嗜酸热古菌Metallosphaera sp.Ar-4硫代谢及调控蛋白质群

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31070042
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    34.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0103.微生物组学与代谢
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

嗜酸热古菌在自然界硫循环和金属固定等方面及生物冶金过程中起着重要的作用,对不同价态硫的异化代谢是它们获取生长和代谢所需能量的重要生命活动方式。以往对于这些古菌硫氧化过程中相关酶的研究较多,而关于硫代谢调控机制及细胞整体代谢网络的分子基础,则鲜见报道。本项目拟以嗜酸热古菌Metallosphaera sp. Ar-4为材料,通过基因组及蛋白质组分析,发现与硫代谢相关的基因和蛋白质群;利用遗传、生化及分子生物学方法,探索该菌株硫代谢及其调控机制;比较Metallosphaera、Sulfolobus和Acidianus属的基因组,揭示嗜酸热古菌,尤其是Metallosphaera硫代谢及其调控机制的特异性,构建细胞整体代谢网络,预期从全局认识嗜酸热古菌特殊的生理及代谢能力。这不仅有助于认识古菌的生命特征和生物进化规律,还可为加速嗜酸热古菌在低碳生物冶金过程的应用提供理论指导和技术支持。

结项摘要

嗜酸热古菌Metallosphaera cuprina是Metallosphaera属的新种,该菌能够在65 oC,pH3的环境中兼性自养生长,对酸热环境有很强的适应性。为了揭示该菌碳、硫代谢的特异性,通过本研究工作,完成了嗜酸热古菌Metallosphaera 属新种M. cuprina的基因组测序、拼接及注释,基因组注释支持该菌具有利用CO2代谢还原性无机硫化合物或利用有机化合物进行兼性生长的生理特点;进一步通过比较蛋白质组学手段,分析了不同生长条件下,细胞全蛋白组成的差异表达,研究发现M. cuprina中心碳代谢及硫代谢相关的蛋白和蛋白质群在不同生长环境中的表达有较大差异;利用生化及分子生物学方法,集中测定了3-羟基丙酸/4-羟基丁酸CO2固定途径中关键酶:琥珀酸半醛还原酶 Mcup_0811,3-羟基丙酸CoA合成酶Mcup_0744,4-羟基丁酸酸CoA合成酶Mcup_0813及丙二酰辅酶A/琥珀酰辅酶A还原酶Mcup_1427等酶的活性;同时验证了硫代谢相关基因簇Mcup_0681-0683中DsrE Mcup_0681与TusA Mcup_0683之间的相互作用及硫转移功能;测定了硫代谢相关蛋白硫化物:醌氧化还原酶的酶活。根据基因组、蛋白质组、生化及分子生物学研究结果,构建了Metallosphaera cuprina Ar-4的碳、硫代谢途径及网络,通过比较Metallosphaera、Sulfolobus,Acidianus属及嗜酸细菌代谢模式,揭示了嗜酸热古菌Metallosphaera的代谢特征。

项目成果

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专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)

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  • 作者:
    尤晓颜;张彬;郑华军;姜成英
  • 通讯作者:
    姜成英

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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