乳がんゲノム遺伝子変異の不均一性及び幹細胞階層性の1細胞レベル統合解明
单细胞水平综合阐明乳腺癌基因组基因突变异质性和干细胞层次结构
基本信息
- 批准号:21H02761
- 负责人:
- 金额:$ 11.15万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
乳がんPDXを用いた、細胞分画ごとの1細胞微量RNAシークエンス解析より得られる、機能的ヒエラルキーの解析を行った。本研究ではトリプルネガティブタイプ乳がんに焦点を絞った。5検体を用いて10xGenomicsとFluidumのC1 single cell-prep systemにより微量RNAシークエンスを行った。SEURAT (https://satijalab.org/seurat/)を用いたバイオインフォマティクス解析を行ったその結果、親玉がん幹細胞と通常のがん幹細胞を区別できる膜タンパク質FXYD3の同定に成功した(in preparation)。NP1もしくはIGF1Rと組み合わせ、IGF1Rhigh FXYD3highもしくはNP1high FXYD3highは親玉がん幹細胞、IGF1Rhigh FXYD3lowもしくはNP1high FXYD3lowは、通常のがん幹細胞を分画できた。現在論文投稿中。
我们分析了使用乳腺癌 PDX 对每个细胞部分进行单细胞 microRNA 测序分析获得的功能层次。这项研究的重点是三阴性乳腺癌。使用 10xGenomics 和 Fluidum 的 C1 单细胞制备系统对 5 个样本进行了 Micro RNA 测序。通过使用 SEURAT (https://satijalab.org/seurat/) 进行生物信息学分析,我们成功鉴定出一种膜蛋白 FXYD3,它可以区分亲本癌症干细胞和正常癌症干细胞(正在准备中)。与NP1或IGF1R组合,IGF1Rhigh FXYD3high或NP1high FXYD3high能够分离亲本癌症干细胞,并且IGF1Rhigh FXYD3low或NP1high FXYD3low能够分离正常癌症干细胞。目前论文正在提交中。
项目成果
期刊论文数量(33)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
乳がん患者由来モデル及びマウスモデルを用いたがん幹細胞、微小環境構築の解明
使用乳腺癌患者模型和小鼠模型阐明癌症干细胞和微环境结构
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Pattara Khamrin;Kattareeya Kumthip;Shintaro Sato;Shoko Okitsu;Takeshi Kobayashi;Satoshi Hayakawa;Hiroshi Ushijima;Niwat Maneekarn;後藤典子
- 通讯作者:後藤典子
The membrane-linked adaptor FRS2beta fashions a cytokine-rich inflammatory microenvironment that promotes breast cancer carcinogenesis
膜连接接头 FRS2beta 形成富含细胞因子的炎症微环境,促进乳腺癌癌变
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Mizuno Masahiro;Khaledian Behnoush;Maeda Masao;Hayashi Takanori;Mizuno Seiya;Munetsuna Eiji;Watanabe Takashi;Kono Seishi;Okada Seiji;Suzuki Motoshi;Takao Shintaro;Minami Hironobu;Asai Naoya;Sugiyama Fumihiro;Takahashi Satoru;Shimono Yohei;後藤典子
- 通讯作者:後藤典子
乳がん患者由来がん三次元培養によるマイ・メディシン
我的药物使用来自乳腺癌患者的癌症 3D 培养物
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kanako Nishiyama;Masashi Maekawa;Jun Nakayama;Akari Murakami;Yoshiaki Kamei;Yasutugu Takada;Shigeki Higashiyama;後藤典子
- 通讯作者:後藤典子
がん微小環境に1細胞レベルで挑む
在单细胞水平上应对癌症微环境
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kunihiro Y;Tanaka N;Kawano R;Yujiri T;Ueda K;Gondo T;Kobayashi T;Matsumoto T;Ito K.;藤田 直也
- 通讯作者:藤田 直也
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HER2/HER3シグナル阻害によるNRG1遺伝子融合陽性肺がんの治療
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- 影响因子:0
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- 影响因子:0
- 作者:
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- 影响因子:0
- 作者:
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鈴木 聡
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- DOI:
10.18947/cytometryresearch.29.1_1 - 发表时间:
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- 作者:
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後藤 典子
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- DOI:
- 发表时间:
2023 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
本宮 綱記;Pein Maren;Insua-Rodriguez Jacob;Meier Jasmin;Decker Kristin;Descot Arnaud;Trumpp Andreas;Riedel Angela;後藤 典子;Oskarsson Thordur - 通讯作者:
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- 批准号:
24K02304 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Elucidation of the molecular mechanism of recurrent and metastatic cancer using a breast cancer mouse model and establishment of a preventive method
利用乳腺癌小鼠模型阐明复发和转移性癌症的分子机制并建立预防方法
- 批准号:
23K18237 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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- 批准号:
17045008 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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- 批准号:
17013025 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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shc介导的增殖、凋亡、分化的信息转导机制分析
- 批准号:
10169214 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
受容体よりShcを介する増殖、アポトーシス、分化の情報伝達機構の解析
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- 批准号:
09273215 - 财政年份:1997
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- 批准号:
08680757 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
受容体より、アダプター分子Shcを介する増殖及びアポトーシスシグナル伝達の解析
受体接头分子Shc介导的增殖和凋亡信号转导分析
- 批准号:
07780618 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
動脈硬化巣のシングルセル解析とゲノム統合解析による病態解明と新規疾患予防法の開発
通过动脉硬化病变的单细胞分析和整合基因组分析阐明病理学并开发新的疾病预防方法
- 批准号:
24K02447 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
全ゲノム解析およびシングルセル解析による歯根短小症に関わる遺伝要因の網羅的解析
利用全基因组分析和单细胞分析综合分析与短根相关的遗传因素
- 批准号:
24K20051 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Establishment of multi-layered omics analysis for mitochondrial disease patients
线粒体疾病患者多层组学分析的建立
- 批准号:
23H00424 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
シングルセル解析から捉える下垂体神経内分泌腫瘍の多様性分子機構に関する基盤的研究
单细胞分析垂体神经内分泌肿瘤多种分子机制的基础研究
- 批准号:
23K07962 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Elucidating the pathogenesis of NK-cell neoplasms using single-cell multi-omics analysis
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- 批准号:
22H03108 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)