Integrated platform for analyzing the modes of actions of natural products

分析天然产物作用模式的综合平台

基本信息

批准号：
21H02073
负责人：
中尾洋一
金额：
$ 11.15万
依托单位：
Waseda University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02073/
关键词：
天然小分子作用メカニズム作用メカニズム解明天然化合物

项目摘要

本研究では化合物の作用メカニズムを明らかにするためのプラットフォームを構築することを目的として、『①半田ビーズを用いた標的タンパク質の釣り上げ』に加え、『②shRNA／CRISPR-Cas9スクリーニング法』『③RNAシーケンス解析』『④セルベースヒストン修飾解析』という異なるレベルの機能的なスクリーニング・解析を行うことで、各種天然化合物の標的タンパク質や作用経路を絞り込むための研究を行うことを目的としている。2022年度は、海綿由来の細胞毒性天然環状ペプチドkapakahineの標的候補タンパク質として浮かび上がった、ミトコンドリアタンパク質のプロヒビチン１（PHB1）、PHB2、アデニンヌクレオチドトランスロカーゼ２（ANT2）について作用メカニズムにかかわる機能を検証した。特に、がん抑制遺伝子の発現を誘導するPHB2タンパク質は、乳がん細胞においてはBIG3との複合体形成によってその核移行が抑制されることが知られているため、kapakahineがこの複合体形成に影響を及ぼす可能性について検証した。一方、いずれもアストロサイトへの分化誘導活性を示した春ウコン由来のコロナリンDおよび味噌由来のフェルラ酸エチルエステルについて『②shRNA／CRISPR-Cas9スクリーニング法』による標的遺伝子の解析を行った。また、海綿由来の細胞毒性物質onnamideの新規類縁体について単離・構造決定を行い、細胞毒性およびヒストン修飾調節活性について構造―活性相関解析を行うことで、作用メカニズムについて検討を行った。

In this study, the aim is to build a platform to clarify the mechanism of action of compounds, and the aim is to conduct research to narrow down the target proteins and action pathways of various natural compounds by conducting different levels of functional screening and analysis, such as "1) catching target proteins using solder beads," "2) shRNA/CRISPR-Cas9 screening method," "3) RNA sequencing analysis," and "4) cell-based histone modification 分析。”在2022年，我们检查了线粒体蛋白禁止蛋白1（PHB1），PHB2和腺嘌呤核苷酸易位酶2（ANT2）的作用机理的功能，这些核苷酸易位酶2（ANT2）成为靶候选蛋白的靶标蛋白，用于衍生生物的细胞毒素蛋白毒性蛋白毒性蛋白毒性蛋白毒性蛋白毒性蛋白蛋白蛋白蛋白甲虫Kapakahine kapakahine。特别是，由于众所周知，诱导癌症抑制基因表达的PHB2蛋白通过与BIG3的复合形成在乳腺癌细胞中抑制核易位，因此我们检查了Kapakahine可能会影响这种复杂形成的可能性。另一方面，使用春季姜黄的冠状酸素D的shRNA/CRISPR-CAS9筛选方法分析了靶基因，这两者都显示出诱导分化的活性到星形胶质细胞中。此外，通过隔离和确定海绵状细胞毒性物质的新型类似物的结构以及通过进行细胞毒性和组蛋白修饰调节活性的结构活性相关性分析来检查作用机理。

项目成果

期刊论文数量（28）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

春ウコンに含まれるアストロサイト分化誘導促進物質の同定

春姜黄中促进星形胶质细胞分化诱导物质的鉴定

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
化学と生物
影响因子：
0
作者：
Tone Yuichiro;Mamchaoui Kamel;Tsoumpra Maria K.;Hashimoto Yasumasa;Terada Reiko;Maruyama Rika;Gait Michael J.;Arzumanov Andrey A.;McClorey Graham;Imamura Michihiro;Takeda Shin'ichi;Yokota Toshifumi;Wood Matthew J.A.;Mouly Vincent;Aoki Yoshitsugu;大塚悟史，中尾洋一
通讯作者：
大塚悟史，中尾洋一

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