tRNA反密码环上m5C修饰的分子机制和功能研究

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基本信息

项目摘要

Dynamic RNA modification plays important role in cellular processes, and relevant study represents an emerging research frontier in biology and medicine. tRNA is one of the important molecules which play central roles in protein synthesis. Nucleotides in tRNA are most post-transcriptionally modified, which generally reinforces the tertiary structure of tRNA and accelerate its cellular function. Nucleotides in anticodon loop are most often modified area in tRNA, these modifications are not only essential to the precise recognition and efficiency of protein translation, but also could modulate the production of functional tRNA fragments (tRF). The aberrant expression of RNA:m5C methyltransferase genes are closely related with many human diseases such as intellectual disability. Our lab has been working on tRNA and tRNA modification for decades and is very experienced in involved techniques. In this proposal, we plan to study the catalytic mechanism, RNA recognition and biological function of two RNA:m5C methyltransferases those are working on anticodon loop of tRNA, NSun3 and Dnmt2. Hopefully these research results will provide basic insights into understanding the causation of related disease.
细胞内RNA的动态修饰在生物体内发挥着重要的作用,相关研究正在成为生物学和医学领域研究热点之一。tRNA是细胞中参与蛋白质合成的重要分子之一。tRNA上的核苷酸存在广泛修饰,这些修饰对于稳定tRNA的三级结构以及tRNA在细胞内发挥功能起着重要作用。反密码子环是tRNA上修饰发生频率最高的地方,这些位点的修饰不仅会影响到翻译的精确性和效率,还可能参与到调控tRNA来源的tRF的生成。RNA:m5C甲基化修饰酶的基因表达异常与智力障碍等人类疾病密切相关。申请人实验室在tRNA以及tRNA甲基化修饰相关研究方面具有扎实的基础。本申请拟以催化tRNA反密码子环上特定位点的m5C修饰的两类m5C 甲基转移酶NSun3和Dnmt2为研究对象,研究其催化机理、对tRNA底物的识别机制和生物学功能。相关研究结果将为相关疾病的产生原因提供基础研究的依据。

结项摘要

m5C修饰是RNA众多甲基化修饰中一类重要的化学修饰,发生在胞嘧啶的第五位上,Dnmt2是一个tRNA甲基转移酶,我们研究了人源Dnmt2(hDnmt2)对底物tRNA的识别机理。发现hDnmt2在底物tRNA的38C进行甲基化,鉴定到底物tRNA反密子环中G34是hDnmt2识别底物的关键位点;发现hDnmt2对tRNAVal(AAC)第38位的m5C修饰依赖于ADAT2/3 复合物催化的tRNA 第34位的A-to-I修饰;发现hDnmt2识别tRNA反密码子环上严格的共有序列是C32U33 (G/I)34N35(C/U)36A37C38(N表示任意核苷酸,32-38表示位置),其中,G34和A37是关键的识别位点,第36位必须是嘧啶碱基的核苷酸。发现hDnmt2识别底物tRNA依赖D茎中第11位核苷酸与第24位核苷酸之间的碱基对和第10位核苷酸与第25位核苷酸之间的碱基对,以及可变环的核苷酸数量;hDnmt2主要定位在细胞核内。我们按计划圆满完成了该申请的既定目标。此外,我们还得到了以下结果:(1)发现人tRNA 2'-O-甲基化(Nm)修饰酶(hTrmt13)具有调控转录和翻译的双重功能;(2)研究了N6-苏氨酰氨基甲酰腺苷 (t6A)的修饰,它是一种发生在tRNA第37位上的关键修饰。真核生物中由五个亚基组成的KEOPS复合物负责催化t6A的生成,鉴定出KEOPS复合物催化t6A的生成的tRNA分子上的关键核苷酸和碱基对。在国际学术刊物发表研究论文《核酸研究》上2篇、《EMBO J》上1篇,还发表了1篇综述文章。培养博士研究生3名。

项目成果

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氨基酰-tRNA合成酶与神经退行性
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大肠杆菌氨基酰-tRNA合成酶的乙酰化
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相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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