染色质改构因子调控RNA聚合酶I转录起始的研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31171255
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    70.0万
  • 负责人：
    陶伟
  • 依托单位：
    北京大学
  • 学科分类：
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份：
    2015
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

核糖体基因（rDNA）是由RNA聚合酶I来进行转录的。在哺乳动物细胞中，总有部分rDNA是转录沉默的，而另一部分rDNA是转录活跃的。这两种状态的rDNA伴随着相应的特异表观遗传修饰特征。本项申请预研结果表明，在活跃状态(active state)和沉默状态(silent state)之间,还存在着一种由染色质改构因子介导的中间状态或驻留状态（poised state）的核小体，它同时伴有转录活跃和转录沉默的表观遗传修饰特征，初步分析表明这种核小体可能是RNA聚合酶I起始复合体组装／解聚／重组装过程中的必要调控步骤。本项研究试图深入界定分析这种驻留核小体所具有的特异DNA和组蛋白的表观遗传修饰组合状态，分析其与核糖体基因转录和沉默的协调关系，探讨其与RNA聚合酶I起始复合体循环组装的相互作用机制，为透彻了解染色质改构因子对RNA聚合酶I的转录调控机制提供重要的研究信息。

结项摘要

发现染色质改构因子复合体NuRD能够在rDNA启动子上建立一个介于转录失活和激活中间状态的表观修饰方式，称为驻留状态。在这种表观遗传学修饰中间状态的启动子上，缺乏DNA甲基化修饰，核小体处于转录抑制的位置，并装配有部分转录起始复合体成分。这种修饰方式可以快速地导致rDNA被激活或被抑制，以应对细胞对信号应答过程中对核糖体合成速率的调控。

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
NuRD Blocks Reprogramming of Mouse Somatic Cells into Pluripotent Stem Cells
NuRD 阻止小鼠体细胞重编程为多能干细胞
  • DOI：
    10.1002/stem.1374
  • 发表时间：
    2013-07-01
  • 期刊：
    STEM CELLS
  • 影响因子：
    5.2
  • 作者：
    Luo, Min;Ling, Te;Grummt, Ingrid
  • 通讯作者：
    Grummt, Ingrid
The chromatin remodeling complex NuRD establishes the poised state of rRNA genes characterized by bivalent histone modifications and altered nucleosome positions
染色质重塑复合体 NuRD 建立 rRNA 基因的平衡状态，其特征是二价组蛋白修饰和核小体位置改变
  • DOI：
    10.1073/pnas.1201262109
  • 发表时间：
    2012-05-22
  • 期刊：
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子：
    11.1
  • 作者：
    Xie, Wenbing;Ling, Te;Tao, Wei
  • 通讯作者：
    Tao, Wei
The chromatin remodeling factor CSB recruits histone acetyltransferase PCAF to rRNA gene promoters in active state for transcription initiation.
染色质重塑因子 CSB 将组蛋白乙酰转移酶 PCAF 募集到活性状态的 rRNA 基因启动子处以启动转录
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0062668
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Shen M;Zhou T;Xie W;Ling T;Zhu Q;Zong L;Lyu G;Gao Q;Zhang F;Tao W
  • 通讯作者：
    Tao W
CHD4/NuRD establishes the poised state of rRNA genes characterized by bivalent histone modifications and altered nucleosome positions
CHD4/NuRD 建立以二价组蛋白修饰和改变核小体位置为特征的 rRNA 基因的平衡状态
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 影响因子：
    11.1
  • 作者：
    Xie WB, Ling T, Zhang YG, Grummt I,;Tao Wei
  • 通讯作者：
    Tao Wei

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    王强;陈雷;张晓丽;梁天锋;高国庆;莫彬;吕荣华;陶伟;唐茂艳
  • 通讯作者：
    唐茂艳

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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