人体肝脏果糖-1,6-二磷酸酶活性中心与活性分子相互作用的机理及其调控研究
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:21373094
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:80.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:B0301.化学理论与方法
- 结题年份:2017
- 批准年份:2013
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2014-01-01 至2017-12-31
- 项目参与者:任彦亮; 程志刚; 涂其冬; 李定; 孙瑶; 陈海峰; 韩新亚; 池波;
- 关键词:
项目摘要
Fructose-1, 6-bisphosphatase (FBPase), a rate-limiting enzyme involved in the pathway of gluconeogenesis, can catalyze the hydrolysis of fructose-1,6-bisphosphate to fructose-6-phosphate. As the second-to-last enzyme in gluconeogenesis, FBPase controls the incorporation of all three-carbon substrates into glucose. Inhibition of FBPase appears an effective means of reducing endogenous glucose production from glycerol and reduces risk of hypoglycemia and other mechanistic toxicities. Therefore, human liver FBPase as a potential drug targets for the treatment of type II diabetes is attracting more and more attention. Integrating use of molecular simulation and synthesis, gene and enzyme engineering, spectral analysis and characterization techniques, this project intends to do a systematic study on human liver FBPase to clarify the molecular mechanism of interaction between the enzyme and substrate or the probe molecule (lead inhibitors) and comprehend the regulation law between the enzyme activity and the substrate binding sites or AMP allosteric sites structure at the atomic level. On the basis of the structure and the molecular mechanism, we plan to rationally design, screen, optimize and get novel efficient inhibitors, that that binds to the substrate site of human liver FBPase, through the theory combined with practice. The research is expected to provide new ideas and some preliminary research for Type II diabetes drug formulation in our county.
人体肝脏FBPase 是位于糖异生途径中的一个关键调控酶,抑制FBPase 没有抑制磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶时可能出现的不良反应,也没有抑制葡萄糖-6-磷酸酶时可能增加低血糖的风险。因此,FBPase 作为治疗II 型糖尿病非常有潜力的药物作用靶点而日益受到研究者的关注。本项目拟综合运用分子模拟与设计、化合物合成、基因与酶工程、光谱分析与表征等技术,在分子、原子的层次上阐明人体肝脏FBPase 活性中心与底物、活性探针分子之间相互作用的分子机理。在此基础上进行基于该酶结构和作用机理的活性调控分子计算辅助设计,理论与实验研究相结合,筛选、改造优化得到能够高效作用于FBPase 活性中心的新型抑制剂先导化合物。研究成果可望为我国以FBPase 为靶点的II型糖尿病药物的创制工作提供新的思路和一定的前期研发基础。
结项摘要
人体肝脏FBPase(Hu-FBPase)是糖异生途径中的一个关键调控酶,抑制Hu-FBPase没有抑制磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶时可能出现的不良反应,也没有抑制葡萄糖-6-磷酸酶时可能增加低血糖的风险。因此,Hu-FBPase作为治疗II型糖尿病非常有潜力的药物作用靶点而日益受到研究者的关注。通过本项目的研究,我们成功优化了Hu-FBPase的表达纯化测活体系(纯度大于95%),并首次解析了包含底物FBP和Mg2+的复合物晶体结构。基于不同精度势能面的“窜跃”搜索策略,初步尝试构建了酶-配体结合构象的精确计算预测方法-DOX 1.0版,这一方法被应用到Hu-FBPase与配体相互作用机制的研究中。根据配与配体相互作用信息,我们发现了Hu-FBPase的多类新型抑制剂-包括具有共价结合类型的硝基乙烯类Hu-FBPase抑制剂。上述研究成果为我国以FBPase 为靶点的II型糖尿病药物的创制工作提供新的思路和一定的前期研发基础。
项目成果
期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
DOX: A new computational protocol for accurate prediction of the protein-ligand binding structures
DOX:一种新的计算协议,用于准确预测蛋白质-配体结合结构
- DOI:10.1002/jcc.24217
- 发表时间:2016
- 期刊:Journal of Computational Chemistry
- 影响因子:3
- 作者:Rao Li;Chi Bo;Ren Yanliang;Li Yongjian;Xu Xin;Wan Jian
- 通讯作者:Wan Jian
Structural and biochemical characterization of fructose-1,6/sedoheptulose-1,7-bisphosphatase from the cyanobacterium Synechocystis strain 6803
蓝藻集胞藻菌株 6803 果糖-1,6/景天庚酮糖-1,7-双磷酸酶的结构和生化特征
- DOI:10.1111/febs.12657
- 发表时间:2014-02-01
- 期刊:FEBS JOURNAL
- 影响因子:5.4
- 作者:Feng, Lingling;Sun, Yao;Hu, Xiaopeng
- 通讯作者:Hu, Xiaopeng
New insight into the binding modes of TNP-AMP to human liver fructose-1,6-bisphosphatase
TNP-AMP 与人肝果糖-1,6-双磷酸酶结合模式的新见解
- DOI:10.1016/j.saa.2016.04.002
- 发表时间:2016-08-05
- 期刊:SPECTROCHIMICA ACTA PART A-MOLECULAR AND BIOMOLECULAR SPECTROSCOPY
- 影响因子:4.4
- 作者:Han, Xinya;Huang, Yunyuan;Wan, Jian
- 通讯作者:Wan, Jian
Structure-Based Rational Design of Novel Inhibitors Against Fructose-1,6-Bisphosphate Aldolase from Candida albicans
基于结构的白色念珠菌果糖 1,6-二磷酸醛缩酶新型抑制剂的合理设计
- DOI:10.1021/acs.jcim.6b00763
- 发表时间:2017-06-01
- 期刊:JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING
- 影响因子:5.6
- 作者:Han, Xinya;Zhu, Xiuyun;Wan, Jian
- 通讯作者:Wan, Jian
The design, synthesis and biological evaluation of novel thiamin diphosphate analog inhibitors against the pyruvate dehydrogenase multienzyme complex E1 from Escherichia coli.
针对大肠杆菌丙酮酸脱氢酶多酶复合物 E1 的新型二磷酸硫胺素类似物抑制剂的设计、合成和生物学评价
- DOI:10.1039/c4ob01347f
- 发表时间:2014-10
- 期刊:Organic and Biomolecular Chemistry
- 影响因子:3.2
- 作者:Zhang, Lin;Ren, Yanliang;Wan, Jian;He, Hongwu
- 通讯作者:He, Hongwu
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- 通讯作者:刘德立*
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