有機フッ素化合物のバイオコンバージョン:フッ素脱離・導入の酵素触媒機構と応用

有机氟化合物的生物转化:酶催化除氟机理/介绍及应用

基本信息

  • 批准号:
    14703021
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 18.39万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 2004
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

1.フルオロ酢酸デハロゲナーゼの構造と機能フルオロ酢酸デハロゲナーゼはフルオロ酢酸の加水分解的脱ハロゲン反応を触媒し、グリコール酸を与える。脂肪族フッ素化合物の強固な炭素-フッ素結合の切断を触媒する唯一の既知酵素である。本酵素はフルオロ酢酸を最も良好な基質とするが、クロロ酢酸にも、その4%の活性を示す。本酵素反応では、触媒中心アスパラギン酸残基の側鎖カルボキシル基が基質のα-炭素を求核攻撃し、ハライドイオンが脱離するとともに、酵素と基質が共有結合したエステル中間体が生成する。続いてヒスチジン残基が活性化した水分子によって中間体が加水分解され、グリコール酸が遊離するとともに、触媒中心アスパラギン酸残基が再生する。本研究では、Burkholderia sp.FA1が生産する本酵素の構造と機能を解析した。結晶構造解析によって活性部位に存在することが示されたアミノ酸残基を部位特異的変異法で改変し、触媒能への影響を調べた。触媒中心のAsp104、His271のほか、これらの近傍に存在するArg105、His149、Arg108、Tyr147、Phe34、Tyr212、Phe272、His103をアラニン残基に改変すると、フルオロ酢酸とクロロ酢酸のいずれに対する活性も消失した。一方、Trp150をアラニン残基に改変した酵素では、クロロ酢酸に対する活性は野生型酵素の71%残存したにもかかわらず、フルオロ酢酸に対する活性は完全に消失した。Trp150はフッ化物イオンの脱離に必須の役割を果たすことが示された。2.2-ハロアクリル酸レダクターゼの発見と機能解析2-クロロアクリル酸資化性菌Burkholderia sp.WSが、NADPHを還元剤として2-ハロアクリル酸の不斉還元を触媒する新奇酵素2-ハロアクリル酸レダクターゼを生産することを明らかにした。本酵素と補酵素再生系を組み合わせることにより、除草剤の原料として有用な(S)-2-クロロプロピオン酸を効率よく生産することに成功した。
1。氟乙酸脱核酶氟乙酸脱核酶的结构和功能催化氟乙酸盐的水解脱核化,从而得到乙醇酸。它是唯一催化脂肪族氟化合物稳健碳氟键的裂解的已知酶。该酶使用氟乙酸作为最佳底物,但在氯乙酸中也表现出4%的活性。在这种酶反应中,催化中心天冬氨酸残基的侧链羧基羧基核心核定核能攻击底物的α-碳,使卤化物离子离开,并形成酶和底物的中间体。随后,中间体被水分子与活化的组氨酸残基水解,释放乙醇酸,并再生催化中央天冬氨酸残基。在这项研究中,我们分析了Burkholderia sp。该酶的结构和功能。 FA1。使用定位的诱变来修改显示出通过晶体结构分析在活性位点中存在的氨基酸残基,以研究对催化能力的影响。除催化中心外,ASP104和HIS271,Arg105,His149,Arg108,Tyr147,Phe34,Phe34,Tyr212,Phe272和HIS103都位于附近,还改变了丙氨酸残基,以及对氟乙酸和氯乙酸的活性。另一方面,在已用TRP150修饰为丙氨酸残基的酶中,尽管剩余的野生型酶的活性为71%,但针对氟乙酸的活性还是完全损失了。 TRP150已显示在消除氟离子中起着至关重要的作用。对2.2-六丙烯酸酯还原酶2-氯丙烯酸酯的发现和功能分析都吸收了burkholderia sp.ws,它表明它会产生新型酶2-卤代丙烯酸酯还原酶,催化使用2-卤代丙烯酸酯的不对称还原,使用2-卤代丙烯酸酯,使用nADph as a降低。通过将该酶与辅酶再生系统相结合,我们成功地产生了(S)-2-氯丙酸,该酸可作为除草剂原料。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Ichiyama, Susumu et al.: "Catalysis-linked inactivation of fluoroacetate dehalogenase by ammonia : a novel approach to probe the active-site environment"J. Biochem.. 131・5. 671-677 (2002)
Ichiyama, Susumu 等:“氨对氟乙酸脱卤酶的催化相关灭活:探测活性位点环境的新方法” J. Biochem.. 131・5 (2002)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
2-Haloacrylate reductase : A novel enzyme of the medium-chain dehydorogenase/reductase superfamily that catalyzes the reduction of a carbon-carbon double bond of unsaturated organohalogen compounds
2-卤代丙烯酸酯还原酶:中链脱氢酶/还原酶超家族的一种新型酶,可催化不饱和有机卤素化合物碳-碳双键的还原
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kurata;Atsushi et al.
  • 通讯作者:
    Atsushi et al.
Kurihara, Tatsuo at al.: "Purification, characterization, and gene cloning of a novel fluoroacetate dehalogenase from Burkholderia sp. FA1"J.Mol.Catal.B : Enzym.. 23. 347-355 (2003)
Kurihara, Tatsuo 等人:“来自伯克霍尔德菌属 FA1 的新型氟乙酸脱卤酶的纯化、表征和基因克隆”J.Mol.Catal.B : Enzym.. 23. 347-355 (2003)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Park, Chung et al.: "A new DL-2-haloacid dehalogenase acting on 2-haloacid amides : purification, characterization, and mechanism"J. Mol. Catal. B : Enzym.. (In press). (2003)
Park, Chung 等人:“一种作用于 2-卤代酰胺的新型 DL-2-卤代酸脱卤酶:纯化、表征和机制”J.
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

