CircRNA MYLK/lncRNA H19通过miR-29作为ceRNA调控膀胱癌EMT机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81672536
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Recent researches have indicated that non encoding RNA performs an important regulatory function, which is closely related to EMT and metastasis of tumors. However, the mechanisms underlying non encoding RNA remain largely unknown so far. Pandolfi proposed ceRNA hypothesis that exist competitive endogenous RNAs(ceRNA) in cell. These RNAs (mRNA, lncrna, circRNA, pseudogenes, etc.) molecules can competitively combine with miRNA through microRNA response element (MRE) to regulate each other expression level,which reveals the novel mechanism of RNA interaction. Our previous microarray experiment and the bioinformatics study found that H19 circRNA MYLK/lncRNA were over-expressed and co-expressed with several important target genes of mir-29, and share the same MRE of miR-29 in bladder cancer. luciferase reporter assay preliminarily confirmed that H19 CircRNA MYLK/lncRNA could combine with the mir-29. Therefore, it is speculated that MYLK/lncRNA H19 CircRNA might be used as ceRNA competitive binding miR-29 to regulate the expression of its target gene, and thus play an important role in the tumorigenesis and development of bladder cancer. The project intends to further verify the scientific hypothesis that CircRNA MYLK/lncRNA H19 and mir-29 target gene coud competitively bind to mir-29, which increase the related target genes expressiones to promote bladder cancer EMT and metastasis by q-RT PCR, Northern blot, FISH, RIP, RNA pull-down and gain of function and loss of function experiments, etc in the cell, animal and clinical specimens. The research start a regulatory function from the point of view of the CircRNA MYLK/lncRNA H19 as ceRNA, it reveals the novel mechanism to promote the invasion and metastasis of bladder cancer, and provides the original scientific basis for the diagnosis and therpy of bladder cancer.
新近研究表明非编码RNA与肿瘤的EMT及转移密切相关,然而迄今对其作用机制知之甚少。我们前期芯片及生物信息学分析发现CircRNA MYLK/lncRNA H19在膀胱癌中过表达且与miR-29的几个靶基因共表达,并都具有miR-29应答元件,荧光素酶报告基因实验初步证实CircRNA MYLK/H19能与miR-29结合。因此,推测CircRNA MYLK/H19可能作为竞争性内源RNA(ceRNA)竞争性结合miR-29调节其靶基因表达,进而促进膀胱癌EMT及转移。拟进一步应用qPCR、FISH、RIP、RNA pull down及功能获得和缺失等实验在细胞、动物及临床标本上证明CircRNA MYLK/H19与miR-29靶基因竞争性结合miR-29从而上调其相关基因的表达促进膀胱癌EMT及转移的科学假说。旨在揭示其促进膀胱癌侵袭转移的新颖机制,为膀胱癌诊断和治疗提供原创性科学依据。

结项摘要

项目的背景.新近研究表明以微RNA(miRNA)、长链非编码RNA(1ncRNA)、环形RNA(circRNA)为代表的非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)与肿瘤(膀胱癌)发生发展过程密切相关,有望成为肿瘤诊断治疗的新靶点,然而迄今对其作用机制知之甚少。我们前期芯片及生物信息学分析发现CircRNA MYLK/lncRNA H19在膀胱癌中过表达且与miR-29的几个靶基因共表达,并都具有miR-29 应答元件,荧光素酶报告基因实验初步证实CircRNA MYLK/H19能与miR-29结合。因此,推测CircRNA MYLK/H19可能作为竞争性内源RNA(ceRNA)竞争性结合miR-29调节其靶基因表达,进而促进膀胱癌EMT及转移。旨在揭示其促进膀胱癌侵袭转移的新颖机制,为其诊断和治疗提供原创性科学依据。.主要研究内容.本项目拟在前期的工作基础上进一步应用qRT-PCR、 Northern blot、FISH(荧光原位杂交)、RIP(RNA结合蛋白免疫共沉淀)、RNA pull down、Western blot、双荧光素酶报告基因及功能获得和缺失等实验在细胞、动物及临床标本上证明CircRNA MYLK/lncRNA H19与miR-29的靶基因竞争性结合miR-29从而上调其相关基因的表达促进膀胱癌EMT及转移这一科学假说。.重要结果、关键数据.1.证明了CircRNA MYLK/lncRNA H19在膀胱癌中过表达通过促进膀胱癌上皮型间质型转化,进而促进膀胱癌转移。.2. 阐明了CircRNA MYLK/lncRNA H19促进膀胱癌上皮型间质型转化的分子机制。CircRNA MYLK/lncRNA H19通过与miR-29竞争性地与其结合来调控miR-29靶基因表达,使其DNMT3B、ITGB1(β1-integrin)、VEGFA等靶基因表达上调,进而调节EMT相关的因子(TGF-β)和通路,最终促进膀胱癌细胞EMT和转移。为膀胱癌的诊断、预防和治疗提供新的思路和理论依据。.3. 在国际杂志上发表IF>4.0的SCI论文3篇, 培养研究生3名。.科学意义.揭示CircRNA MYLK/lncRNA H19促进膀胱癌EMT及侵袭转移的新颖机制,旨为膀胱癌诊断和治疗提供原创性的科学依据。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Circular RNA MYLK as a competing endogenous RNA promotes bladder cancer progression through modulating VEGFA/VEGFR2 signaling pathway
环状RNA MYLK作为竞争性内源RNA通过调节VEGFA/VEGFR2信号通路促进膀胱癌进展
  • DOI:
    10.1016/j.canlet.2017.06.027
  • 发表时间:
    2017-09-10
  • 期刊:
    CANCER LETTERS
  • 影响因子:
    9.7
  • 作者:
    Zhong, Zhenyu;Huang, Mengge;Chen, Junxia
  • 通讯作者:
    Chen, Junxia
LncRNA RP11-79H23.3 Functions as a Competing Endogenous RNA to Regulate PTEN Expression through Sponging hsa-miR-107 in the Development of Bladder Cancer
LncRNA RP11-79H23.3 在膀胱癌的发展过程中作为竞争性内源 RNA 通过海绵 hsa-miR-107 调节 PTEN 表达
  • DOI:
    10.3390/ijms19092531
  • 发表时间:
    2018-09-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Chi, Hong;Yang, Rui;Chen, Junxia
  • 通讯作者:
    Chen, Junxia
lncRNA H19 regulates epithelial-mesenchymal transition and metastasis of bladder cancer by miR-29b-3p as competing endogenous RNA
lncRNA H19通过miR-29b-3p作为竞争性内源RNA调节膀胱癌的上皮间质转化和转移
  • DOI:
    10.1016/j.bbamcr.2017.08.001
  • 发表时间:
    2017-10-01
  • 期刊:
    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR CELL RESEARCH
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    Lv, Mengxin;Zhong, Zhenyu;Chen, Junxia
  • 通讯作者:
    Chen, Junxia

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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