以蓝藻果糖-1,6-二磷酸醛缩酶和水解酶为靶标的一剂双靶新型抑藻剂的合理设计与优化研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21572077
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0706.药物化学生物学
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Cyanobacteria class II fructose-1,6-bisphoshate aldolase (Cy-FBA) and cyanobacteria fructose-1,6-bisphosphatase (C-FBPase) are two neighboring key regulatory enzymes in the Calvin cycle of the cyanobacteria photosynthesis system. Each of them might be taken as a potential target for designing novel inhibitors to chemically control harmful algal blooms (HABs). In the present project, based upon the structure and catalyic regulatory mechanism,a series of novel dual-targets inhibitors are scheduled to be rationally designed, synthesized, and optimized against both the Cy-FBA and Cy-FBPase for HABs chemical control, and their inhibitory activities are scheduled to be examined both in vitro and in vivo.
综合运用现代分子模拟方法(包括我们发展的计算策略和方法)、分子生物学技术(克隆表达纯化、定点突变等)、光谱分析技术(荧光、圆二色谱等)、化合物合成技术等,在分子、原子乃至电子的层次上研究蓝藻光合作用卡尔文循环中偶联的关键调控酶Cy-FBA和Cy-FBPase,阐明其结构、功能、性质及其与活性调控分子的相互作用的分子机理。在此基础上,进行多轮循环的全新双靶酶抑制剂的生物合理设计、筛选与合成优化研究,以期最终获得具有高效抑制活性的全新双靶酶抑藻剂先导化合物。本项目有望为我国以光合系统中重要调控酶为新靶标的绿色农药创制工作提供一些建设性的研究思路和前期基础。

结项摘要

蓝藻是地球上最古老的生物物种之一,其光合系统常被视为植物的简化模型。本项目以模式蓝藻--集胞藻PCC 6803的光合系统中的卡尔文循环中偶联的重要调控酶(Cy-FBA和Cy-FBPase)为研究对象,综合运用现代分子模拟方法、分子生物学技术、仪器分析表征技术、有机合成技术等,在分子、原子乃至电子的层次上阐述了其结构、功能、性质及其与活性调控分子的相互作用的分子机理。通过本项的研究,我们取得了如下进展:一、详细探究了金属离子、pH值、温度等因素对Cy-FBA酶活的影响,成功解析了白色念珠菌的II型FBA的晶体结构,这为Cy-FBA晶体结构的生长和解析提供了重要前期研究基础;二、发展了一种高精度靶标蛋白-抑制剂打分策略(CSAMP);三、分别根据Cy-FBPase和Cy-FBA活性中心的关键药效团信息,运用基于碎片药物设计程序从头设计了硫脲类和马来亚胺类(Y系列)新型Cy-FBA抑制剂先导化合物,并探究了其结合模式;运用“一剂双靶”合理设计策略与方法进行全新双靶酶(Cy-FBA和Cy-FBPase)抑制剂(N系列)的生物合理设计、筛选与合成优化研究;四、发现了具有高效抑藻活性的异硫氰酸盐类“绿色”杀藻剂;五、进行了FBPase和FBA酶家族的拓展研究,首次发现了人体FBPase (Hu-FBPase)酶新位点及其“降糖降脂”双功能共价抑制剂,合理设计并优化了新型Ca-FBA抑制剂先导化合物,成功解析了Hu-FBPase与底物的复合物晶体结构。六、发展了一种基于碎片的共价药物从头设计程序(Cov_FB3D)。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(10)
DOX: A new computational protocol for accurate prediction of the protein-ligand binding structures
DOX:一种新的计算协议,用于准确预测蛋白质-配体结合结构
  • DOI:
    10.1002/jcc.24217
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Journal of Computational Chemistry
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Rao Li;Chi Bo;Ren Yanliang;Li Yongjian;Xu Xin;Wan Jian
  • 通讯作者:
    Wan Jian
Discovery of novel allosteric site and covalent inhibitors of FBPase with potent hypoglycemic effects
发现具有有效降血糖作用的新型变构位点和 FBPase 共价抑制剂
  • DOI:
    10.1016/j.ejmech.2019.111749
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    European Journal of Medicinal Chemistry
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Huang Yunyuan;Wei Lin;Han Xinya;Chen Haifeng;Ren Yanliang;Xu Yanhong;Song Rongrong;Rao Li;Su Chen;Peng Chao;Feng Lingling;Wan Jian
  • 通讯作者:
    Wan Jian
Synthesis and biological evaluation of novel inhibitors against 1,3,8-trihydroxynaphthalene reductase from Magnaporthe grisea
新型稻瘟病菌1,3,8-三羟基萘还原酶抑制剂的合成及生物学评价
  • DOI:
    10.1016/j.bmc.2016.01.053
  • 发表时间:
    2016-03-15
  • 期刊:
    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Chen, Haifeng;Han, Xinya;Wan, Jian
  • 通讯作者:
    Wan, Jian
A Rational Design, Synthesis, Biological Evaluation and Structure Activity Relationship Study of Novel Inhibitors against Cyanobacterial Fructose-1,6-bisphosphate Aldolase
蓝藻果糖1,6-二磷酸醛缩酶新型抑制剂的合理设计、合成、生物学评价及构效关系研究
  • DOI:
    10.1021/acs.jcim.5b00618
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Journal of Chemical Information and Modeling
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Han Xinya;Zhu Xiuyun;Zhu Shuaihua;Wei Lin;Hong Zongqin;Guo Li;Chen Haifeng;Chi Bo;Liu Yan;Feng Lingling;Ren Yanliang;Wan Jian
  • 通讯作者:
    Wan Jian
In silico screening of a novel scaffold for fructose-1,6-bisphosatase (FBPase) inhibitors
果糖 1,6-双磷酸酶 (FBPase) 抑制剂新型支架的计算机筛选
  • DOI:
    10.1016/j.jmgm.2018.10.017
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Molecular Graphics and Modelling
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Huang Yunyuan;Chi Bo;Xu Yanhong;Song Rongrong;Wei Lin;Rao Li;Feng Lingling;Ren Yanliang;Wan Jian
  • 通讯作者:
    Wan Jian

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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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    万坚
  • 通讯作者:
    万坚
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
    熊丽;万坚;张劼;高强;韩睿;黎晨;邓灵福;张青叶;刘德立*
  • 通讯作者:
    刘德立*

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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