栗原 達夫其他文献

An extended Contrastive Divergence algorithm as excess entropy production minimization
作为过剩熵产生最小化的扩展对比散度算法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    横山 文秋;川本 純;陳 晨;今井 友也;栗原 達夫;山本峻平,金子邦彦;山本峻平,金子邦彦;山本峻平,金子邦彦;山本峻平,金子邦彦
  • 通讯作者:
    山本峻平,金子邦彦
Effect of individual differences in desire for control on willingness to pay for a customizable product
控制欲的个体差异对定制产品支付意愿的影响
  • DOI:
    10.14947/psychono.38.8
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    横山 文秋;川本 純;陳 晨;今井 友也;栗原 達夫;山本峻平,金子邦彦;山本峻平,金子邦彦;山本峻平,金子邦彦;山本峻平,金子邦彦;井関紗代,北神慎司
  • 通讯作者:
    井関紗代,北神慎司
"多細胞生物"麹菌の細胞間連絡を制御するオルガネラWoroninbodyに関する研究
对“多细胞生物”曲霉中控制细胞间通讯的细胞器 Woroninbody 的研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    丸山 沙織;川本 純;樽井 淳;王 玉;江崎 信芳;栗原 達夫;丸山潤一
  • 通讯作者:
    丸山潤一
異なる光質が葉野菜の体内元素濃度に及ぼす影響
不同光质对叶菜体元素浓度的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    都築 大空;今井 友也;川本 純;小川 拓哉;栗原 達夫;芹澤和樹・大橋(兼子)敬子・渡部敏裕
  • 通讯作者:
    芹澤和樹・大橋(兼子)敬子・渡部敏裕
Shewanella vesiculosa HM13 由来細胞外膜小胞表層タンパク質の生理機能解析
泡状希瓦氏菌HM13细胞外膜囊泡表面蛋白的生理功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    釜阪 紘平;川本 純;小川 拓哉;栗原 達夫
  • 通讯作者:
    栗原 達夫

栗原 達夫的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('栗原 達夫', 18)}}的其他基金

Enzymatic manipulation of biomembrane lipids to enhance cellular function
生物膜脂质的酶促操作以增强细胞功能
  • 批准号:
    23K17991
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Molecular basis for generation of the diversity of bacterial membrane phospholipid acyl chains and mechanisms underlying their physiological functions
细菌膜磷脂酰基链多样性产生的分子基础及其生理功能机制
  • 批准号:
    21H02102
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Dissection of the molecular basis of membrane vesicle biogenesis and construction of an extracellular platform for substance production by using a hyper-vesiculating bacterium
剖析膜囊泡生物发生的分子基础,并利用超囊泡细菌构建用于物质生产的细胞外平台
  • 批准号:
    20K20570
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
封入体形成を抑制する低温タンパク質生産システムの開発
开发抑制包涵体形成的低温蛋白质生产系统
  • 批准号:
    16658044
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
含硫黄・含セレンバイオファクターの構造形成を司る類縁酵素群の構造・機能・役割分担
控制含硫和含硒生物因子结构形成的相关酶的结构、功能和角色共享
  • 批准号:
    12780470
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
フルオロ酢酸デハロゲナーゼによる炭素-フッ素結合の切断機構
氟乙酸脱卤酶裂解碳氟键的机制
  • 批准号:
    08760080
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
2-ハロ酸デハロゲナーゼの構造と反応機構の解析、それに基づく酵素機能の改変
2-卤酸脱卤酶的结构和反应机制分析,并在此基础上对酶功能进行修饰
  • 批准号:
    07780535
  • 财政年份:
    1995
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
微生物のハロ酸デハロゲナーゼの分子生物学的研究と応用
微生物卤酸脱卤酶的分子生物学研究及应用
  • 批准号:
    05760069
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

Development of Decarboxylative Functionalization Reactions of Carboxylic Acids
羧酸脱羧官能化反应的进展
  • 批准号:
    18H01974
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Investigation of novel dehaloganation process of organic compounds through photo-halogenation of aromatic imines
通过芳香亚胺的光卤化研究有机化合物的新型脱卤工艺
  • 批准号:
    26620145
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Highly sensitive analysis, exposure assessment and emission mechanisms of halogenated organic compounds.
卤代有机化合物的高灵敏度分析、暴露评估和排放机制。
  • 批准号:
    22350070
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development of Electrochemical Determination for Halogenated Organic compounds
卤代有机化合物电化学测定方法的进展
  • 批准号:
    20550079
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Studies on biological dehalogenation of chlorinated organic compounds
有机氯化物的生物脱卤研究
  • 批准号:
    14360057
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 18.39万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了