ヒト・ゲノムの機能的ドメイン構成の解析ならびにFISHの技術開発

人类基因组功能域结构分析及FISH技术发展

• 批准号: 10168211
• 负责人: 奥村 克純
• 金额: $ 1.98万
• 依托单位: Mie University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10168211/
• 关键词: FISH; Chromatin structure; SNRPN; Genomic imprinting; Gene mapping

ヒト・ゲノム上に存在する何万もの遺伝子は、ゲノム上で均一に配置されているのではなく、それぞれの機能に応じてクラスターを形成するなど、機能的ドメインを形成し制御を受けていることは明らかである。本研究では、ゲノム全体をDNA複製やダイナミックなゲノムの伸縮構造に基づく機能的、構造的ドメインによる構成体として捉え、これらのドメイン構成を明らかにするとともに、細胞核内のゲノムの配置や挙動を解析することにより、ゲノムの構成を総合的に理解し、ゲノムの機能研究として、生命現象の基盤である遺伝子の精妙な機能発現の理解に資することを目標とした。まず、DNA複製前の核内のゲノムのパッケージング状態を、halo核標本に対してFISHを行うことにより解析し、インプリント遺伝子SNRPNでは発現している父親由来アレルがコンパクトにパッケージングされていることを示した。また、イントロンプローブやゲノムクローンをプローブとして核内RNAの検出を試み、インプリント遺伝子の単一アレルでの発現を確認した。この方法により、非同調的複製パターンを示すDiGeorge領域のクローンを検討したところ、biallelicに発現していることを確認した。さらに、複製鎖の蛍光検出と特定ゲノムに対するファイバーFISH法を組み合わせることで、複製部位を個々の細胞で確認する方法を開発した。本年度は特に、複製鎖やFISHが安定なシグナルを与える方法の改良を行い、両者の同時検出にも成功した。また、セントロメアへテロクロマチン領域の低アセチル化状態の維持機構として、別の場所で脱アセチル化されたヒストンが、セントロメア領域に輸送されるという機構が存在する可能性を提示した。さらに、各種遺伝子、トランスジーンのマッピング、ゲノムの整列化を行った。

人类基因组上成千上万的基因并不均匀地放在基因组上，而是形成功能域，例如根据每个功能形成簇。在这项研究中，整个基因组被认为是基于DNA重复和动态基因组弹性结构的功能和结构结构域的组成，并且这些结构域的构型被阐明并分析了细胞核中基因组的排列和行为。基因组的结构，并为基因组功能研究做出贡献，有助于对基因的理解，这是生命现象的基础。首先，通过将鱼类对晕核标本进行鱼类的包装状态进行分析，并在烙印基因SNRPN中表达的源自父亲的Allel衍生的Allel。此外，我们试图用内部探针和基因组克隆作为探针检测核RNA，并确认了单个ALLEL中IMPHINT基因的表达。该方法检查了Digeorge区域的克隆，该克隆表明非同步重复模式，并确认其在双质体中表示。此外，通过将重复链的荧光检测和针对特定基因组的纤维鱼方法结合在一起，使用单个细胞开发了检查复制位点的方法。特别是在这个财政年度中，重复的链条和给出稳定信号的方法得到了改善，并在同一时间成功检测到了这两种方法。他还提出了一种机制，即在另一个位置去除乙酰化的Histon被运送到Centromere区域，作为恐怖症区域的一种心理机制到Terrocomatin区域。另外，进行了各种基因，转基因映射和基因组比对。

项目成果

Sachiko Kitanaka: "Inactivating Mutations in the 25-Hydroxyvitamin D3 1α-Hydroxylase gene in Patients with Pseudovitamin D-Deficiency Rickets" New England Journal of Medicine. 338巻. 653-661 (1998)

Sachiko Kitanaka：“假性维生素 D 缺乏性佝偻病患者 25-羟基维生素 D3 1α-羟化酶基因的失活突变”《新英格兰医学杂志》338. 653-661 (1998)。

Katsuzumi Okumura: "Chromosomal Localization of Human DNA-binding Nuclear Protein(NP220)to 2P13.1-p13.2 by Fluorescence in situ Hybridization" Bioscience,Biotechnology and Biochemistry. 62巻. 1640-1642 (1998)

Katsuzumi Okumura：“通过荧光原位杂交将人类 DNA 结合核蛋白 (NP220) 染色体定位到 2P13.1-p13.2”《生物科学、生物技术和生物化学》62。1640-1642 (1998)。

Masato Tsurudome: "Primary Structure of the Light Chain of FRP-1/CD98/4F2 Predicts a Protein with 11 Transmembrane Domains" Journal of Immunology. (印刷中).

Masato Tsurudome：“FRP-1/CD98/4F2 轻链的一级结构预测具有 11 个跨膜结构域的蛋白质”《免疫学杂志》（正在出版）。

Yasushi Taniguchi: "Nucleotide Sequence of the Ring3 Gene in the Class II Region of the Mouse MHC and Its Aundant Expression in Testicular Germ Cells" Genomics. 51巻. 114-123 (1998)

Yasushi Taniguchi：“小鼠 MHC II 类区域中 Ring3 基因的核苷酸序列及其在睾丸生殖细胞中的丰富表达”基因组学。 51. 114-123 (1998)

Shin Ogata: "Apoptosis Induced by Niacin-related Compounds in HL-60 Cells" Bioscience,Biotechnology and Biochemistry. 62巻. 2351-2356 (1998)

Shin Ogata：“烟酸相关化合物在 HL-60 细胞中诱导细胞凋亡”《生物科学、生物技术和生物化学》62. 2351-2356 (1998)。