メダカを用いたヒト遺伝的多型の生体機能解析実験系の構築

青鳉鱼人类基因多态性生物学功能分析实验系统的构建

基本信息

批准号：
21657065
负责人：
太田博樹
金额：
$ 1.98万
依托单位：
Kitasato University (2010)The University of Tokyo (2009)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2010
项目状态：
已结题

项目摘要

【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地点でメダカ採取を行った。(2)メダカCYP遺伝子多型の細胞系を用いた活性測定:勝村啓史(協力者)は培養細胞にGAL4/UAS系を用いてメダカCYPを導入し、活性の違いを測定し、メダカにヒトで見られるのと類似した「高活性型」「低活性型」のCYPが存在することを発見した。(3)勝村啓史(協力者)と尾田正二(協力者、東京大学大学院新領域創成科学研究科・准教授)はミュータジェネシスにより人工的にアミノ酸の入れ替えを行い、「高」「低」活性型を決定するアミノ酸置換の探査をおこなったが、1つ1つのアミノ酸の入れ替えでは酵素活性に変化が無いことが分かった。(4)勝村啓史(協力者)は薬剤応答に関する行動実験:上記のCYP多型をもつ野生メダカをもちいて薬剤(現在のところ主にカフェイン)を投与し、その行動の画像解析を行い、統計学的に有意な差異の検出を試みている。(5)勝村啓史(協力者)は採取した日本全国の野生メダカのミトコンドリア・ゲノム(mtDNA)塩基配列を集団遺伝学的に解析し、現在の野生メダカが、既に日本列島全体に生息していたより古い集団に、北部九州から拡散した集団が混ざるように広がった可能性を示した。これは野生メダカが水田の拡散に伴い、日本列島全体に広がった可能性を支持する(Katsumura et al.投稿準備中)。

[背景]近年来，人类群体已经报道了巨大的遗传多态性，但是在大多数情况下，对抗基因（ALLEL）之间的功能差异和进化意义尚不清楚。 [目的]建立一个实验系统，使用MEDAKA测量多功能函数差异。 [2010年的结果]（1）收集了野生Medaka区域群体样本：Keiji Katsumura（合作者）去年对Wild Medaka进行了取样。特别是，Medaka在北北北部的四个点收集（该地区被认为是在Yayoi时期被帕迪养殖传播的）。（2）使用MEDAKA CYP遗传多重细胞系统的活性测量：Keiji Katsumura（CO -Worker）使用GAL4/UAS系统将Medaka CYP引入培养细胞，测量活动的差异，并测量Medaka中的Medaka有“高度活跃”和“低活动” CYP类似于所看到的。（3）Keiji Katsumura（合作者）和Shoji Oda（合作者，科学研究生院，创建研究生院，Tokyo University of Tokyo University of Science of Creation school院），人为地替换了诱变。确定的酸替换，但发现每个氨基酸的替代并没有改变酶活性。（4）Keiji Katsumura（合作者）是与药物反应相关的作用实验：使用上述野生Medaka使用上述CYP多态性的药物（主要是咖啡因），我们试图检测统计意义的行为。不同之处。（5）Keiji Katsumura（合作者）在一个基因分析的组中收集了野生Medaka线粒体基因组（MTDNA）基础序列，并且目前的野生Medaka已经在整个日本群岛中生活了。混合。这支持了由于稻田的传播，野生Medaka在整个日本群岛中散布的可能性（Katsumura等。