HIRAーヒストン複合体の立体構造解析に基づいたヌクレオソーム構造変換機構の解明

基于HIRA-组蛋白复合物三维结构分析阐明核小体结构转换机制

基本信息

项目摘要

真核細胞生物のゲノムDNAは、数種類のピストンとの複合体であるヌクレオソーム構造を形成して核内にコンパクトに収納されている。このヌクレオソーム構造は、物理的、化学的損傷からDNAを保護する一方で、転写などのDNA上で起こる反応を抑制している。従って、生体内には遺伝子発現の要不要に応じて、特定の領域のヌクレオソーム構造を破壊したり再形成させたりする分子機構が存在する。しかし、その分子機構の詳細は未だ不明である。本研究では、ヒストンシャペロンHIRAがCIAと協調的に機能してヌクレオソームの再形成に関与するという知見に基づいてmRA一ヒストンーCIA複合体の立体構造を明らかにし、クロマチン構造変換の分子機構の解明を目指す。昨年度の研究から田RAを大腸菌で発現することができることがわかったので、本格的にHIRAの大量発現、精製系の確立に取り掛かった。その結果、ニッケルカラムとイオン交換カラムを用いることで、かなり高純度のmRAを2Lの大腸菌培養液からmgのレベルで精製することに成功した。次に、HIRAとピストンH3.3/H3.1などとの複合体の構造解析を行う上で必要なヒト由来ピストンH3.31H3.1などの大量発現系の確立を行った。発現は大腸菌で行った。この際、大腸菌における低頻度コドンを高頻度コドンに置換し効率のよい発現を目指した。H3.1-H4およびH3.3-H4の共発現系をそれぞれ作成しタグ精製を行ったところ、両者ともに複合体を精製することができた。以上述べた通り、田RAに加えピストンH3.1-H4,H3.3-H4複合体の精製に成功したので、今後はこれらの複合体をさらに組み合わせて結晶化をはじめとする物理化学解析を行っていく予定である。
真核生物的基因组DNA通过形成核小体结构紧凑地储存在细胞核中,核小体结构是由多种类型的活塞组成的复合体。这种核小体结构可以保护 DNA 免受物理和化学损伤,同时抑制 DNA 上发生的反应,例如转录。因此,在体内,存在一种分子机制,根据基因表达是否必要来破坏或重新形成特定区域的核小体结构。然而,其分子机制的细节仍不清楚。本研究基于组蛋白伴侣HIRA与CIA协同作用并参与核小体重组的知识,阐明了mRA-组蛋白-CIA复合物的三维结构,并阐明了染色质结构转变的分子机制。 。去年的研究表明,HIRA可以在大肠杆菌中表达,因此我们开始认真建立HIRA的大规模表达和纯化系统。结果,通过使用镍柱和离子交换柱,他们成功地从2L大肠杆菌培养液中将纯度极高的mRA纯化至毫克级。接下来,我们建立了人源活塞H3.31H3.1的大规模表达系统,这对于HIRA和活塞H3.3/H3.1之间的复合物的结构分析是必需的。在大肠杆菌中进行表达。此时,我们的目标是通过用高频密码子替换大肠杆菌中的低频密码子来高效表达。当我们创建 H3.1-H4 和 H3.3-H4 的共表达系统并进行标签纯化时,我们能够纯化两者的复合物。如上所述,除了TaRA之外,我们还成功纯化了活塞H3.1-H4和H3.3-H4复合物,因此将来我们将进一步组合这些复合物并进行结晶等物理化学分析。去那里。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Effect of leucine-to-methionine substitutions on the diffraction quality of histone chaperone SET/TAF-Ibeta/INHAT crystals
亮氨酸至蛋氨酸取代对组蛋白伴侣 SET/TAF-Ibeta/INHAT 晶体衍射质量的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    沖田結花里;鴨志田敦;鈴木裕之;伊東健;本橋ほづみ;五十嵐和彦;山本雅之;加藤光保;千田美紀
  • 通讯作者:
    千田美紀
Molecular mechanism of the site-specific histone eviction at active promoter regions.
活性启动子区域位点特异性组蛋白驱逐的分子机制。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Shomura;Y.;Shomura Y.;永野真吾;永野真吾;永野真吾;永野真吾;千田俊哉
  • 通讯作者:
    千田俊哉
組み換えピストン複合体の大量精製法
重组活塞复合物的质量纯化方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takayuki Suzuki;Toshihiko Ogura;夏目亮
  • 通讯作者:
    夏目亮
ヒストンシャペロンCAF-1とHIRAの大量発現系の構築
组蛋白伴侣CAF-1和HIRA大规模表达系统的构建
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鈴木一穂;田島寛隆;鈴木大介;川岸郁朗;奥脇暢;箱嶋敏雄;佐藤優花里
  • 通讯作者:
    佐藤優花里
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

