全ゲノム罹患同胞対連鎖解析及び候補遺伝子関連解析による心筋梗塞感受性遺伝子の同定

全基因组受影响同胞对连锁分析和候选基因关联分析鉴定心肌梗死易感基因

基本信息

  • 批准号:
    20018026
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 6.27万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2008
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2008 至 2009
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

「研究の目的」本研究の目的は、心筋梗塞(MI)・冠動脈疾患(CAD)罹患同胞対を対象としたゲノムワイド罹患同胞対連鎖解析により、MI責任遺伝子座を同定し、その領域内に存在する遺伝子(多型)について大規模症例一対照関連解析を実施し、MI感受性遺伝子を同定することである。「全ゲノム罹患同胞対連鎖解析」MI・CAD罹患同胞対(227対、457例)を対象として、405個のマイクロサテライトマーカーを用いたゲノムワイド連鎖解析(GWLS)を実施し、5染色体6領域に候補連鎖領域を得た。1領域以外の5領域は、国内外の他の論文で未だ報告されていない。さらに、この内の3領域(LOD>2.2)に20マーカーを追加、設定し、連鎖領域の確認と狭小化を実施した。なお、この解析で得られたmax. peak LOD score=2.9である。2番染色体候補連鎖領域に約3,000SNPsを設定し、高密度SNPタイピングをMI症例、対照各約500例で実施し、有力なMI候補遺伝子Aを発見した。現在、約4,000例以上の大規模関連解析を実施している。他の候補連鎖領域に関しても、同様に、大規模関連解析を実施する計画である。「今後の課題」MI・CAD罹患同胞対も含めたGWASを行い1)SNPを用いた連鎖解析の実施と、マイクロサテライトを用いた連鎖解析との比較、2)遺伝的素因の強い罹患同胞対症例と孤発例との感受性遺伝子の相同性、3)連鎖領域に位置する遺伝子の同時並行相関解析の実施、など、遺伝学的にも興味深い多面的な解析が可能になると考える。
这项研究的目的是“研究的目标”是通过对心肌梗死(MI)和受冠状动脉疾病(CAD)影响的同级姐妹对确定MI负责任的基因座,并执行与该区域内基因(聚合物)相关的大规模病例对照分析(多晶型)和MI ISCEST中的基因(聚合物)。 “全基因组影响的兄弟姐妹与链接分析”“基因组链接分析(GWLS)使用405个微卫星标记在具有MI和CAD的5个染色体6区域中进行了MI和CAD(227对,457例,457例),并获得了候选链接区域。在国内和国际上,尚未在其他论文中报告以外的五个领域。此外,添加了20个标记,并将其设置为其中三个区域(LOD> 2.2),并检查并缩小了链区域。从此分析获得的最大峰值LOD得分为2.9。在2染色体候选连接区域中设置了大约3,000个SNP,并在大约500 MI病例和对照中进行了高密度SNP键入,并发现了有希望的MI候选基因A。目前,我们正在进行大规模相关的分析4,000多个病例。同样,将针对其他候选链区域进行大规模相关的分析。 “未来挑战”我们将与MI和CAD进行兄弟姐妹进行GWAS,并使用微卫星进行链接分析,2)易感基因的同源性基因在患病的兄弟姐妹病例之间具有高度遗传性倾向和孤立的病例,以及3)进行同时对位于连锁区域中的阶层的平行相关性分析。

项目成果

期刊论文数量(32)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Combined effects of losartan and hydrochotothiazzide on cardiac remodeling and function in Dahl salt-sensitive hypertensive rats
氯沙坦和氢氯噻嗪对 Dahl 盐敏感性高血压大鼠心脏重塑和功能的联合影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nakamura;S. Narumi;T. Yoshiz ato;S-I. Tsutsui;K-I. Iijima;T;Ken Harada;松田侑大;Masakazu Kobayashi;徳永欽也;Akiko Noda;伊藤崇敬;横里充弘;徳永欽也;小林正和;松田侑大;Hisashi Umeda;Isao Fujii;Kazumasa Unno;藤井勲;Yuichiro Yamada
  • 通讯作者:
    Yuichiro Yamada
軽中等症の拡張型心筋症におけるドブタミン誘発性機械的交互脈の意義
多巴酚丁胺诱导的机械交替在轻中度扩张型心肌病中的意义
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Noda A;Izawa H;Asano H;Nakata S;Hirashiki A;Murase Y;Iino S;Nagata K;Murohara T;Koike Y;Yokota M.;Hirashiki A;Okumura T;Hirashiki A;Hirashiki A;Okumura T;Hirashiki A;Ohshima K;Unno K;Unno K;Kobayashi M;Kobayashi M;平敷安希博
  • 通讯作者:
    平敷安希博
Plasma resistin concentration determined by common variants in the resistin gene and associated with metabolic traits in an aged Japanese population
  • DOI:
    10.1007/s00125-009-1517-2
  • 发表时间:
    2010-02-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    8.2
  • 作者:
    Asano, H.;Izawa, H.;Yokota, M.
  • 通讯作者:
    Yokota, M.
Reduced [123I] metaiodobenzylguanidine Uptake Predicts Impaired Adrenergic Myocardial Functional Reserve in Asymptomatic or Mildly Symptomatic Patients with Idiopathic Dilated Cardiomyopathy
[123I]间碘苄胍摄取减少预示无症状或轻度症状特发性扩张型心肌病患者肾上腺素能心肌功能储备受损
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kobayashi M;Izawa H;et.al.
  • 通讯作者:
    et.al.
拡張型心筋症における、ドブタミン負荷に対する心筋収縮特定応答低下の分子病態生理学的機序の解明
阐明扩张型心肌病中多巴酚丁胺负荷降低心肌收缩特异性反应的分子病理生理学机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nakamura;S. Narumi;T. Yoshiz ato;S-I. Tsutsui;K-I. Iijima;T;Ken Harada;松田侑大;Masakazu Kobayashi;徳永欽也;Akiko Noda;伊藤崇敬;横里充弘;徳永欽也;小林正和
  • 通讯作者:
    小林正和
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  • 影响因子:
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  • 通讯作者:
    砂川 博史
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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    $ 6.27万
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知道了