RNAエディティングによる遺伝情報の変換システム―葉緑体ゲノムでの網羅的解析

利用RNA编辑的遗传信息转换系统-叶绿体基因组的综合分析

• 批准号: 14011101
• 负责人: 杉浦 昌弘
• 金额: $ 3.9万
• 依托单位: Nagoya City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14011101/
• 关键词: RNAエディティング; タバコ; 葉緑体; エンドウ; in vitro系; mRNA; シス配列; トランス因子

葉緑体はその発生プログラムにより原色素体(種子)からエチオプラスト(芽生え)、葉緑体(葉)、クロモプラスト(果実)などへと形態的・機能的に大きく変化する。高等植物の葉緑体ゲノムからの転写産物は、RNAエディティング(C→U)によりDNAの一次情報が一部変換するため、ゲノム情報の正確な解読にはRNAエディティングの網羅的知見が必須である。1)RNAエディティング部位の網羅的同定組織的なRNAエディティング部位の探索のため、タンパク質コード領域を集中して調べる必要がある。新たに2ヶ所の部位を発見した。従って,タバコでは合計34ヶ所のエディティング部位を同定した。ついで、エンドウ葉緑体でもタンパク質コード領域の調査を開始し、21ヶ所の部位を同定した。2)RNAエディティングのシス配列とトランス因子の同定タバコ単離葉緑体より開発したin vitro RNAエディティング系を更に改良し、タバコ葉緑体psbE RNAとpetB RNAのシス配列をエディティング部位上流-20から-6と同定し、psbEのトランス因子は56kDaタンパク質と同定し,petBのものは70kDaタンパク質と同定した。

叶绿体根据其发育程序经历主要的形态和功能变化，从原生质体（种子）到黄质体（出芽）、叶绿体（叶子）和有色体（果实）。高等植物叶绿体基因组的转录本通过 RNA 编辑（C→U）对原始 DNA 信息进行部分转换，因此全面了解 RNA 编辑对于准确破译基因组信息至关重要。 1）全面鉴定RNA编辑位点 为了系统地寻找RNA编辑位点，需要重点关注蛋白质编码区域。发现了两个新部件。因此，在烟草中总共鉴定出34个编辑位点。接下来，他们开始研究豌豆叶绿体中的蛋白质编码区，并确定了 21 个位点。 2) 用于RNA编辑的顺式序列和反式因子的鉴定我们进一步改进了从分离的烟草叶绿体开发的体外RNA编辑系统，鉴定了编辑位点-20至-6上游的烟草叶绿体psbE RNA和petB RNA的顺式序列。 psbE的反式因子被鉴定为56kDa蛋白质，petB的反式因子被鉴定为70kDa蛋白质。

项目成果

Hasegawa, K.: "In vitro analysis of transcription initiation and termination from the Lhcb1 gene family In Nicotiana sylvestris"Plant Journal. 33. 1063-1072 (2003)

Hasekawa, K.：“烟草 Lhcb1 基因家族转录起始和终止的体外分析”《植物杂志》。

Mathieu, O.: "5S rRNA genes expression is not inhibited by DNA methylation in Arabidopsis"Plant Journal. 29. 313-323 (2002)

Mathieu, O.：“拟南芥中 5S rRNA 基因的表达不受 DNA 甲基化的抑制”《植物杂志》。

Hasegawa, K.: "Organization and transcription of the gene family encoding chlorophyll a/b-binding proteins in Nicotiana sylvestris"Gene. 289. 161-168 (2002)

长谷川，K.：“在烟草中编码叶绿素 a/b 结合蛋白的基因家族的组织和转录”基因。

Sasaki, T.: "Identification of RNA editing sites in chloroplasts transcripts from the maternal and paternal progenitors of tobacco (Nicotiana tabacum)"Mol. Biol. Evol.. (2003)

Sasaki, T.：“烟草 (Nicotiana tabacum) 母本和父本祖先叶绿体转录本中 RNA 编辑位点的鉴定”Mol。

Plader, W.: "The Shine-Dalgarno-like sequence is a negative regulatory element for translation of tobacco chloroplast rps2 mRNA"Plant Journal. (2003)

Plader, W.：“Shine-Dalgarno 样序列是烟草叶绿体 rps2 mRNA 翻译的负调控元件”《植物杂志》。