核タンパク質による十字型DNA構造の特異的識別・結合の様式および同構造解消の機構

核蛋白对十字形DNA结构的特异性识别和结合方式及其溶解机制

基本信息

  • 批准号:
    03259214
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    1990
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1990 至 1991
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

1.HMG1,HMG2の一次構造上のDNA結合部位の同定:HMG1タンパク質を化学および酵素分解後、ペプチドを分離し、DNA結合能を測定した。この結果と一次構造、および最近見いだされたHMGタンパク質類似のDNA結合ドメインをもつタンパク質との比較により、結合に必要な2つの領域をほぼ特定できた。2.HMG1とHMG2のDNAへの親和性の差異の検索:前年度の研究によりゲルシフト・アッセイでHMG1,2の間にDNA結合能の大きな差異が認められた。この差異がリン酸化に由来するか否かを検索する為、脱リン酸化処理を行い、DNA結合能を比較したところ変化は認められなかった。他の結果と併せて考えると、DNA結合能の差異は両タンパク質の修飾によるのではなく、一次構造に起因するものと推定される。3.DNAとHMG2複合体の立体構造:HMG2タンパク質の上記2つの結合領域のうち、ドメインAをコ-ドするcDNAの塩基配列をPーガラクトシダ-ゼのcDNAの下流への連結し、P_Rプロモ-タ-をもつプラスミドへ挿入、大腸菌ヘトランスフォ-ムした。誘導によって高発現した融合タンパク質を分離精製後、ドメインAを酵素分解により切出し、分離精製する系を確立できた。今後、NMRおよびX線結晶回析を行い、DNA結合領域の立体構造解析を進める。4.HMG2遺伝子構造と発現制御領域の検索:ヒトHMG2遺伝子の単離にはじめて成功し、全塩基配列を決定した。この遺伝子の発現に必要な上流配列を特定し、その領域に結合する核内因子の存在を認め、結合配列を決定した。その発現促進の機構を検索中である。
1。鉴定HMG1和HMG2的一级结构上的DNA结合位点:在HMG1蛋白的化学和酶促降解后,分离了肽并测量了DNA结合能力。与新发现的HMG蛋白样DNA结合结构域相比,该结果与蛋白质和蛋白质相比,使我们能够大致识别结合所需的两个区域。 2。在HMG1和HMG2之间寻找DNA亲和力的差异:上一年的研究表明,HMG1和2之间的DNA结合能力在凝胶移位分析中存在显着差异。为了搜索是否从磷酸化中得出这种差异,进行了去磷酸化,并且在比较DNA结合能力时,未观察到变化。考虑到这与其他结果结合使用,据推测,DNA结合能力的差异不是由于两种蛋白质的修饰,而是由于主要结构的修饰。 3。DNA和HMG2复合物的结构:在HMG2蛋白的两个结合区域中,编码结构域A的cDNA的碱基序列被插入了pgalactosidase cDNA的下游,并插入载有P_R启动子的质粒中,并转化为E. coli。通过诱导分离和纯化高表达的融合蛋白后,通过酶促降解切除结构域A,并建立了一个系统以分离和纯化蛋白质。将来,将进行NMR和X射线晶体衍射,以进一步分析DNA结合区域的三维结构。 4。搜索HMG2基因结构和表达控制区域:人类HMG2基因首先成功,并确定了整个核苷酸序列。鉴定了表达该基因所需的上游序列,并观察到与该区域结合的核因子的存在,并确定结合序列。正在搜索促进其表达的机制。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Hitoshi Shirakawa and michiteru Yoshida: "Structure of a gene coding for human HMG2 protein." Journal of Biological Chemistry. 267. (1992)
Hitoshi Shirakawa 和 Michiteru Yoshida:“编码人类 HMG2 蛋白的基因结构。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Fuminori Yamazaki,Hitoshi Shirakawa and Michiteru Yoshida: "Differential expression of HMG1 and HMG2 proteins during cell cycle in rat fibroblast." Journal of Biological Chemistry.
Fuminori Yamazaki、Hitoshi Shirakawa 和 Michiteru Yoshida:“大鼠成纤维细胞细胞周期中 HMG1 和 HMG2 蛋白的差异表达。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Shigemi Aizawa,Hiroaki Nishino,Hitoshi Shirakawa and Michiteru Yoshida: "Stimulation of transient expression of transfected genes by coーtransfection of HMG1 protein cDNA." Molecular and cellular Biology.
Shigemi Aizawa、Hiroaki Nishino、Hitoshi Shirakawa 和 Michiteru Yoshida:“通过共转染 HMG1 蛋白 cDNA 刺激转染基因的瞬时表达”。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Akiko Yamamoto,Shou Waga,Hitoshi Shirakawa and Michiteru Yoshida: "Preferential binding of HMG1 protein to the supercoiled DNA." Biochemistry.
Akiko Yamamoto、Shou Waga、Hitoshi Shirakawa 和 Michiteru Yoshida:“HMG1 蛋白优先结合超螺旋 DNA。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Michiyasu Ohsuka,Hitoshi Shirakawa and Michiteru Yoshida: "Enhanced expression of HMG1 protein with cell differentiation in embryonal carcinoma." Journal of Biological Chemistry.
Michiyasu Ohsuka、Hitoshi Shirakawa 和 Michiteru Yoshida:“胚胎癌中 HMG1 蛋白的表达随细胞分化而增强。”
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  • 发表时间:
  • 期刊:
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