マラニアゲノム計画・第4クロモソームのP1ファージ整列ライブラリーの作成

Malania基因组计划：第四染色体P1噬菌体比对文库的创建

基本信息

批准号：
09270101
负责人：
渡辺純一
金额：
$ 0.96万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1997
资助国家：
日本
起止时间：
1997 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09270101/
关键词：
マラリア P1ファージライブラリー

项目摘要

近年、生物の前ゲノムの塩基配列を決定しようというゲノムプロジェクトが、急速な進歩を見せている。病原微生物ゲノムの研究は、とりわけ医学的に多大な成果が期待される分野である。マラリア原虫のゲノムは、3000万塩基対が14本のクロモソームに分かれて存在する。全塩基配列の決定を目的とするゲノム計画には、大量塩基配列解読に先だって、数年間にわたる準備段階が必要である。我々は、独自の戦略として整列化P1ファージライブラリーの作成を進めてきた。P1ファージが保持可能なDNAサイズは、約100kbとコスミドの2倍で、ゲノム全体をカバーするライブラリーの作成には特に有利と考えられる。1 熱帯熱マラリア原虫のゲノム研究は、3D7株を標準株として用いることで国際的に合意がなされた。本株を樹立者のWalliker博士より直接、入手し、原虫を大量培養した。これを材料として田代が開発した方法を使い、クロモソームサイズ(0.8〜3Mb)のDNAを含む巨大DNAの精製に成功した。同時にP1ファージ作成の条件を決定し、現在、原虫DNAについてライブラリーを作成中である。今後、我々が作成したプローブを用いて整列化を進める計画である。ゲノム研究は、DNA塩基配列の決定→遺伝子発現の解析→遺伝子機能の解明→生物学の本質の理解へと発展していく。2 我々は、遺伝子の発現についても、研究を行っている。赤内型原虫の材料として、cDANライブラリーを作成し、これまでに500クローンの塩基配列を決定した。データバンクとの比較によって約3分の2が新規遺伝子と判明した。詳細な分析は現在進行中であるが、その中にマラリアワクチン候補分子が含まれている可能性が期待されている。

近年来，旨在确定生物体前基因组碱基序列的基因组计划取得了快速进展。病原微生物基因组的研究是一个有望取得巨大医学成果的领域。疟原虫基因组由 3000 万个碱基对组成，分为 14 条染色体。基因组计划旨在确定整个碱基序列，在大规模碱基序列解码之前需要数年的准备。作为一种独特的策略，我们一直在开发阵列 P1 噬菌体文库。 P1噬菌体可以保留的DNA大小约为100 kb，是粘粒的两倍，被认为对于创建覆盖整个基因组的文库特别有利。 1 已达成国际协议，使用 3D7 菌株作为恶性疟原虫基因组研究的标准菌株。该菌株直接从创始人Walliker博士处获得，原生动物被大量培养。以这种材料为材料，利用田代开发的方法，他们成功纯化出了含有染色体大小DNA（0.8～3Mb）的巨型DNA。同时，我们确定了创建P1噬菌体的条件，目前正在创建原生动物DNA文库。将来，我们计划使用我们创建的探针进行对齐。基因组研究从确定 DNA 碱基序列到分析基因表达，再到阐明基因功能，再到理解生物学的本质。 2 我们还在进行基因表达的研究。作为赤内原生动物的材料，建立了cDAN文库，目前已确定了500个克隆的核苷酸序列。与数据库的比较显示，大约三分之二的基因是新的。目前正在进行详细分析，但希望其中可能包括疟疾疫苗候选分子。