人胚胎干细胞向中内胚层分化起始阶段组蛋白甲基化修饰的动态变化及调控机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91519310
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    75.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C07.细胞生物学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2016-12-31

项目摘要

It has been well documented that extracellular signals and epigenetics play critical roles in self-renewal and differentiation of stem cells. However, many questions remain. For instance, how do the extracellular signals regulate cell fate determination through modulating epigenetic changes? The project attempts to explore the dynamic change of histone methylation during mesendoderm differentiation of human embryonic stem cells and the underlying mechanism. By employing multi-disciplinal techniques, we will focus on histone methylation especially H3K27me3 during the early stage of mesendoderm differentiation induced by Activin A and Wnt3. We will confirm the down-regulation of H3K27me3 and investigate whether this down-regulation is modulated by Smad2/3. Finally, how the epigenetic change is associated with the coordinated regulation of ME genes by Activin and Wnt. We hope this study will shed light on efficacious differentiation of human embryonic stem cells and cell fate determination of early embryos.
很多研究证明细胞外信号和细胞内表观遗传变化在干细胞自我更新和分化中起着重要作用,但对干细胞分化的表观遗传学变化与外界信号之间的相互关系研究仍有很多空白,例如在细胞分化早期细胞外信号如何通过影响表观遗传变化而调控细胞命运?我们前期研究表明Activin/Nodal信号和Wnt信号是调控人胚胎干细胞向中内胚层分化的关键信号通路,并发现Activin会引起组蛋白甲基化修饰H3K27me3的下调。本项目将着重探讨在Activin和Wnt信号诱导的中内胚层分化起始阶段组蛋白甲基化修饰水平的变化。希望从基因转录和蛋白表达及关键因子DNA募集方面揭示组蛋白甲基化修饰的变化及其分子调控机制,进而建立中内胚层分化起始阶段胞外信号通路与表观遗传微环境变化之间的联系。本项目的完成将为提高干细胞定向分化效率提供分子理论基础,进一步加深对早期胚胎发育细胞命运决定的理解。

结项摘要

本项目通过建立高效的人胚胎干细胞向中内胚层分化系统,利用染色质免疫共沉淀结合高通量测序,我们发现H3K27me3水平在中内胚层分化起始阶段有明显下调,并且这一下调促进Activin和Wnt信号在转录水平协同促进胚胎干细胞中内胚层分化。在分子机制上,我们发现Activin信号通过调控多梳抑制蛋白复合体(PRC2)蛋白稳定性从而导致分化早期H3K27me3的下调。具体调控机制为Activin通过其下游效应因子Smad2,下调EZH2、EED、SUZ12蛋白水平,进而分解PRC2蛋白复合体,使其从染色质DNA脱落,失去活性,从而诱导中内胚层分化早期H3K27me3水平的下调。进一步,Activin与Wnt通过其下游效应因子(Smad2/β-catenin)在基因转录水平协同激活中内胚层标志性基因的表达,促进人胚胎干细胞向中内胚层分化。. 综上所述,本项目研究通过对人胚胎干细胞中内胚层分化早期H3K27me3水平、细胞外信号通路相互关系和H3K27me3水平与细胞外信号相互关系的阐释,提出胚胎干细胞中内胚层分化早期的两阶段调控模式:首先降低细胞内H3K27me3的水平;其次激活细胞内中内胚层特异性转录调控网络。本项研究揭示了中内胚层分化早期表观遗传学变化以及相关的一些分子机制,进一步为胚胎干细胞定向分化及早期胚胎发育研究提供了新的视角。同时本研究建立了细胞外信号与细胞内组蛋白甲基化修饰间的直接分子生物学相互关系,为研究基因表达调控,再生医学相关研究、应用提供了可借鉴的理论依据。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
BMP restricts the self-renewal of intestinal Lgr5+ stem cells by directly suppressing their signature genes
BMP 通过直接抑制肠道 Lgr5 干细胞的特征基因来限制其自我更新
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Nature Communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Qi Z;Li Y;Zhao B;Xu C;Liu Y;Wang X;Yang X;Li B;Han JD;Chen YG
  • 通讯作者:
    Chen YG
TGF-β Signaling from Receptors to Smads.
从受体到 Smads 的 TGF-β 信号传导
  • DOI:
    10.1101/cshperspect.a022061
  • 发表时间:
    2016-09-01
  • 期刊:
    Cold Spring Harbor perspectives in biology
  • 影响因子:
    7.2
  • 作者:
    Hata A;Chen YG
  • 通讯作者:
    Chen YG
Activin/Smad2-induced H3K27me3 reduction is crucial to initiate mesendoderm differentiation of human embryonic stem cells
Activin/Smad2 诱导的 H3K27me3 减少对于启动人胚胎干细胞的中内胚层分化至关重要
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Journal of Biological Chemistry
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Duan F;Na J;Han JD;Chen YG
  • 通讯作者:
    Chen YG

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其他文献

The pseudoreceptor BMP and activin membrane-bound inhibitor positively modulates Wnt/-catenin signaling.
假受体 BMP 和激活素膜结合抑制剂正向调节 Wnt/
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Journal of Biological Chemistry
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Wu W;Gao C;宁元亨;Lin Z;陈晔光;He X
  • 通讯作者:
    He X
类器官: 新冠病毒研究新模型
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中国科学: 生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王婷;范时盼;陈晔光
  • 通讯作者:
    陈晔光
Human BAMBI cooperates with Smad7 to inhibit Transforming Growth Factor TGF- Signaling.
人类BAMBI与Smad7配合抑制转化生长因子TGF-
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Journal of Biological Chemistry
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Yan X;Zhao X;陈晔光;宁元亨;Chen F;Chen H;Lin Z
  • 通讯作者:
    Lin Z

其他文献

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知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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