基于基因功能模块化概念的基因表达谱数据挖掘技术

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30370388
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    23.0万
  • 负责人：
    郭政
  • 依托单位：
    哈尔滨医科大学
  • 学科分类：
    C1008.生物与医学工程新技术新方法
  • 结题年份：
    2006
  • 批准年份：
    2003
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2004-01-01 至2006-12-31

项目摘要

由于基因表达谱数据具有高噪（高变异）、高维、高相关、高冗余的特点，加之单个基因的功能知识不完备、不精确，使得基因表达谱信息分析结果的稳定性、可靠性与生物学可解释性较差，是基因芯片技术应用中亟待解决的关键问题。单个基因的检测指标并非是理想的分析单元，为此，本课题将发展基因表达谱数据挖掘的创新技术，整合基因功能划分的先验知识，研究基因表达功能模块化的概念及相关的模块化指标，以解决现有分析技术存在的上述问题。我们将完成基于功能模块化的基因表达谱数据挖掘应用软件，并应用于挖掘已有的一些白血病、直肠癌、乳腺癌等基因表达谱数据资源中的知识。从依靠基因型区分表型到依靠功能型区分表型的思路转变，使得我们可以选择不同层次的基因功能知识单元解释不同层次的样本划分或疾病分型。从"功能模块表达谱"出发进行知识发现，将是基因芯片数据挖掘技术的一个重要突破。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（8）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Identifying disease feature ge
识别疾病特征
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Zhang Min, Zhu Jing, Guo Zheng
  • 通讯作者：
    Zhang Min, Zhu Jing, Guo Zheng
GoCube: discovering the cellul
GoCube：发现蜂窝
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Jing Zhu, Jing Wang, Zheng Guo
  • 通讯作者：
    Jing Zhu, Jing Wang, Zheng Guo
Peeling off the hidden genetic
剥去隐藏的基因
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Xu JZ, Guo Z, Zhang M, Li X, L
  • 通讯作者：
    Xu JZ, Guo Z, Zhang M, Li X, L
Learnability-based further pre
基于可学习性的进一步预习
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Tu K, Yu H, Guo Z, Li X.
  • 通讯作者：
    Tu K, Yu H, Guo Z, Li X.
结合蛋白质互作与基因表达谱信息
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国科学C辑生命科学 2006, 36(5):441-450
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    高磊, 李霞, 郭政, 朱明珠, 李彦
  • 通讯作者：
    高磊, 李霞, 郭政, 朱明珠, 李彦

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其他文献

结扎大鼠冠状动脉对心脏神经节细胞表达P物质及乙酰胆碱的影响
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  • 作者：
    郭政
  • 通讯作者：
    郭政
利多卡因在硬膜外麻醉致死犬体内的死后分布
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  • 通讯作者：
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  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    郭政
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  • 作者：
    李娟;董平;陆玉麒;王毅;郭政
  • 通讯作者：
    郭政
Gaining confidence in biological interpretation of the microarray data: the functional consistence of the significant GO categories
获得对微阵列数据的生物学解释的信心：重要 GO 类别的功能一致性
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Bioinformatics
  • 影响因子：
    5.8
  • 作者：
    郭政
  • 通讯作者：
    郭政

其他文献

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知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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