バイオインフォマティクス解析を応用した新規ヒト生理活性ペプチドの同定

利用生物信息学分析鉴定新型人类生理活性肽

基本信息

批准号：
18018011
负责人：
七里眞義
金额：
$ 6.46万
依托单位：
Tokyo Medical and Dental University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18018011/
关键词：
バイオインフォマティックス全長濃縮ヒトcDNAライブラリー分泌性蛋白新規生理活性ペプチドサリューシン-β バイオインフォマティクス In silico ペプチド探索生理活性因子ペプチドライブラリー

项目摘要

全長濃縮ヒトcDNAライブラリーのデータベースを用いてバイオインフォマティックス解析を行い、構造上分泌性蛋白をコードし小分子量ペプチドにプロセシングされると推測される遺伝子配列のヒト組織での発現を確認して、それら遺伝子由来のペプチドを化学合成して培養細胞における細胞内応答をスクリーニングすることによって新規生理活性ペプチドを同定する新手法を考案した。本研究課題においてはその探索プロセスに改良を加えながら、同定したペプチドの生理活性、物理化学的性状の解明も行うことにより、本手法を確立する努力を継続しつつ、新規生理活性ペプチドの探索を行った。その結果、本手法によって始めて同定したペプチドであるサリューシン-βがきわめて特徴的な物理化学的特徴を有するために、古典的な生理活性ペプチドの同定法や最近の主流とも言える手法であったオーファン受容体を用いた同定法で発見することは困難であったことなどの事実が明らかになりつつある。このような手法で発見した新規ペプチドが、ヒトの体液中に存在する内因性ペプチドと全く同一の分子存在様式であるかどうかなど、検討しなければならない課題もあるが、逆に、内因性ペプチドであるかどうかに関わらず、強力な生理作用と安全性が確認できればペプチド医薬・ペプチド抗体医薬への直接の応用が可能であるため、そのような観点からの新規ペプチド探索法の完成を試みている。実際、ペプチドの有用な作用による医薬品への応用に加えて、ペプチド測定により新たな診断法を提供する技術などが開発され、2件の特許出願に至った。

完整的长度浓缩的人cDNA文库数据库用于分析biogoginotic分析，结构分泌的蛋白质，并以遗传序列确认人类组织中的表达，该序列被认为是在小分子量肽中处理的。通过化学合成这些遗传肽并筛选培养细胞中的细胞内反应来鉴定新的生理肽。在这项研究问题中，通过进行鉴定肽的生理活性和生理活性来改善探索过程，在继续努力建立此方法的同时，寻找新的天然活性肽。结果，通过这种方法鉴定出的第一个肽Salyu Shin-β具有非常独特的物理和化学特征，它是经典生理肽的鉴定方法和最近的主流方法。使用受体的相同方法发现它正在变得清晰。有一些问题需要考虑在这种方法中发现的新肽是否与人体流体中的内源性肽完全相同，但相反，内源性肽是否是，无论是否是，是否是。可以确认强大的生理作用和安全性，可以直接应用于肽药物和肽抗体药物，因此我们将尝试从这种观点完成新的肽搜索方法。实际上，除了将肽的有用作用应用于药物外，还通过肽测量开发了提供新的诊断方法的技术，从而导致了两项专利申请。