多态蛋白状态转变的单分子荧光研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21573289
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    68.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0707.化学生物学理论、方法与技术
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Metamorphic proteins can have multiple exchangeable states and play critical roles in life procedures, such as signal transduction and cell division. These proteins have close relation to diseases and their treatment. On the other hand, the transition between states is the key step to regulate the role of these proteins. However, the transition mechanism is not clear yet and there are still difficulties to regulate the state transition. With more and more metamorphic proteins discovered, study on the transition mechanism, as new questions in protein folding, has been a hot spot. This project will integrate rapid kinetics, single-molecule FRET, time-resolved single-molecule fluorescence and computational simulation to investigate the state transition mechanism and the properties of different states of metamorphic proteins. This project will include the application single-molecule FRET to the new area of protein folding and the development of time-resolved single-molecule FRET. The completion of this project will provide important experimental and theoretical evidence for deep understanding of the state transition mechanism of metamorphic proteins. It will also facilitate further understanding the biological significance of metamorphic proteins and the treatment of relative diseases.
多态蛋白在生理条件下存在多种可相互转变的状态,它们在信号转导、细胞分裂等生命过程中起到重要作用,跟疾病的发生与治疗有着密切的关系,多态蛋白状态间的转变正是调控这类蛋白功能的关键步骤。但是,多态蛋白状态转变的机理还不清楚,对状态转变的调控还有诸多障碍。随着越来越多的多态蛋白被发现,作为蛋白质折叠研究中的一类新问题,多态蛋白状态转变机理的研究成为了一个新的热点。本项目将结合快速反应动力学技术、单分子荧光共振能量转移技术、单分子时间分辨荧光技术以及计算机模拟等多种生物物理化学技术,重点研究多态蛋白状态转变过程的分子机制以及各状态的动态特征,本项目既包括了现有技术在多态蛋白这一研究领域的新应用,也包括时间分辨单分子荧光共振能量转移这一新技术的开发。项目的开展将为深入认识多态蛋白的状态转变机理提供重要的实验和理论依据,并将为全面认识多态蛋白的生物学意义以及相关疾病的治疗奠定基础。

