The coupling mechanism of glutaminase and kinase in GatCAB

GatCAB中谷氨酰胺酶和激酶的偶联机制

• 批准号: 19370037
• 负责人: YAO Min
• 金额: $ 11.98万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19370037/
• 关键词: GatCAB; グルタミナーゼ; キナーゼ; アンモニアチャネル; X線構造解析

GatCABのアンモニアチャネルの開閉に重要と推定した残基の変異体調製に成功し、in vivoアッセイによって、E125が直接アンモニアの輸送に関与していることが検証された。SAXSを用いて得られた溶液中の構造情報は、tRNA^(Gln)のU1-A72がcradleドメインで、D-loopがC-tailドメインで認識することを示唆した。また、GatCABの1.9A分解能での構造解析に成功し、tRNA認識に重要であるGatBのC-tailドメインの構造を明らかにし、GatBに特徴的な配列を見い出した。更にGatCABとtRNA^(Gln)変異体のアッセイを行い、GatBのcradleドメインの3_(10)-helixとC-tailドメインに保存されたGlyがtRNA^(Gln)認識に重要であることが明らかになった。

我们成功制备了 GatCAB 残基的突变体，预计对打开和关闭氨通道很重要，并且体内测定验证了 E125 直接参与氨转运。使用SAXS获得的溶液中的结构信息表明tRNA^(Gln)的U1-A72被摇篮结构域识别，并且D环被C尾结构域识别。我们还成功以1.9A分辨率对GatCAB进行了结构分析，阐明了对tRNA识别很重要的GatB C尾结构域的结构，并发现了GatB的序列特征。 GatCAB 和 tRNA^(Gln) 突变体的进一步分析表明，GatB 摇篮结构域的 3_(10)-螺旋和 C 尾结构域中保守的 Gly 对于 tRNA^(Gln) 识别非常重要。

项目成果

真正細菌型GatCABのtRNA認識機構と分子進化、BMB2008

真细菌GatCAB的tRNA识别机制和分子进化，BMB2008

• 发表时间: 2008
• 作者: 中村彰良;山根潤二;姚閔;田中勲
• 通讯作者: 田中勲

黄色ブドウ球菌由来GatCABの高分解能X線結晶構造解析

金黄色葡萄球菌 GatCAB 的高分辨率 X 射线晶体结构分析

• 发表时间: 2007
• 作者: 山根潤二;中村彰良;周勇;十亀弘子;辻下英樹;武本浩;姚閔;田中勲
• 通讯作者: 田中勲

真正細菌型GatCABと古細菌型GatCABの比較

真细菌 GatCAB 与古细菌 GatCAB 的比较

• 发表时间: 2009
• 作者: 中村彰良;山根潤二;Zhou Qian;姚閔;田中勲
• 通讯作者: 田中勲

Makoto Kimura, Crystal structure of an archaeal Ski2p-like protein from Pyrococcus horikoshii OT3

Makoto Kimura，来自堀越火球菌 OT3 的古菌 Ski2p 样蛋白的晶体结构

• 发表时间: 2008
• 期刊: Protein Sci 17
• 作者: Xiaodong Zhang;Takashi Nakashima;Yoshimitsu Kakuta;Min Yao;Isao Tanaka
• 通讯作者: Isao Tanaka

Structural and Functional Characterization of the LldR from Corynebacterium glutamicum : a Transcriptional Repressor Involved in 1-Lactate and Sugar Utilization

谷氨酸棒杆菌 LldR 的结构和功能表征：参与 1-乳酸和糖利用的转录抑制子

• 发表时间: 2008
• 期刊: Nucleic Acid Research 36
• 作者: 松岳大輔;中迫雅由;Takao Naganuma;Sarin Chimnaronk;Masaaki Sokabe;Sarin Chimnaronk;Hideaki Tanaka;Y-G Gao
• 通讯作者: Y-G Gao