全ゲノム罹患同胞対連鎖解析及び候補遺伝子関連解析による心筋梗塞感受性遺伝子の同定

全基因组受影响同胞对连锁分析和候选基因关联分析鉴定心肌梗死易感基因

基本信息

批准号：
18018020
负责人：
横田充弘
金额：
$ 7.04万
依托单位：
Aichi Gakuin University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

「研究の目的」本研究の目的は、心筋梗塞(MI)・冠動脈疾患(CAD)罹患同胞対を対象としたゲノムワイド罹患同胞対連鎖解析により、MI責任遺伝子座を同定し、その領域内に存在する遺伝子(多型)について大規模症例-対照関連解析を実施し、MI感受性遺伝子を同定することである。「全ゲノム罹患同胞対連鎖解析」MI・CAD罹患同胞対(227対、457例)を対象として、405個のマイクロサテライトマーカーを用いたゲノムワイド連鎖解析(GWLS)を実施し、5染色体6領域に候補連鎖領域を得た。1領域以外の5領域は、国内外の他の論文で未だ報告されていない。さらに、この内の3領域(LOD>2.2)に20マーカーを追加、設定し、連鎖領域の確認と狭小化を実施した。なお、この解析で得られたmax.peak LOD score=2.9である。2番染色体候補連鎖領域に約3,000SNPsを設定し、高密度SNPタイピングをMI症例、対照各約500例で実施し、有力なMI候補遺伝子Aを発見した。現在、約4,000例以上の大規模関連解析を実施している。他の候補連鎖領域に関しても、同様に、大規模関連解析を実施する計画である。「今後の課題」現在、ゲノムワイド関連解析(GWAS)の研究支援を申請中である。受理されれば、GWLSとGWASが同時に可能となり、1)SNPを用いた連鎖解析の実施と、マイクロサテライトを用いた連鎖解析との比較、2)遺伝的素因の強い罹患同胞対症例と孤発例との感受性遺伝子の相同性、3)連鎖領域に位置する遺伝子の同時並行相関解析の実施、など、遺伝学的にも興味深い多面的な解析が可能になると考える。

“研究的目的” 本研究的目的是通过对受心肌梗塞 (MI) 和冠状动脉疾病 (CAD) 影响的同胞对进行全基因组连锁分析来确定导致 MI 的基因位点。是对现有基因（多态性）进行大规模病例对照关联分析，识别心肌梗死易感基因。 “全基因组受影响的兄弟姐妹连锁分析” 我们使用 405 个微卫星标记对 MI/CAD 受影响的兄弟姐妹对（227 对，457 例）进行全基因组连锁分析（GWLS），并分析了 5 个染色体和 6 个区域，获得了候选链区域。。其他五个领域尚未在任何其他国内外论文中报道。此外，在其中 3 个区域（LOD>2.2）中添加并设置了 20 个标记，以确认并缩小连锁区域。请注意，此分析中获得的最大峰值 LOD 得分为 2.9。在2号染色体候选连锁区设置约3000个SNP，对约500例MI病例和对照进行高密度SNP分型，发现强MI候选基因A。目前，我们正在对4000多个案例进行大规模关联分析。我们计划对其他候选连锁区域进行类似的大规模关联分析。 “未来的挑战” 我们目前正在申请全基因组关联分析（GWAS）的研究支持。如果被接受，GWLS 和 GWAS 将同时成为可能，1）使用 SNP 进行连锁分析，并与使用微卫星的连锁分析进行比较，2）具有强烈遗传易感性的受影响兄弟姐妹与病例和散发病例的比较。进行遗传上有趣的多方面分析，例如易感基因与其他示例的同源性，以及3）位于连锁区域的基因的并发相关性分析。