候補遺伝子アプローチによるIPMN感受性遺伝子のGENE-BASED相関検定

使用候选基因方法进行 IPMN 易感基因的基于基因的相关性测试

• 批准号: 18659387
• 负责人: 田中 雅夫
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18659387/
• 关键词: IPMN; 膵癌; 遺伝子多型; 相関解析; 発がん感受性; IPMN; 膵癌; 遺伝子多型; 相関解析; 発がん感受性

我が国や先進欧米各国において、膵癌は最も予後不良な癌であり、その解決のためには、膵癌発症関連遺伝子の同定が急務である。膵癌は複数の遺伝要因と環境要因の相互作用によって発症する多因子疾患であり、これまで、国際的にもいくつかの発症関連候補遺伝子が報告されたが、相反する結果も示され、未だ明確な答えが得られていない。その大きな原因の一つは、膵癌の遺伝的異質性にあり、したがって、通常型膵癌をはじめ、他臓器癌を高率に合併する易発癌性を示すIPMN症例に解析対象を特化したゲノム解析が、膵癌発症関連遺伝子解明の端緒となる。平成18年度は、IPMN発症感受性を規定する遺伝要因を探索する目的で、膵がんを含め、種々のがんにおいて発がんの遺伝要因となる可能性が報告されている候捕遺伝子多型について相関検定を実施した。具体的には、TP53、MTHFR、PPARG、IGFBP3、STKI5、MBD4、ADPRT、XRCC1、OGG1、APC、MMP2、STCH、ODC、MMP7計14遺伝子の主に遺伝子機能変化を伴うcSNPについて、IPMN患者群215名、健常対照群476名を対象としてTaqMan法によるSNPタイピングを実施し、こ群間における対立遺伝子頻度分布、遺伝子型頻度分布の差異をカイ2乗検定により検定した。その結果、対立遺伝子頻度分布、および、遺伝子型頻度分布の何れにおいても、有意差を認める遺伝子多型は同定されなかった。したがって、今回対象とした遺伝子多型は、IPMNの遺伝背景を説明するものではないと考えられた。今後も、候補遺伝子解析を継続するが、優先遺伝子として、STK11、BRCA2、SPINK1、PRSS1を挙げる。これらについては、今回解析した遺伝子群とは異なり、主として遺伝子領域にマーカーSNPを設定し、連鎖不平衡を利用した相関解析を実施する。

胰腺癌是日本和发达西部地区最糟糕的癌症，为了解决这个问题，迫切需要识别与胰腺癌发展有关的基因。胰腺癌是由多种遗传和环境因素的相互作用引起的多因素疾病，尽管在国际上已经报道了几种与发作相关的候选基因，但也表明了矛盾的结果，并且尚未获得明确的答案。主要原因之一是胰腺癌的遗传异质性，因此，基因组分析专门用于分析表现出易于致癌性的IPMN病例，包括常规胰腺癌，是阐明与胰腺癌开发相关的基因的开始。在2006年，我们对青少年多态性进行了相关测试，据报道，这是包括胰腺癌在内的各种癌症中癌症的潜在遗传因素，目的是探索控制IPMN发作易感性的遗传因素。具体而言，针对TP53，MTHFR，PPARG，IGFBP3，STKI5，MBD4，ADPRT，XRCC1，OGG1，APC，MMP2，MMP2，MMP2，STCH，ODC和MMP7，使用TAQMAN MATER ENTRAL COMM NORTAR COMM NORTAR COMM NORTAMET and 215 IPM NORTAR在TP53，MTHFR，PPARG，IGFBP3，STKI5，MBD4，MBD4，XRCC1，OGG1，MMP7，SNP频率和215 ipm National taqman Mection and 215 ipm and 215 ipm的患者中，对于具有主要改变基因功能的CSNP。使用卡方检验对这些组之间的分布和基因型频率分布进行了测试。结果，在等位基因频率分布或基因型频率分布中未发现显着差异。因此，人们认为这次我们针对的遗传多态性并不能解释IPMN的遗传背景。我们将来将继续分析候选基因，但我们将列出优先基因，例如STK11，BRCA2，SPINK1和PRSS1。与这次分析的基因组不同，标记SNP主要设置在基因区域中，并使用链接不平衡进行相关分析。