A validation epidemiological study of a comprehensive risk algorithm for lifestyle-related diseases in a community-based population

社区人群生活方式相关疾病综合风险算法的验证流行病学研究

• 批准号: 21H03206
• 负责人: 横田 充弘
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: Kurume University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03206/
• 关键词: 生活習慣病; GWAS; EWAS; miRNA; ゲノム疫学

高齢化社会を迎えた現在の我が国において、循環器疾患を含む生活習慣病に対する予防法の確立は、医学・医療における重要な課題となっている。本研究では、過去に我々が蓄積してきた横断研究基盤を用いて、ゲノムワイド関連解析およびゲノムワイドDNAメチル化解析により冠動脈疾患・心筋梗塞、２型糖尿病、高血圧症、肥満の４大生活習慣病のリスクマーカーを同定し、従来の古典的リスクマーカーを統合したリスク診断アルゴリズムを確立する。さらに、microRNAに着目し、高血圧症罹患後の心疾患および脳血管疾患の発症と関連する候補血清microRNAを同定することを目的とする。SNPデータを対象とした解析では、国際コンソーシアムに参画し、体格情報と関連するSNPの同定に成功した。今後これらの成果を基に、予測モデルの開発に貢献していく。DNAメチル化データを対象とした解析では、公開されている国際コンソーシアムで報告されているDNAメチル化サイトについて我々のデータで再現性を確認した。その結果、生活習慣病と関わりの深い血中尿酸値と関連するDNAメチル化サイトのうち、16か所について有意(P<0.05)の関連を確認できた。今後これらの成果を基に、予測モデルの開発に寄与していく。心疾患のmicroRNAの探索については、Agilent SurePrint G3 Human miRNAアレイを用いて、我々がこれまでに蓄積してきたコホート検体から冠動脈疾患既往者20名、対照群20名を対象に昨年度取得したmiRNAデータの詳細な分析を開始した。miRNAプロファイルの変動要因を調べたところ、検体採取年時期がプロファイルの違いに寄与していた。そこで、検体採取時期で補正をしたうえで、冠動脈疾患患者と対照群間で差のあるmiRNAを探索した。方法にはlimmaを使用した。その結果、２種類のmiRNAが有意(P<0.05)な濃度差を示した。今後は同定した2種類のmiRNAについて詳細な分析を行う。

在目前面临老龄化社会的日本，建立包括心血管疾病在内的与生活方式相关的疾病的预防方法已成为医学和医疗保健中的重要课题。在这项研究中，我们将利用我们过去积累的横断面研究基础设施，通过全基因组关联分析来识别四种与生活方式相关的主要疾病：冠状动脉疾病/心肌梗塞、2型糖尿病、高血压和肥胖。我们将识别风险标记并建立整合传统和经典风险标记的风险诊断算法。此外，我们将重点关注 microRNA，旨在鉴定与高血压后心脏病和脑血管疾病发病相关的候选血清 microRNA。在SNP数据分析中，我们参与了国际联盟，成功鉴定了与身体体质信息相关的SNP。未来，我们将根据这些结果为预测模型的开发做出贡献。在 DNA 甲基化数据分析中，我们使用我们的数据证实了公开的国际联盟报告的 DNA 甲基化位点的可重复性。结果证实，16个DNA甲基化位点与血尿酸水平存在显着相关性（P<0.05），而血尿酸水平与生活方式相关疾病密切相关。未来，我们将根据这些结果为预测模型的开发做出贡献。关于寻找与心脏病相关的 microRNA，我们使用 Agilent SurePrint G3 人类 miRNA 阵列收集了去年从我们积累的队列样本中获得的 20 名有冠状动脉疾病史的受试者和 20 名对照组受试者的 miRNA 数据到目前为止，详细的分析已经开始。当我们研究导致 miRNA 图谱变化的因素时，我们发现样本采集年份导致了图谱的差异。因此，我们在校正样本采集时间后，寻找冠状动脉疾病患者和对照组之间存在差异的 miRNA。我使用 limma 作为方法。结果，两种类型的miRNA在浓度上表现出显着的差异（P<0.05）。未来，我们将对我们鉴定出的两类miRNA进行详细分析。

项目成果

The power of genetic diversity in genome-wide association studies of lipids.

