田 茂樹;近藤 恭光;ZIEGLER Slava ;渡辺 信元;WALDMANN Herbert;長田 裕之
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