千田 俊哉其他文献

糸状菌メロテルペノイドの複雑骨格構築に関わるα-ケトグルタル酸依存性ジオキシゲナーゼの構造機能解析
参与丝状真菌类萜复杂骨架构建的α-酮戊二酸依赖性双加氧酶的结构和功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    中嶋 優;森 貴裕;星野 翔太郎;岡田 正弘;淡川 孝義;千田 美紀;千田 俊哉;阿部 郁朗
  • 通讯作者:
    阿部 郁朗
糸状菌由来新規多機能型ヘム鉄ジオキシゲナーゼのX線結晶構造解析
一种源自丝状真菌的新型多功能血红素铁双加氧酶的 X 射线晶体结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    中嶋 優;森 貴裕;松田 侑大;星野 翔太郎;岡田 正弘;千田 美紀;千田 俊哉;阿部 郁朗
  • 通讯作者:
    阿部 郁朗
「日本中世の相続における文書の再検討」(口頭発表)
《中世纪日本继承文献的再审查》(口头报告)
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    中嶋 優;森 貴裕;松田 侑大;星野 翔太郎;岡田 正弘;千田 美紀;千田 俊哉;阿部 郁朗;巽昌子
  • 通讯作者:
    巽昌子
ヒトリソソーム性シアリダーゼNEU1の細胞内結晶化と解析
人溶酶体唾液酸酶 NEU1 的细胞内结晶和分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小祝 孝太郎,月本 準;東 哲也,山田 悠介,平木 雅彦,加藤 龍一;千田 俊哉;Leonard M. G. Chavas;伊藤 孝司,湯本 史明
  • 通讯作者:
    伊藤 孝司,湯本 史明
Sphingomonad科細菌の細胞外膜における植物由来芳香族化合物取り込みメカニズムの解明
阐明鞘氨醇单胞菌细胞外膜对植物来源芳香化合物的摄取机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    藤田 雅也;柴田 昴輝;菱山 正二郎;田辺 幹雄;千田 俊哉;上村 直史;政井 英司
  • 通讯作者:
    政井 英司

千田 俊哉的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('千田 俊哉', 18)}}的其他基金

LysR型転写制御因子CbnRの4次構造変化メカニズムの構造学的解明
LysR型转录调节因子CbnR四级结构变化机制的结构解析
  • 批准号:
    23K23827
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Mechanistic study of quaternary structure changes of a LysR- type transcriptional regulator
LysR型转录调节因子四级结构变化的机制研究
  • 批准号:
    22H02563
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
物理化学的解析に適した高分子量型クロマチン因子群の大量発現系の開発
开发适合理化分析的高分子量染色质因子的质量表达系统
  • 批准号:
    21657030
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
無酸素条件下における新規結晶化法の開発
缺氧条件下新结晶方法的开发
  • 批准号:
    18657036
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
2原子酸素添加酵素の反応中間体結晶構造に基づいた触媒反応機構解析
基于双加氧酶反应中间体晶体结构的催化反应机理分析
  • 批准号:
    15770077
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
gp120のX線結晶構造解析とその立体構造に基づいたHIV感染メカニズムの解明
gp120的X射线晶体结构分析及基于其三维结构阐明HIV感染机制
  • 批准号:
    12035207
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
gp120のX線結晶構造解析とその立体構造に基づいたHIVの感染メカニズムの解明
gp120的X射线晶体结构分析及基于其三维结构阐明HIV感染机制
  • 批准号:
    11161213
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
結晶構造解析によるノンヘム鉄を含む2原子酸素添加酵素LigABの反応機構解析
通过晶体结构分析含非血红素铁的双原子加氧酶LigAB的反应机理
  • 批准号:
    11780425
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
gp120のX線結晶構造解析とその立体構造に基づいたHIV感染メカニズムの解明
gp120的X射线晶体结构分析及基于其三维结构阐明HIV感染机制
  • 批准号:
    10180210
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
放線菌の細胞間情報伝達物質A-factorの受容体のX線結晶構造解析
放线菌细胞间信号递质A因子受体的X射线晶体结构分析
  • 批准号:
    09780543
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

高次クロマチン形成を介した遺伝子発現制御機構の解明
阐明高阶染色质形成介导的基因表达控制机制
  • 批准号:
    16J06850
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Reconstitution of mitotic chromosomes with purified factors
用纯化因子重建有丝分裂染色体
  • 批准号:
    26440012
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Elucidation of nucleosome structural changes based on histone modifications
基于组蛋白修饰阐明核小体结构变化
  • 批准号:
    24370052
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Analyses of centromeric chromatin structure
着丝粒染色质结构分析
  • 批准号:
    23770008
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
ヒストンH3バリアントとその相互作用因子によるクロマチン形成機構の解析
组蛋白H3变体染色质形成机制及其相互作用因素分析
  • 批准号:
    09J04280
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 3.84万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了