• DOI: 10.1038/s41586-021-04064-3
• 发表时间: 2021-12
• 期刊: Nature
• 影响因子: 64.8
• 作者: Graham SE;Clarke SL;Wu KH;Kanoni S;Zajac GJM;Ramdas S;Surakka I;Ntalla I;Vedantam S;Winkler TW;Locke AE;Marouli E;Hwang MY;Han S;Narita A;Choudhury A;Bentley AR;Ekoru K;Verma A;Trivedi B;Martin HC;Hunt KA;Hui Q;Klarin D;Zhu X;Thorleifsson G;Helgadottir A;Gudbjartsson DF;Holm H;Olafsson I;Akiyama M;Sakaue S;Terao C;Kanai M;Zhou W;Brumpton BM;Rasheed H;Ruotsalainen SE;Havulinna AS;Veturi Y;Feng Q;Rosenthal EA;Lingren T;Pacheco JA;Pendergrass SA;Haessler J;Giulianini F;Bradford Y;Miller JE;Campbell A;Lin K;Millwood IY;Hindy G;Rasheed A;Faul JD;Zhao W;Weir DR;Turman C;Huang H;Graff M;Mahajan A;Brown MR;Zhang W;Yu K;Schmidt EM;Pandit A;Gustafsson S;Yin X;Luan J;Zhao JH;Matsuda F;Jang HM;Yoon K;Medina-Gomez C;Pitsillides A;Hottenga JJ;Willemsen G;Wood AR;Ji Y;Gao Z;Haworth S;Mitchell RE;Chai JF;Aadahl M;Yao J;Manichaikul A;Warren HR;Ramirez J;Bork-Jensen J;Kårhus LL;Goel A;Sabater-Lleal M;Noordam R;Sidore C;Fiorillo E;McDaid AF;Marques-Vidal P;Wielscher M;Trompet S;Sattar N;Møllehave LT;Thuesen BH;Munz M;Zeng L;Huang J;Yang B;Poveda A;Kurbasic A;Lamina C;Forer L;Scholz M;Galesloot TE;Bradfield JP;Daw EW;Zmuda JM;Mitchell JS;Fuchsberger C;Christensen H;Brody JA;Feitosa MF;Wojczynski MK;Preuss M;Mangino M;Christofidou P;Verweij N;Benjamins JW;Engmann J;Kember RL;Slieker RC;Lo KS;Zilhao NR;Le P;Kleber ME;Delgado GE;Huo S;Ikeda DD;Iha H;Yang J;Liu J;Leonard HL;Marten J;Schmidt B;Arendt M;Smyth LJ;Cañadas-Garre M;Wang C;Nakatochi M;Wong A;Hutri-Kähönen N;Sim X;Xia R;Huerta-Chagoya A;Fernandez-Lopez JC;Lyssenko V;Ahmed M;Jackson AU;Yousri NA;Irvin MR;Oldmeadow C;Kim HN;Ryu S;Timmers PRHJ;Arbeeva L;Dorajoo R;Lange LA;Chai X;Prasad G;Lorés-Motta L;Pauper M;Long J;Li X;Theusch E;Takeuchi F;Spracklen CN;Loukola A;Bollepalli S;Warner SC;Wang YX;Wei WB;Nutile T;Ruggiero D;Sung YJ;Hung YJ;Chen S;Liu F;Yang J;Kentistou KA;Gorski M;Brumat M;Meidtner K;Bielak LF;Smith JA;Hebbar P;Farmaki AE;Hofer E;Lin M;Xue C;Zhang J;Concas MP;Vaccargiu S;van der Most PJ;Pitkänen N;Cade BE;Lee J;van der Laan SW;Chitrala KN;Weiss S;Zimmermann ME;Lee JY;Choi HS;Nethander M;Freitag-Wolf S;Southam L;Rayner NW;Wang CA;Lin SY;Wang JS;Couture C;Lyytikäinen LP;Nikus K;Cuellar-Partida G;Vestergaard H;Hildalgo B;Giannakopoulou O;Cai Q;Obura MO;van Setten J;Li X;Schwander K;Terzikhan N;Shin JH;Jackson RD;Reiner AP;Martin LW;Chen Z;Li L;Highland HM;Young KL;Kawaguchi T;Thiery J;Bis JC;Nadkarni GN;Launer LJ;Li H;Nalls MA;Raitakari OT;Ichihara S;Wild SH;Nelson CP;Campbell H;Jäger S;Nabika T;Al-Mulla F;Niinikoski H;Braund PS;Kolcic I;Kovacs P;Giardoglou T;Katsuya T;Bhatti KF;de Kleijn D;de Borst GJ;Kim EK;Adams HHH;Ikram MA;Zhu X;Asselbergs FW;Kraaijeveld AO;Beulens JWJ;Shu XO;Rallidis LS;Pedersen O;Hansen T;Mitchell P;Hewitt AW;Kähönen M;Pérusse L;Bouchard C;Tönjes A;Chen YI;Pennell CE;Mori TA;Lieb W;Franke A;Ohlsson C;Mellström D;Cho YS;Lee H;Yuan JM;Koh WP;Rhee SY;Woo JT;Heid IM;Stark KJ;Völzke H;Homuth G;Evans MK;Zonderman AB;Polasek O;Pasterkamp G;Hoefer IE;Redline S;Pahkala K;Oldehinkel AJ;Snieder H;Biino G;Schmidt R;Schmidt H;Chen YE;Bandinelli S;Dedoussis G;Thanaraj TA;Kardia SLR;Kato N;Schulze MB;Girotto G;Jung B;Böger CA;Joshi PK;Bennett DA;De Jager PL;Lu X;Mamakou V;Brown M;Caulfield MJ;Munroe PB;Guo X;Ciullo M;Jonas JB;Samani NJ;Kaprio J;Pajukanta P;Adair LS;Bechayda SA;de Silva HJ;Wickremasinghe AR;Krauss RM;Wu JY;Zheng W;den Hollander AI;Bharadwaj D;Correa A;Wilson JG;Lind L;Heng CK;Nelson AE;Golightly YM;Wilson JF;Penninx B;Kim HL;Attia J;Scott RJ;Rao DC;Arnett DK;Hunt SC;Walker M;Koistinen HA;Chandak GR;Yajnik CS;Mercader JM;Tusié-Luna T;Aguilar-Salinas CA;Villalpando CG;Orozco L;Fornage M;Tai ES;van Dam RM;Lehtimäki T;Chaturvedi N;Yokota M;Liu J;Reilly DF;McKnight AJ;Kee F;Jöckel KH;McCarthy MI;Palmer CNA;Vitart V;Hayward C;Simonsick E;van Duijn CM;Lu F;Qu J;Hishigaki H;Lin X;März W;Parra EJ;Cruz M;Gudnason V;Tardif JC;Lettre G;'t Hart LM;Elders PJM;Damrauer SM;Kumari M;Kivimaki M;van der Harst P;Spector TD;Loos RJF;Province MA;Psaty BM;Brandslund I;Pramstaller PP;Christensen K;Ripatti S;Widén E;Hakonarson H;Grant SFA;Kiemeney LALM;de Graaf J;Loeffler M;Kronenberg F;Gu D;Erdmann J;Schunkert H;Franks PW;Linneberg A;Jukema JW;Khera AV;Männikkö M;Jarvelin MR;Kutalik Z;Cucca F;Mook-Kanamori DO;van Dijk KW;Watkins H;Strachan DP;Grarup N;Sever P;Poulter N;Rotter JI;Dantoft TM;Karpe F;Neville MJ;Timpson NJ;Cheng CY;Wong TY;Khor CC;Sabanayagam C;Peters A;Gieger C;Hattersley AT;Pedersen NL;Magnusson PKE;Boomsma DI;de Geus EJC;Cupples LA;van Meurs JBJ;Ghanbari M;Gordon-Larsen P;Huang W;Kim YJ;Tabara Y;Wareham NJ;Langenberg C;Zeggini E;Kuusisto J;Laakso M;Ingelsson E;Abecasis G;Chambers JC;Kooner JS;de Vries PS;Morrison AC;North KE;Daviglus M;Kraft P;Martin NG;Whitfield JB;Abbas S;Saleheen D;Walters RG;Holmes MV;Black C;Smith BH;Justice AE;Baras A;Buring JE;Ridker PM;Chasman DI;Kooperberg C;Wei WQ;Jarvik GP;Namjou B;Hayes MG;Ritchie MD;Jousilahti P;Salomaa V;Hveem K;Åsvold BO;Kubo M;Kamatani Y;Okada Y;Murakami Y;Thorsteinsdottir U;Stefansson K;Ho YL;Lynch JA;Rader DJ;Tsao PS;Chang KM;Cho K;O'Donnell CJ;Gaziano JM;Wilson P;Rotimi CN;Hazelhurst S;Ramsay M;Trembath RC;van Heel DA;Tamiya G;Yamamoto M;Kim BJ;Mohlke KL;Frayling TM;Hirschhorn JN;Kathiresan S;VA Million Veteran Program;Global Lipids Genetics Consortium*;Boehnke M;Natarajan P;Peloso GM;Brown CD;Morris AP;Assimes TL;Deloukas P;Sun YV;Willer CJ
• 通讯作者: Willer CJ

