植物ケツムDNA上に存在するtRNAと相同性を持つ反復配列の解析

分析与植物 DNA 上 tRNA 具有同源性的重复序列

基本信息

批准号：
04272208
负责人：
吉岡泰
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1992
资助国家：
日本
起止时间：
1992 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-04272208/
关键词：
SINE 植物染色体 tRNA 反復配列

项目摘要

本研究代表者らがタバコの染色体DNAよりクローニングした反復配列はtRNA相同領域、tRNA非相同領域、TTGの繰返しという3つの領域からなっていた。この構造は、これまでに動物で見いだされているSINEの構造と極めて類似しており、これからこの反復配列が植物におけるSINEであることが明らかとなった。本研究代表者らはこのSINEをTS配列と名付けた。また、tRNAにおいて保存されている塩基が、TS配列のtRNA相同領域にも保存されていたことより、TS配列がtRNAを起源としていることが強く示唆された。この結果より、tRNAと相同性を持つSINEが動物のみならず、植物にも存在することが示された。TS配列はtRNA相同領域内にRNAポリメラーゼIIIで転写されるプロモータの共通配列と類似の配列を含んでいたが、実際TS配列はin vitroにおいてRNAポリメラーゼIIIによって転写された。TS配列は調べた限りのナス科植物の染色体上に存在していたが、さらにナス科以外の植物について調べたところ、TS配列はヒルガオ科の植物であるアサガオの染色体DNA上にも存在していた。このことから、TS配列はナス科、ヒルガオ科が属する管状花植物に広く存在するものと考えられた。次にデータベースを検索したところ、すでに報告されているいくつかのナス科植物の塩基配列中にTS配列が含まれていた。これらのTS配列の塩基配列と本研究代表者らがタバコ染色体よりクローニングしたTS配列の塩基配列とを比較したところ、TS配列は少なくとも2つのサブグループにわけられた。それぞれのサブグループの塩基配列のdivergencyが異なることから、それぞれのサブグループはそれぞれ異なる時期に増幅したと考えられる。さらに、一方のサブグループはtRNA相同領域を欠失しているという特徴をもっていた。

该研究代表从香烟染色体DNA克隆的重复阵列由三个区域组成：tRNA的同源区域，tRNA非共享区域和TTG重复。这种结构与到目前为止在动物中发现的正弦结构非常相似，并且已经揭示了这种重复的序列在植物中是正弦的。该研究代表将这个正弦序列命名为序列。还提出了TS序列起源于tRNA，因为存储在tRNA中的碱基也保留在tRNA区域的TS序列中。从这个结果可以表明，带有tRNA的正弦不仅在动物中，而且在植物中。 TS序列包含与TRNA区域中RNA聚合酶III中传递的启动子的公共阵列相似的阵列，但TS序列实际上是由RNA聚合酶III在体外传递的。 TS阵列在茄子的染色体上存在，但是在检查了茄子以外的其他植物时，TS序列也存在于Asagao的染色体DNA上。由此，TS序列被认为是茄子家族和家族所属的管状花植物中广泛存在的。接下来，当我搜索数据库时，TS序列已包含在已经报道的几个茄子的基础序列中。当将这些TS序列与TS序列的基本序列与从香烟染色体克隆的TS序列的基本序列进行比较时，将TS序列分为至少两个亚组。由于每个子组的基本序列的差异是不同的，因此每个子组被认为在不同时间被扩增。此外，子组具有丢失trNA区域的特征。