核DNA及びミトコンドリアDNAから見た肺吸虫属の分子系統樹作成の試み

尝试从核DNA和线粒体DNA角度构建肺吸虫属分子系统发育树

基本信息

批准号：
08670272
负责人：
吾妻健
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
1996
资助国家：
日本
起止时间：
1996 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08670272/
关键词：
ミトコンドリアDNA COI ITS2 PCR 塩基配列分子系統樹肺吸虫

项目摘要

本研究では、アジアに生息する肺吸虫のミトコンドリアDNAのCOI領域と核DNAのITS2領域をPCR法にて増幅し、塩基配列を決定して、コンピューター解析により系統類縁分析を行なった。解析した肺吸虫は、ウエステルマン肺吸虫2倍体(日本産、中国産、台湾産、フィリピン産、マレーシア産)、ベルツ肺吸虫(日本産、韓国産)、宮崎肺吸虫、大平肺吸虫、小型大平肺吸虫、佐渡肺吸虫、ヒロクチ肺吸虫、ケリコット肺吸虫、メキシコ肺吸虫の9種14集団である。コンピューターソフトClustl Vを用いて、COI領域393塩基対、ITS2領域363塩基対のalignment解析を行なった結果、まず日本産のウエステルマン肺吸虫とベルツ肺吸虫の間では、COI、ITS2ともほとんど差は見られなかった。しかし、日本産ウエステルマン肺吸虫と他の3つのアジア産(フィリピン産、タイ産、マレーシア産)ウエステルマン肺吸虫の間では、COI領域で36-46塩基対またITS2領域で6-8塩基対の違いが見られた。これは、別種間の違いに相当すると考えられる。次に、大平肺吸虫、小型大平肺吸虫、佐渡肺吸虫の3種の間では、COI領域で1-2塩基対のみ、またITS2領域ではまったく違いが見られなかった。この結果は、これら3種がsynonymであることを示している。PhylipとPaupの2つのコンピューターソフトを用いて、近隣結合法により系統分析を行なった結果、1)日本産では、ウエステルマン肺吸虫グループと大平肺吸虫グループはそれぞれ1つのクラスターを形成する、2)宮崎肺吸虫と大平肺吸虫グループは近縁であり、ウエステルマン肺吸虫グループはそのベースに結合する、3)ヒロクチ肺吸虫は、宮崎肺吸虫か大平肺吸虫グループに近縁であるが、どちらであるかはまだ不明である、4)ケリコット肺吸虫はメキシコ肺吸虫に近縁であり、アジア産の肺吸虫とは、遠縁である。

在这项研究中，通过PCR扩增了肺浮力的线粒体DNA的COI区域及其肺漏气的ITS2核DNA区域，并确定了基础序列，并使用计算机分析进行了系统发育分析。 The pulmonary flukes analyzed were 14 populations of nine species: Westermann's diploid (from Japan, China, Taiwan, Philippines, Malaysia), Beltz's flukes (from Japan, Korea), Miyazaki's flukes, Ohira's flukes, Small Ohira's flukes, Sado's flukes, Hirokuchi's flukes, Kericott's flukes, and Mexican肺flu虫。使用计算机软件Clustl V，对COI区域393碱基对及ITS2区域363碱基对进行了对齐分析。首先，日本韦斯特曼和贝尔茨肺flukes（COI和ITS2）之间几乎没有区别。然而，日本西部肺漏斗与其他三个亚洲人（菲律宾，泰国和马来西亚）的差异在COI地区显示36-46个碱基对，ITS2地区的碱基对36-46。人们认为这与不同物种之间的差异相对应。接下来，在三种ohira肺冲洗液，小ohira肺冲洗和sado肺冲洗中，在COI地区只有1-2个碱基对，在ITS2地区没有发现差异。该结果表明这三个物种是同义词。使用相邻的结合方法使用两个计算机软件Phylip和PAUP进行系统发育分析。 1）在日本，韦斯特曼肺燕子组和ohira肺燕子组各有一个集群； 2）Miyazaki肺燕子组和Ohira肺燕子组密切相关，而Westermann肺燕子组与其基部结合； 3）Hirokuchi肺燕子组与Miyazaki肺燕子组或ohira肺燕子组密切相关，但仍然不知道它是否是； 4）Kericott Lung Swallow与墨西哥肺燕子组密切相关，与亚洲肺燕子组相关。