结项摘要

多态蛋白状态间的转变对于这类蛋白功能的实现以及蛋白功能的调控具有关键作用,认清多态蛋白折叠机理及状态转变机理对于相关疾病的治疗和药物设计具有深远的意义,但是目前对于多态蛋白折叠及状态转变的研究还较少,对其机理的认识还非常有限。本项目拟将多种生物物理技术相结合,对多态蛋白的折叠及状态转变过程进行系统的研究,以期揭示其分子机制,并为对多态蛋白状态转变的调控提供实验和理论依据。.在过去四年中,本项目在以下几个方面开展了研究:1)利用动力学及热力学技术方法对Mad2折叠及状态转变机理进行了研究;2)对Mad2与其配体Cdc20的相互作用进行了系统研究,对结合常数及结合动力学进行了表征,并对两个蛋白之间的相互作用机理进行了探讨;3)利用基于共聚焦和基于全内反射的两种单分子荧光技术对Mad2的折叠过程在单分子水平上进行了系统研究。在上述研究中有以下几个重要的研究结果:1)提出了Mad2折叠过程中存在稳定折叠中间态的理论模型,并指出稳定折叠中间态的存在是导致Mad2两种构象之间转变缓慢的关键因素;2)发现C-Mad2与Cdc20的结合要明显比O-Mad2与Cdc20的结合要强,并指明Mad2与Cdc20之间的相互作用是由疏水作用主导的,而不是通过静电相互作用来实现的;3)利用单分子荧光技术,首次直接捕捉到了Mad2折叠中间态,证实了它的存在,并对该折叠中间态进行了表征,同时发现该折叠中间态是一个必须经过的on-pathway中间态。上述研究加深了我们对于Mad2折叠机理和状态转变过程以及该蛋白与其配体Cdc20相互作用的认识,为建立对这一蛋白功能进行调控的方法奠定了理论基础。研究所得到的结果,特别是首次捕捉到Mad2折叠中间态并实现对其进行表征,对于蛋白质折叠研究具有重要的意义。这种直接对中间态的捕捉解答了蛋白质折叠研究中一直难以解决的关于中间态是否真实存在的争议,为蛋白质折叠研究提供了新的证据和新的思路。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(1)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Glycosaminoglycan / gold nanocluster hybrid nanoparticles as a new sensing platform: Metastatic potential assessment of cancer cells.
糖胺聚糖/金纳米簇混合纳米粒子作为新的传感平台:癌细胞的转移潜力评估。
  • DOI:
    10.1016/j.carbpol.2019.115654
  • 发表时间:
    2020-02
  • 期刊:
    Carbohydr Polym
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ma Xiqi;Wang Xiaojuan;Chen Qi;He Hua;Sun Yixin;Liu Hui;Wang Yanan;Qu Jianbo;Huang Fang
  • 通讯作者:
    Huang Fang
Novel Enteromorpha Prolifera based carbon dots: Probing the radical scavenging of natural phenolic compounds
新型浒苔基碳点:探索天然酚类化合物的自由基清除作用
  • DOI:
    10.1016/j.colsurfb.2018.11.019
  • 发表时间:
    2019-02-01
  • 期刊:
    COLLOIDS AND SURFACES B-BIOINTERFACES
  • 影响因子:
    5.8
  • 作者:
    Wang, Xiaojuan;Qi, Chen;Huang, Fang
  • 通讯作者:
    Huang, Fang
Single-Molecule Imaging Demonstrates Ligand Regulation of the Oligomeric Status of CXCR4 in Living Cells
单分子成像显示活细胞中 CXCR4 寡聚状态的配体调节
  • DOI:
    10.1021/acs.jpcb.6b10969
  • 发表时间:
    2017-02-23
  • 期刊:
    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Lao, Jun;He, Hua;Huang, Fang
  • 通讯作者:
    Huang, Fang
Using Fluorescence Quenching Titration to Determine the Orientation of a Model Transmembrane Protein in Mimic Membranes
使用荧光猝灭滴定确定模拟膜中模型跨膜蛋白的方向
  • DOI:
    10.3390/ma12030349
  • 发表时间:
    2019-02-01
  • 期刊:
    MATERIALS
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Huang, Haihong;Ge, Baosheng;Huang, Fang
  • 通讯作者:
    Huang, Fang
Coassembly of Gold Nanoclusters with Nucleic Acids: Sensing, Bioimaging, and Gene Transfection
金纳米团簇与核酸的共组装:传感、生物成像和基因转染
  • DOI:
    10.1002/ppsc.201900281
  • 发表时间:
    2019-08
  • 期刊:
    Particle & Particle Systems Characterization
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Wang Yanan;Wang Xiaojuan;Ma Xiqi;Chen Qi;He Hua;Nau Werner M;Huang Fang
  • 通讯作者:
    Huang Fang

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其他文献

20世纪70年代以来松嫩平原乌裕尔
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    自然资源学报,2006,21(6):949-956
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄方;张树文;Jan de Leeuw;张
  • 通讯作者:
大豆E3泛素连接酶基因GmPUB1的克隆及功能研究
  • DOI:
    10.7685/jnau.201912063
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    南京农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    宫宇;毛卓卓;史贵霞;杨中义;喻德跃;黄方
  • 通讯作者:
    黄方
大豆E2泛素结合酶基因GmUBC1的克隆及在拟南芥中的异源表达
  • DOI:
    10.16288/j.yczz.20-141
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    遗传
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    毛卓卓;宫宇;史贵霞;李亚丽;喻德跃;黄方
  • 通讯作者:
    黄方
若干金属稳定同位素体系的研究进展:以中国科大实验室为例
  • DOI:
    10.19658/j.issn.1007-2802.2018.37.105
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    矿物岩石地球化学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄方;田笙谕
  • 通讯作者:
    田笙谕

其他文献

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黄方的其他基金

膜突蛋白激活过程的单分子荧光研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2021
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单螺旋跨膜多肽在生物膜中取向的研究
  • 批准号:
    21273287
  • 批准年份:
    2012
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  • 批准号:
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  • 项目类别:
    专项基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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