全ゲノム罹患同胞対連鎖解析及び候補遺伝子関連解析による心筋梗塞感受性遺伝子の同定

全基因组受影响同胞对连锁分析和候选基因关联分析鉴定心肌梗死易感基因

基本信息

批准号：
20018026
负责人：
横田充弘
金额：
$ 6.27万
依托单位：
Aichi Gakuin University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

「研究の目的」本研究の目的は、心筋梗塞(MI)・冠動脈疾患(CAD)罹患同胞対を対象としたゲノムワイド罹患同胞対連鎖解析により、MI責任遺伝子座を同定し、その領域内に存在する遺伝子(多型)について大規模症例一対照関連解析を実施し、MI感受性遺伝子を同定することである。「全ゲノム罹患同胞対連鎖解析」MI・CAD罹患同胞対(227対、457例)を対象として、405個のマイクロサテライトマーカーを用いたゲノムワイド連鎖解析(GWLS)を実施し、5染色体6領域に候補連鎖領域を得た。1領域以外の5領域は、国内外の他の論文で未だ報告されていない。さらに、この内の3領域(LOD>2.2)に20マーカーを追加、設定し、連鎖領域の確認と狭小化を実施した。なお、この解析で得られたmax. peak LOD score=2.9である。2番染色体候補連鎖領域に約3,000SNPsを設定し、高密度SNPタイピングをMI症例、対照各約500例で実施し、有力なMI候補遺伝子Aを発見した。現在、約4,000例以上の大規模関連解析を実施している。他の候補連鎖領域に関しても、同様に、大規模関連解析を実施する計画である。「今後の課題」MI・CAD罹患同胞対も含めたGWASを行い1)SNPを用いた連鎖解析の実施と、マイクロサテライトを用いた連鎖解析との比較、2)遺伝的素因の強い罹患同胞対症例と孤発例との感受性遺伝子の相同性、3)連鎖領域に位置する遺伝子の同時並行相関解析の実施、など、遺伝学的にも興味深い多面的な解析が可能になると考える。

“研究的目的” 本研究的目的是通过对受心肌梗塞 (MI) 和冠状动脉疾病 (CAD) 影响的同胞对进行全基因组连锁分析来确定导致 MI 的基因位点。是对现有基因（多态性）进行大规模病例一对照关联分析，识别心肌梗死易感基因。 “全基因组受影响的兄弟姐妹连锁分析” 我们使用 405 个微卫星标记对 MI/CAD 受影响的兄弟姐妹对（227 对，457 例）进行全基因组连锁分析（GWLS），并分析了 5 个染色体和 6 个区域，获得了候选链区域。。其他五个领域尚未在任何其他国内外论文中报道。此外，在其中 3 个区域（LOD>2.2）中添加并设置了 20 个标记，以确认并缩小连锁区域。请注意，此分析中获得的最大峰值 LOD 分数为 2.9。在2号染色体候选连锁区设置约3000个SNP，对约500例MI病例和对照进行高密度SNP分型，发现强MI候选基因A。目前，我们正在对4000多个案例进行大规模关联分析。我们计划对其他候选连锁区域进行类似的大规模关联分析。 “未来的问题” 我们将使用 MI/CAD 进行 GWAS，包括 1) 使用 SNP 的连锁分析和使用微卫星的连锁分析，2) 具有强烈遗传倾向的受影响的同胞对。遗传上有趣的分析，例如病例和散发病例之间易感基因的同源性，以及3）位于连锁区域的基因的平行相关分析。

项目成果

期刊论文数量（32）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Combined effects of losartan and hydrochotothiazzide on cardiac remodeling and function in Dahl salt-sensitive hypertensive rats

氯沙坦和氢氯噻嗪对 Dahl 盐敏感性高血压大鼠心脏重塑和功能的联合影响

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
Nakamura;S. Narumi;T. Yoshiz ato;S-I. Tsutsui;K-I. Iijima;T;Ken Harada;松田侑大;Masakazu Kobayashi;徳永欽也;Akiko Noda;伊藤崇敬;横里充弘;徳永欽也;小林正和;松田侑大;Hisashi Umeda;Isao Fujii;Kazumasa Unno;藤井勲;Yuichiro Yamada
通讯作者：
Yuichiro Yamada

軽中等症の拡張型心筋症におけるドブタミン誘発性機械的交互脈の意義

多巴酚丁胺诱导的机械交替在轻中度扩张型心肌病中的意义

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
Noda A;Izawa H;Asano H;Nakata S;Hirashiki A;Murase Y;Iino S;Nagata K;Murohara T;Koike Y;Yokota M.;Hirashiki A;Okumura T;Hirashiki A;Hirashiki A;Okumura T;Hirashiki A;Ohshima K;Unno K;Unno K;Kobayashi M;Kobayashi M;平敷安希博
通讯作者：
平敷安希博

Plasma resistin concentration determined by common variants in the resistin gene and associated with metabolic traits in an aged Japanese population