tsRNA的末端修饰及其在遗传信息传递中作用和机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91740103
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    100.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0503.细胞感应与环境生物物理
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Our previous study showed that a noncoding small RNA, termed tsRNA (transfer RNA-derived small RNAs), mediates intergenerational inheritance of acquired metabolic disorders from obese father, which was published in Science, highlighted by Science and other journals, and awarded “Top Ten Advances in Science and Technology of China in 2016”. Our previous study showed that tsRNA contains many kinds of modifications, and modification profile was altered in sperm tsRNAs of mice fed high-fat diet. This project aims to investigate the 5’ and 3’ terminal modification of tsRNA and the related biological functions. First, we will analyze tsRNA terminal modifications by LC/MS/MS and other methods, and identify the corresponding exogenous demodification enzymes. According to the identified terminal modifications, we will design a strategy to construct libraries for high-throughput sequencing to quantify the terminal modificatins of tsRNA and reveal the real major tsRNA profiles. Furthermore, we will investigate the effect of terminal modifications on the stability of tsRNA, and the roles and underlying mechanisms of sperm tsRNA terminal modifications in intergenerational inheritance of acquired metabolic disorders from obese father. This project will reveal the major terminal modification of tsRNA and tsRNA profiles, discover the important biological functions of tsRNA terminal modificaions, and potentially elucidate the key mechanisms in intergenerational inheritance of acquired metabolic disorders.
申请人前期发现非编码小核酸tsRNA介导了肥胖父代导致子代代谢紊乱,以共同通讯作者发表在Science,并获Science等多个期刊专评,研究成果入选“中国科学十大进展”等。前期发现tsRNA存在多种修饰并且高脂饮食可导致tsRNA修饰谱发生变化。本项目拟深入研究tsRNA 5’和3’末端修饰及其生物学功能。首先通过质谱等技术分析鉴定主要的末端修饰,寻找和验证相应的外源性去修饰酶。根据tsRNA的末端修饰,设计相应的建库策略并进行高通量测序,以揭示tsRNA末端修饰的比例和更完整的tsRNA表达谱。同时探索tsRNA的末端修饰是否影响其稳定性,并深入研究其末端修饰在肥胖小鼠精子tsRNA导致子代代谢紊乱中的作用和机制。本项目的顺利实施,将揭示tsRNA的末端修饰和tsRNA比较完整的表达谱,并发现tsRNA末端修饰的重要生物学功能,为阐明代谢性疾病获得性性状跨代遗传的机理奠定重要基础。

结项摘要

非编码小RNA tsRNA介导了肥胖父代导致子代代谢紊乱,但精子等组织的tsRNA的末端是否存在修饰,该修饰是否通过影响RNA稳定性并有重要的生物学作用目前尚不清楚。本项目以正常饮食小鼠和高脂饮食小鼠精子等组织的tsRNA为研究对象,采用β-内消去反应来初步判断tsRNA的3’末端存在修饰,并发现一些tsRNA等小RNA存在特殊的3’末端修饰并且不能被常规的高通量测序建库方法检测到。通过质谱分析鉴定了小RNA末端存在的特殊修饰,并通过相应的去修饰酶去除tsRNA末端修饰,建立3’末端有该特殊修饰的小RNA的高通量测序方法。揭示了多种组织和细胞中3’末端有该特殊修饰的小RNA和3’末端为羟基的小RNA的表达谱。建立了3’末端有该特殊修饰的小RNA的qPCR定量检测方法,并进行了Northern验证。发现了该3’末端有该特殊修饰的小RNA产生的关键分子机制。合作研究发现Dnmt2通过影响精子非编码小RNA的甲基化修饰介导了父代获得性代谢性状的代际传递。本研究项目对于后续深入了解小RNA的修饰及其生物学功能有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(3)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Short-term tamoxifen treatment has long-term effects on metabolism in high-fat diet-fed mice with involvement of Nmnat2 in POMC neurons
短期他莫昔芬治疗对高脂饮食喂养小鼠的代谢具有长期影响,且 POMC 神经元中的 Nmnat2 参与其中
  • DOI:
    10.1002/1873-3468.13240
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    FEBS Letters
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Zhiyuan Liu;Yalan Cheng;Yi Luan;Wuling Zhong;Hejin Lai;Hui Wang;Huimin Yu;Yale Yang;Ning Feng;Feixiang Yuan;Rui Huang;Zhishui He;Fang Zhang;Menghong Yan;Hao Yin;Feifan Guo;Qiwei Zhai
  • 通讯作者:
    Qiwei Zhai
Sarm1 Gene Deficiency Attenuates Diabetic Peripheral Neuropathy in Mice
Sarm1 基因缺陷可减轻小鼠糖尿病周围神经病变
  • DOI:
    10.2337/db18-1233
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Diabetes
  • 影响因子:
    7.7
  • 作者:
    Yalan Cheng;Jun Liu;Yi Luan;Zhiyuan Liu;Hejin Lai;Wuling Zhong;Yale Yang;Huimin Yu;Ning Feng;Hui Wang;Rui Huang;Zhishui He;Menghong Yan;Fang Zhang;Yan Gang Sun;Hao Ying;Feifan Guo;Qiwei Zhai
  • 通讯作者:
    Qiwei Zhai

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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