Study on analytical techniques of conformations for environmental biopolymers in dynamic equilibrium

环境生物聚合物动态平衡构象分析技术研究

• 批准号: 23615012
• 负责人: IZUMI Hiroshi
• 金额: $ 2万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23615012/
• 关键词: 生体高分子; 立体配座; 超二次構造; タンパク質; 構造アライメント; 構造活性相関; 赤外円二色性分光法; 免疫; ケモインフォマティクス; 多型; 自己抗体; 主要組織適合遺伝子複合体

Supersecondary structure code (SSC) for 3D structural alignment of proteins was proposed, and the database of conformational code for 7494 subunits of proteins was constructed. The search method using these codes extracted the characteristic supersecondary structures (the structural regions in globular proteins folded into repetitive units) of immune factors related to self-recognition, and the fragment structures were represented as the simple description. Further, the conformational search techniques for absolute configuration determination of chiral compounds using vibrational circular dichroism (VCD) spectroscopy were transferred to a company.

提出了蛋白质3D结构比对的超二级结构编码（SSC），构建了7494个蛋白质亚基的构象编码数据库。使用这些代码的搜索方法提取了与自我识别相关的免疫因子的特征超二级结构（折叠成重复单元的球状蛋白中的结构区域），并将片段结构表示为简单描述。此外，使用振动圆二色性（VCD）光谱法确定手性化合物绝对构型的构象搜索技术已转让给一家公司。

项目成果

赤外円偏光二色性分光計:VCDキラル分子アナライザーChiralIR-2Xによるキラル分子の絶対配座決定技法

红外圆二色光谱仪：利用VCD手性分子分析仪ChiralIR-2X测定手性分子绝对构象的技术

• 发表时间: 2013
• 作者: 和泉博;L. A. Nafie
• 通讯作者: L. A. Nafie

Data Structure in Mining of Protein Supersecondary

蛋白质超二级挖掘中的数据结构

• 发表时间: 2013
• 作者: 和泉博;脇坂昭弘;L. A. Nafie;R. K. Dukor
• 通讯作者: R. K. Dukor

キラル医薬品やタンパク質計測にむけた立体配座コード構造パターン解析技術

手性药物和蛋白质测量的构象密码结构模式分析技术

• 发表时间: 2012
• 作者: 和泉博;脇坂昭弘
• 通讯作者: 脇坂昭弘

タンパク質の構造評価装置, 構造評価方法, 構造評価プログラム及び構造評価プ ログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体

蛋白质结构评价装置、结构评价方法、结构评价程序以及记录结构评价程序的计算机可读记录介质

• 发表时间: 2013

産総研オープンラボ2011

AIST 开放实验室 2011