トウモロコシ性決定因子SILKLESS1クローニングの試み

尝试克隆玉米性别决定子SILKLESS1

基本信息

  • 批准号:
    10158206
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.24万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 财政年份:
    1998
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1998 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

TS2タンパク質のアミノ末端の一部の領域を欠失させたタンパク質をbaitとして用いて1.97x10^6の酵母細胞をスクリーニングし、最終的に16個をポジティブクローンを得た。これらのポジティブクローンの中にはTS2と高い相同性を示すもの、ラットのUDP-N-acetyl-glucosamine-peptide N-acetylglucosamirniyl trferase(O-GlcNActransferase)のタンパク質認識部位であるteteratricopeptide repeat(TPR)と高い相同性を示すもの、枯草菌のCLPproteaseのproteolytic subunit(CLPP)と高い相同性を示すものなどが含まれていた。現在、最終的に残った16個のクローンについて既知の性決定に関与する遺伝子座の近傍にマップされるかを調べるためにトウモロコシの染色体上での位置を決定している。最終的に得られた16個についてはTS2タンパク質との相互作用をより詳細に検討する必要があるが、これら16個をtasselseed2 interacting proteins(TIPs)の候補と考え、今後の解析に供する考えである。TS2と高い相同性を示すcDNAが得られた事は、TS2タンパク質がこのcDNAにコードされるタンパク質とへテロダイマー(あるいはへテロテトラマー)を形成する可能性を示唆するものと考えている。また、今回得られたCLPP相同タンパク質がTS2タンパク質を分解している可能性もあるのではないかと考えている。また、O-GlcNAc transferaseと高い相同性を示すクローンが得られたことはTS2タンパク質の活性が糖鎖修飾によって制御されていることを示しているのかもしれない。
1.97x10^6酵母细胞被筛选为诱饵,该诱饵失去了TS2蛋白的氨基末端的某些区域,最后16个阳性克隆获得了阳性克隆。这些阳性克隆是高度同源的,大鼠UDP-N-乙酰葡萄糖葡萄糖肽N-乙酰糖糖糖酶(O-GlCNACTRASSFRASE酶)trferase trferase ertrricopeptide重复酶重复酶重复(TPR)和高IT包含同源物,并且表现出高度同源性,蛋白质亚基(Clpp)(Clpp)(Clpp)(Clpp) clpprotease的clpprotease。当前,剩余的16个克隆的位置是在染色体上玉米染色体上确定的,以找出是否将其映射到已知性别涉及的基因附近。对于最后的16号,有必要更详细地考虑与TS2蛋白的相互作用,但是这16个被认为是tasselseed2相互作用蛋白(TIPS)的候选者,并旨在将来分析。获得的cDNA表明TS2和高同源物,表明TS2蛋白可能形成在该cDNA中编码的恐怖打击术(或恐怖分子)。我们还认为,这次获得的CLPP固定蛋白可能已将TS2蛋白拆解。另外,获得具有O-GLCNAC转移酶高的同源性的克隆可能表明TS2蛋白的活性受糖链修饰的控制。

项目成果

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    0
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  • 通讯作者:
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