候補遺伝子アプローチによるIPMN感受性遺伝子のGENE-BASED相関検定

使用候选基因方法进行 IPMN 易感基因的基于基因的相关性测试

基本信息

批准号：
18659387
负责人：
田中雅夫
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18659387/
关键词：
IPMN 膵癌遺伝子多型相関解析発がん感受性

项目摘要

我が国や先進欧米各国において、膵癌は最も予後不良な癌であり、その解決のためには、膵癌発症関連遺伝子の同定が急務である。膵癌は複数の遺伝要因と環境要因の相互作用によって発症する多因子疾患であり、これまで、国際的にもいくつかの発症関連候補遺伝子が報告されたが、相反する結果も示され、未だ明確な答えが得られていない。その大きな原因の一つは、膵癌の遺伝的異質性にあり、したがって、通常型膵癌をはじめ、他臓器癌を高率に合併する易発癌性を示すIPMN症例に解析対象を特化したゲノム解析が、膵癌発症関連遺伝子解明の端緒となる。平成18年度は、IPMN発症感受性を規定する遺伝要因を探索する目的で、膵がんを含め、種々のがんにおいて発がんの遺伝要因となる可能性が報告されている候捕遺伝子多型について相関検定を実施した。具体的には、TP53、MTHFR、PPARG、IGFBP3、STKI5、MBD4、ADPRT、XRCC1、OGG1、APC、MMP2、STCH、ODC、MMP7計14遺伝子の主に遺伝子機能変化を伴うcSNPについて、IPMN患者群215名、健常対照群476名を対象としてTaqMan法によるSNPタイピングを実施し、こ群間における対立遺伝子頻度分布、遺伝子型頻度分布の差異をカイ2乗検定により検定した。その結果、対立遺伝子頻度分布、および、遺伝子型頻度分布の何れにおいても、有意差を認める遺伝子多型は同定されなかった。したがって、今回対象とした遺伝子多型は、IPMNの遺伝背景を説明するものではないと考えられた。今後も、候補遺伝子解析を継続するが、優先遺伝子として、STK11、BRCA2、SPINK1、PRSS1を挙げる。これらについては、今回解析した遺伝子群とは異なり、主として遺伝子領域にマーカーSNPを設定し、連鎖不平衡を利用した相関解析を実施する。

在日本和美国和欧洲，胰腺癌是最可预测的癌症，迫切需要对胰腺癌相关的基因的鉴定来解决该基因。胰腺癌是由多种遗传因素和环境因素的相互作用引起的多方面疾病，并且在国际上报道了一些国际候选基因，但已被证明是矛盾的，但仍未得到答案。主要原因之一是对IPMN病例的遗传分析，这表明将正常的胰腺癌和其他器官以及胰腺癌的遗传假设结合起来。阐明胰腺癌的发作。在2006财年，为了探索规定IPMN发作的遗传因素，据报道，它是包括胰腺癌在内的各种癌症的遗传因素，并进行了低音类型的相关性。具体而言，TP53，MTHFR，PPARG，IGFBP3，STKI5，MBD4，ADPRT，XRCC1，XRCC1，XRCC1，OGG1，OGG1，APC，APC，APC，MMP2，ODC，ODC，MMP7 CSNP具有基因，主要随基因变化而变化，遗传变化，IPMN患者215 snp the snp the snp the snp the snp the snp the snp the snp the snp the snp the snp the snp the snp the snp the snp p. TAQMAN方法用于476个名称和健康控制组，以及对对抗性基因频率分布与两组之间的遗传频率分布之间的差异。结果，在任何对抗性基因频率分布和遗传频率分布中都没有鉴定出识别出显着差异的遗传多态性类型。因此，认为这次靶向的基因多形型不能解释IPMN的遗传背景。将来，候选基因分析将继续，但是STK11，BRCA2，SPINK1和PRSS1将被列为优先基因。与这次分析的基因组不同，标记SNP主要设置在遗传区域中，并进行了使用链内源的相关分析。