核DNA及びミトコンドリアDNAから見た肺吸虫属の分子系統樹作成の試み

尝试从核DNA和线粒体DNA角度构建肺吸虫属分子系统发育树

基本信息

批准号：
08670272
负责人：
吾妻健
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
1996
资助国家：
日本
起止时间：
1996 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08670272/
关键词：
ミトコンドリアDNA COI ITS2 PCR 塩基配列分子系統樹肺吸虫

项目摘要

本研究では、アジアに生息する肺吸虫のミトコンドリアDNAのCOI領域と核DNAのITS2領域をPCR法にて増幅し、塩基配列を決定して、コンピューター解析により系統類縁分析を行なった。解析した肺吸虫は、ウエステルマン肺吸虫2倍体(日本産、中国産、台湾産、フィリピン産、マレーシア産)、ベルツ肺吸虫(日本産、韓国産)、宮崎肺吸虫、大平肺吸虫、小型大平肺吸虫、佐渡肺吸虫、ヒロクチ肺吸虫、ケリコット肺吸虫、メキシコ肺吸虫の9種14集団である。コンピューターソフトClustl Vを用いて、COI領域393塩基対、ITS2領域363塩基対のalignment解析を行なった結果、まず日本産のウエステルマン肺吸虫とベルツ肺吸虫の間では、COI、ITS2ともほとんど差は見られなかった。しかし、日本産ウエステルマン肺吸虫と他の3つのアジア産(フィリピン産、タイ産、マレーシア産)ウエステルマン肺吸虫の間では、COI領域で36-46塩基対またITS2領域で6-8塩基対の違いが見られた。これは、別種間の違いに相当すると考えられる。次に、大平肺吸虫、小型大平肺吸虫、佐渡肺吸虫の3種の間では、COI領域で1-2塩基対のみ、またITS2領域ではまったく違いが見られなかった。この結果は、これら3種がsynonymであることを示している。PhylipとPaupの2つのコンピューターソフトを用いて、近隣結合法により系統分析を行なった結果、1)日本産では、ウエステルマン肺吸虫グループと大平肺吸虫グループはそれぞれ1つのクラスターを形成する、2)宮崎肺吸虫と大平肺吸虫グループは近縁であり、ウエステルマン肺吸虫グループはそのベースに結合する、3)ヒロクチ肺吸虫は、宮崎肺吸虫か大平肺吸虫グループに近縁であるが、どちらであるかはまだ不明である、4)ケリコット肺吸虫はメキシコ肺吸虫に近縁であり、アジア産の肺吸虫とは、遠縁である。

在本研究中，我们通过PCR扩增了生活在亚洲的肺吸虫的线粒体DNA的COI区域和核DNA的ITS2区域，确定了核苷酸序列，并使用计算机分析进行了系统发育关系分析。分析的肺吸虫有韦斯特曼肺吸虫二倍体（来自日本、中国、台湾、菲律宾、马来西亚）、贝尔特肺吸虫（来自日本和韩国）、宫崎肺吸虫、大平肺吸虫和小型肺吸虫，共有14个种群，共9个。种类：大平肺吸虫、佐渡肺吸虫、广口肺吸虫、凯利科特肺吸虫和墨西哥肺吸虫。利用计算机软件Clustl V，我们对COI区域的393个碱基对和ITS2区域的363个碱基对进行比对分析，发现Westermann肺吸虫和Belt肺吸虫之间的COI和ITS2几乎没有差异。日本我没看到。然而，日本Westerman肺吸虫和其他三种亚洲Westerman肺吸虫（来自菲律宾、泰国和马来西亚）之间，COI区域有36-46个碱基对，而ITS2区域有6-8个碱基对。。这被认为对应于不同物种之间的差异。接下来，在大平肺吸虫、小大平肺吸虫和佐渡肺吸虫这三个物种中，在COI区域仅观察到1-2个碱基对，并且在ITS2区域没有观察到差异。这一结果表明这三个物种是同义词。通过使用 Phylip 和 Paup 两种计算机软件采用邻接法进行系统发育分析，我们发现： 1) 在日本，Westerman 肺吸虫群和 Ohira 肺吸虫群各形成一个簇； 2) Miyazaki 肺吸虫群；肺吸虫与大平肺吸虫群密切相关。其基部附有Westermann肺吸虫群；3）Hirokuchi肺吸虫群与Miyazaki肺吸虫群或Ohira肺吸虫群密切相关，但尚不清楚到底是哪一个；4）Kellicott肺吸虫群；肺吸虫与墨西哥肺吸虫关系密切，与亚洲肺吸虫关系较远。