极端嗜酸热古菌Metallosphaera cuprina硫代谢途径中关键蛋白的功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31670124
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    68.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0106.微生物与环境互作
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Extremely thermoacidophilic Archaea from the family Sulfolobaceae, including genus Sulfolobus, Acidianus, and Metallosphaera, contribute greatly to sulfur, carbon, oxygen and metallic elements biogeochemical cycling, as well as in biohydrometallurgy and waste water treatment processes. They oxidize the sulfur with different valence and obtain the energy for growth and metabolism. Nevertheless, the functions of many proteins in the sulfur metabolism keep unknown. The thermoacidophilic archaeon Metallosphaera cuprina was isolated from a sulfuric hot spring which is able to oxidize elemental sulfur, tetrathionate, pyrite, and a range of low-grade ores, thus is attractive to biomining industry. Recently, we have explored the sulfur metabolism of M. cuprina with genomic, proteomic, and biochemical tools. A hypothetical model of sulfur metabolism in M. cuprina was proposed on proteomic and genomic data, and key proteins that involved in sulfur metabolism have been found. In this research, the functions of the proteins involved in sulfur metabolism will be identified via analysis of enzyme activities and gene knockout/complementation approach. Furthermore, the mechanism of sulfur metabolism will be analyzed. Our aim is to reveal the sulfur metabolism pathway and mechanism in M. cuprina. This research is helpful to understand the life styles of the archaea.
(限400字):嗜酸热古菌在自然界硫、碳、氧及金属元素等的地球化学循环及生物冶金过程中起重要作用,它们通过复杂的硫代谢系统完成对不同价态硫的氧化,获取生长和代谢所需能量。这些菌中还有许多硫代谢相关蛋白的功能未知。Metallosphaera cuprina Ar-4是从热泉中分离获得的嗜酸热古菌,能够氧化单质硫,连四硫酸钾和低品位硫化矿, 具有在高温生物冶金工业中的应用潜力。前期研究构建了该菌的代谢网络,发现了可能参与硫代谢过程的关键基因和蛋白。本项目拟以M. cuprina为材料,结合酶活分析,产物测定及RT-PCR等方法,研究蛋白在硫代谢中的作用;利用基因敲除和互补、蛋白质与蛋白质、蛋白质和DNA相互作用等技术手段,解析蛋白的生理功能;阐述硫代谢关键蛋白与含硫底物、DNA分子及相关蛋白间的作用机制;揭示M. cuprina的硫代谢机制,为加速该菌在生物冶金过程中的应用提供理论依据。

结项摘要

嗜酸热古菌在自然界硫、碳、氧及金属元素等的地球化学循环及生物冶金过程中起重要作用,它们通过复杂的硫代谢系统完成对不同价态硫的氧化,获取生长和代谢所需能量。这些菌中还有许多硫代谢相关蛋白的功能未知。本项目针对热泉硫代谢微生物展开研究,以从热泉中分离获得的嗜酸热古菌Metallosphaera 属的两个菌株M. cuprina Ar-4T和M. tengchongensis Ric-AT为研究对象,通过对Metallosphaera 属古菌的基因组、转录组比较分析,结合酶活分析,产物测定及RT-PCR等方法,研究了关键蛋白(包括硫化物醌氧化还原酶、NADPH硫氧化还原酶、连四硫酸水解酶等)在硫代谢中的作用,阐述了硫代谢关键蛋白与含硫底物之间的作用;利用蛋白质与蛋白质相互作用,免疫电镜等技术手段,解析了蛋白的生理功能及细胞定位,从而揭示了M. cuprina的硫代谢机制;搭建了半导体光电子形成系统,发现模拟光电子可以促进M. cuprina Ar-4T的生长及浸矿效率,为加速该菌在生物冶金过程中的应用提供了理论依据和应用手段。项目执行过程中,与实验室同事共同指导毕业博士研究生1名(副导师),在读博士研究生1名,毕业硕士研究生7名,在读硕士研究生3名,出站博士后1名,形成了一支结合微生物学、矿物学及材料学等学科交叉的高水平研究队伍。发表文章4篇(标注基金编号),参加国内国际会议5次并作大会报告与展板交流,研究结果已在生物冶金行业进行应用。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
嗜热古菌异化型硫氧化途径的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘丽君;汪洋;刘双江;姜成英
  • 通讯作者:
    姜成英
高通量测序分析云南腾冲热海热泉微生物多样性
  • DOI:
    10.13344/j.microbiol.china.190284
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    微生物学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    秦亚玲;梁宗林;宋阳;王保军;刘双江;姜成英
  • 通讯作者:
    姜成英
Comparative Genomic Analysis Reveals the Metabolism and Evolution of the Thermophilic Archaeal GenusMetallosphaera
比较基因组分析揭示嗜热古菌金属球菌属的代谢和进化
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2020.01192
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Frontiers in Microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Wang Pei;Li Liang Zhi;Qin Ya Ling;Liang Zong Lin;Li Xiu Tong;Yin Hua Qun;Liu Li Jun;Liu Shuang-Jiang;Jiang Cheng-Ying
  • 通讯作者:
    Jiang Cheng-Ying

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喜温嗜酸硫杆菌SM-1重金属抗性分子机制研究
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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    10.13344/j.microbiol.china.160010
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    刘双江
微生物完整基因组测定中的Gap closure策略
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    微生物学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    尤晓颜;张彬;郑华军;姜成英
  • 通讯作者:
    姜成英
库源比改变对油橄榄产量及源叶光合作用的调节
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    姜成英;史艳虎;吴文俊;陈年来
  • 通讯作者:
    陈年来
中国北亚热带油橄榄(城固32)开花生物学特性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    植物研究
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴文俊;芦娟;赵梦炯;史艳虎;姜成英
  • 通讯作者:
    姜成英

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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