ゲノム機能の次世代への継承に必要なクロマチンドメイン構造とその確立

染色质结构域结构及其建立是基因组功能遗传到下一代所必需的

• 批准号: 16045206
• 负责人: 奥村 克純
• 金额: $ 4.48万
• 依托单位: Mie University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16045206/
• 关键词: セントロメアヘテロクロマチン; エピジェネティクス; クロマチン; 複製フォーク; ヒストン修飾; 核マトリックス; 複製ファクトリー; 複製タイミング; ヘテロクロマチン; エピジェネティック; セントロメア; DNAファイバー; ES細胞; アセチル化

マウスセントロメアヘテロクロマチン領域のエピジェネティックな制御:マウスセントロメアヘテロクロマチン領域において複製フォークの進行と複製タイミング、ヒストンのエピジェネティックな動態との相関関係について解析することを目的とし、DNAメチル化阻害時のヘテロクロマチン領域における修飾ヒストンのダイナミックな変換と複製タイミング、複製フォークの進行との相関性等を解析した。通常ユークロマチンに多く存在しているtriMeK4H3,diMeK4H3はDNAメチル化を阻害することで、セントロメア周辺ヘテロクロマチン領域に局在する一方、通常ヘテロクロマチン領域に多く存在しているtriMeK9H3はDNAのメチル化阻害によりこの領域では少し減少した。また、24時間の5azadC処理によって、セントロメア周辺ヘテロクロマチンにおける修飾ヒストンの変換が起きた核はS期初期では少なく、この領域が複製するS期中期以降の核で多く見られた。これらの結果から、5-azadC処理により、セントロメア周辺ヘテロクロマチン領域のDNAのメチル化が減少することで、複製タイミングが早くなり、さらに複製フォークの進行が促進されるに伴って、その後のクロマチンアッセンブリーの際、ヒストン修飾の構成に大きな変化が起こるとが示唆された。また、分子コーミング法による複製フォークの解析法を確立した。DNA複製における核マトリックスの関与:複製タイミングがS期初期、中期、後期の特定のゲノム領域について解析した結果、それぞれの遺伝子領域に存在するMARはS期を通して核マトリックスに結合しているが、MAR以外のDNA配列は、それぞれの複製タイミングの時期にのみ核マトリックスと結合していることを明らかにした。また各種preRC複合体タンパク、複製ファクトリータンパクについても核マトリックスとの関係を明らかにし、これまでの成果とあわせて複製・転写ファクトリーが核マトリックス上で機能しているモデルを提示した。これらの成果について論文作成中である。

小鼠中心粒异染色质区域中的表观遗传控制：目的是分析副本的进展，重复的时间和组蛋白的表观遗传动力学之间的相关性，分析小鼠中央杂质染色质区域中分析动态转换和重复定时的小鼠中心染色质区域。染色质区域以及重复叉的进度之间的相关性。 Trimek4H3，通常在念珠菌素中常见的Dimek4H3，通过阻碍DNA甲基化，位于侧粒周围的异染色质区域，而Trimek9H3在异质细胞染色质区域中很常见，是DNA甲基化抑制作用略有下降。 24小时5AzADC过程在S早期的杂物染色质中转化了杂色染色质的修饰剂的核心，并且经常在S时期中间的核中发现，当该区域重复。基于这些结果，5-azADC加工降低了Centromere周围异染色质区域中DNA的甲基化，并且重复的时机更快，并且促进了重复的叉子的进展，因此当时呈现染色质组装。在病变修饰的结构中将发生重大变化。此外，通过分子组合方法对叉叉进行了分析。核基质参与DNA重复：在早期，中间和后期对特定的基因组区域进行了重复的时间，并且在每个基因区域中存在MAR在其他DNA序列中都与核基质结合。它们仅在每个重复的时机上与​​核基质结合。此外，各种PRERC复合蛋白和重复的工厂蛋白也阐明了与核基质的关系，并提出了模型，其中重复和转移工厂在核基质上起作用，以及迄今为止的结果。这些成就正在创造。

项目成果

A 210-kb segment of tandem repeats and Retroelements located between imprinted subdomains of mouse distal chromosome 7

• DOI: 10.1093/dnares/11.5.325
• 发表时间: 2004-10-31
• 期刊: DNA RESEARCH
• 影响因子: 4.1
• 作者: Shirohzu, H;Yokomine, T;Sasaki, H
• 通讯作者: Sasaki, H

Zinc transporters, ZnT5 and ZnT7, are required for the activation of alkaline phosphatases, zinc-requiring enzymes that are GPI-anchored to cytoplasmic membrane

锌转运蛋白 ZnT5 和 ZnT7 是激活碱性磷酸酶（GPI 锚定在细胞质膜上的需锌酶）所必需的

• 发表时间: 2005
• 期刊: Journal of Biological Chemistry 280巻1号
• 作者: Tomoyuki Suzuki

クロマチン・染色体実験プロトコール

染色质/染色体实验方案

• 发表时间: 2004
• 作者: M.-T.Gao et al.;押村光雄ら編
• 通讯作者: 押村光雄ら編

Applying whole-genome studies of epigenetic regulation to study human disease

• DOI: 10.1159/000091922
• 发表时间: 2006-01-01
• 期刊: CYTOGENETIC AND GENOME RESEARCH
• 影响因子: 1.7
• 作者: Lieb, J. D.;Beck, S.;Greally, J. M.
• 通讯作者: Greally, J. M.

Structure and evolution of the mouse pregnancy-specific glycoprotein (Psg) gene locus

小鼠妊娠特异性糖蛋白（Psg）基因座的结构和进化

• 发表时间: 2005
• 期刊: BMC Genomics 6巻4号(印刷中)
• 作者: Matsumoto R.;Ito Y.;Shin-ichiro Takebayashi;Andrew S McLellan
• 通讯作者: Andrew S McLellan