Investigation of bovine leukemia virus-induced leukemogenesis

牛白血病病毒诱导的白血病发生的研究

基本信息

批准号：
18F18100
负责人：
間陽子
金额：
$ 1.47万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-04-25 至 2020-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18F18100/
关键词：
BLV Sensitive PCR NGS DNA-Capture-Seq analysis LM PCR Seq analysis ヒト由来細胞株ヒト血液ヒト乳癌組織 Bovine leukemia virus human Blood human cancer tissue DNA extraction PCR amplification Next-generation sequencing BLV-human hybrid genome

项目摘要

We extracted DNA from 199 human cell lines and from 100 human blood and 27 breast cancer tissues sample. Samples were subjected to detect BLV presence in human by sensitive PCR. PCR result showed that all human cell lines were BLV negative. We observed BLV gene specific bands in 6 blood and 5 cancer tissue sample. To confirm the PCR result, we performed two different high throughput sequencing method, namely viral DNA-Capture-Seq and LM PCR library enhancement NGS. Both of the high throughput sequencing failed to detect any single read mapped to BLV sequencing. BLV detection results indicate that there is no evidence for BLV-specific sequences. The positive result in blood and cancer tissue samples might be caused by the cross contamination during the process of performing the experiment.

我们从199个人类细胞系，100人血液和27个乳腺癌组织样本中提取了DNA。通过敏感PCR对样品进行样品检测在人类中的存在。 PCR结果表明所有人类细胞系均为BLV阴性。我们观察到6个血液和5个癌组织样品中的BLV基因特异性条带。为了确认PCR结果，我们进行了两种不同的高吞吐测序方法，即病毒DNA-apapture-seq和LM PCR库增强NGS。两种高吞吐量测序都无法检测到映射到BLV测序的任何单个读取。 BLV检测结果表明没有证据表明BLV特异性序列。血液和癌组织样本的积极结果可能是在执行实验过程中交叉污染引起的。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

A broadly applicable and practical PCR-RFLP method for genotyping Bovine Leukemia Virus

一种广泛适用且实用的牛白血病病毒基因分型 PCR-RFLP 方法

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
The Journal of Veterinary Medical Science
影响因子：
0
作者：
Kohei Nishikaku;Rina Ishikura;Nagaaki Ohonuki;Meripet Polat;Yoko Aida;Satoshi Murakami;Tomoko Kobayashi
通讯作者：
Tomoko Kobayashi

Epidemiology and genetic diversity of bovine leukemia virus in South America and Southeast Asia.

南美洲和东南亚牛白血病病毒的流行病学和遗传多样性。

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
2)Meripet Polat;Kyaw Kyaw Moe;Shin nosuke Takeshima;Hla Hla Moe;Liu Shiqi;Yoko Aida.
通讯作者：
Yoko Aida.

Investigation of bovine leukemia virus (BLV) proviral DNA integration in cattle genome.

牛基因组中牛白血病病毒 (BLV) 前病毒 DNA 整合的研究。

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
1)Meripet Polat;Susumu Saito;Liushiqi Borjigin;Kazuyoshi Hosomichi,Yoko Aida
通讯作者：
Kazuyoshi Hosomichi,Yoko Aida

Broadly applicable PCR restriction fragment length polymorphism method for genotyping bovine leukemia virus

DOI：
10.1292/jvms.18-0603
发表时间：
2019-08-01
期刊：
JOURNAL OF VETERINARY MEDICAL SCIENCE
影响因子：
1.2
作者：
Nishikaku, Kohei;Ishikura, Rina;Kobayashi, Tomoko
通讯作者：
Kobayashi, Tomoko

Absence of bovine leukemia virus proviral DNA in Japanese human blood cell lines and human cancer cell lines

日本人血细胞系和人癌细胞系中不存在牛白血病病毒前病毒 DNA

DOI：
10.1007/s00705-019-04474-9
发表时间：
2019
期刊：
Archives of Virology
影响因子：
2.7
作者：
Susumu Saito;Yuri Kitamura-Muramatsu; Fumiko Komine;Meripet Polat;Shin-nosuke Takeshima;Masami Takei;Yoko Aida.
通讯作者：
Yoko Aida.