Genomic survey of enteric pathogens in India for developing anti-adhesion therapies

印度肠道病原体基因组调查，用于开发抗粘连疗法

基本信息

批准号：
20KK0183
负责人：
飯田哲也
金额：
$ 11.9万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-10-27 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20KK0183/
关键词：
腸管病原体コレラ下痢症次世代シーケンサー

项目摘要

コレラは依然として世界的な脅威であり、インドはこの感染症を含む様々な腸管感染症の影響を受ける主要な国の一つである。コレラの「ホットスポット」がインド国内に複数存在することが確認されており、コレラの分子疫学に関する包括的な研究が急務となっている。インド国立コレラ・腸管感染症研究所（NICED）と共同で、インド国内のホットスポットを中心にコレラ菌の臨床株を収集し、疫学調査およびゲノム解析を実施することで、コレラ菌の病原性発現の要となる宿主への付着・定着機構の解明に役立てる。コレラ菌の付着過程を妨げる付着阻害剤が設計されれば、コレラ菌は腸管に付着・定着することができず体外に排出される。これは、近年問題となる薬剤耐性コレラ菌にも有効かつその発生を抑制すると考えられることから、新規のコレラ対策としてコレラ撲滅に大きく寄与することが期待される。令和4年度には新型コロナウイルス感染症による入出国制限が緩和されたため、インド国立コレラ・腸管感染症研究所（NICED）を訪問し、本研究内容の成果報告と今後の共同研究について話し合うことができた。また、インド政府管轄のインド医学研究評議会（ICMR）を訪問し、本研究課題とともに日本・インド間の国際共同研究の重要性について意見交換をおこなった。結果、インド側は、コレラの流行状況とともに、コルカタの健常人がコレラ菌の無症候性保菌者となっている事例（不顕性感染）に興味を持たれていることが分かった。不顕性感染事例ではコレラ菌の細胞数が少ないことが示唆されているため、次年度は高感度にゲノム情報を取得するための手法を模索する予定である。

霍乱仍然是全球威胁，印度是受各种肠道感染影响的主要国家之一，包括这种感染。已经证实，印度有几个霍乱“热点”，迫切需要一项关于霍乱分子流行病学的全面研究。 Colera通过与印度国家霍乱和肠道感染性研究所合作进行流行病学调查和基因组分析来收集骗子的临床库存（主要是热点），并进行了流行病学调查和基因组分析。如果设计了阻碍霍乱细菌粘附的粘附抑制剂，则不会将霍乱细菌粘附在肠道上，并且会在体内排出。由于这被认为在化学耐药性霍乱中有效，这是近年来的一个问题，并抑制了它的发生，因此可以预期，它将极大地促进霍利氏菌作为一种新的霍乱措施。在第四年，新的冠状病毒感染的进入和离开是放松的，因此我们参观了印度国家的Colera和肠道感染（NICE），讨论了这项研究内容的结果，并讨论了我未来的联合研究。做到。此外，他在印度政府的管辖下访问了印度医学研究委员会（ICMR），并就日本和印度之间国际联合研究的重要性以及这项研究提出了意见。结果，发现印度一面对科拉的流行病感兴趣，并且对霍乱细菌作为无症状细菌的病例（亚透明感染）感兴趣。在亚含量感染的情况下，建议霍乱细菌的细胞数量很小，因此在下一个会计年度，我们计划找到一种以高灵敏度获取基因组信息的方法。