血中レジスチン濃度の人種横断型エピゲノムワイドメタ解析による新規DNAメチル化サイトの同定

通过血液抵抗素浓度的跨种族表观基因组荟萃分析鉴定新的 DNA 甲基化位点

• 发表时间: 2023
• 作者: 中杤昌弘;市原佐保子;山本 健;大中佳三;松原達昭;横田充弘
• 通讯作者: 横田充弘

喫煙によりDNAメチル化が低下するゲノム領域のマウス相同領域におけるメチル化解析

小鼠基因组区域同源区域的甲基化分析，其中 DNA 甲基化因吸烟而降低

• 发表时间: 2023
• 作者: 三瀬名丹;中杤昌弘;松原達昭;横田充弘;山本健;市原佐保子
• 通讯作者: 市原佐保子

Identification of DNA methylation sites by a trans-ethnic epigenome-wide meta-analysis for circulating resistin levels

通过跨种族表观基因组范围内循环抵抗素水平荟萃分析鉴定 DNA 甲基化位点

• 发表时间: 2022
• 作者: 2.Masahiro Nakatochi;Sahoko Ichihara;Ken Yamamoto;Keizo Ohnaka;Tatsuaki Matsubara;Mitsuhiro Yokota
• 通讯作者: Mitsuhiro Yokota