复杂疾病的基因表达谱与蛋白质互作网络的功能模块化分析

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30670539
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    郭政
  • 依托单位：
    哈尔滨医科大学
  • 学科分类：
    C1005.生物成像、电子与探针
  • 结题年份：
    2009
  • 批准年份：
    2006
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

在本课题中进一步研究结合基因表达谱与蛋白质互作网络信息的系统生物学分析技术:（1）完善可操作的具备不同生物学意义的"特征功能模块"的定义与稳健的识别算法。根据基因功能分类体系GO的生物通路和亚细胞定位等信息，寻找亚细胞位置特异复合功能类等作为特征功能模块。（2）动态整合基因功能知识，发展基于"基因功能模块表达谱"的疾病分型技术，包括有监督的疾病预测与无监督的疾病新亚型识别，并以特征表达调控网络解析疾病分型的"功能模块化"协同机制。（3）结合基因表达信息解析蛋白质互作网络，识别条件特异应答子网，发现其功能模块化组织关系。（4）结合基因表达谱与蛋白质互作网络，发展基于实验条件相关功能模块的基因功能预测算法。（5）应用于发现前列腺癌、乳腺癌、心率失常等复杂疾病的机制。从"功能模块表达谱"出发进行知识发现，为癌症等复杂疾病的分型与机理研究、疾病相关特征基因发现与功能预测提供有突破意义的新途径。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（21）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（5）
专利数量（0）
Oligo 基因芯片的异常值处理对有监督疾病分类的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国生物医学工程学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭政
  • 通讯作者：
    郭政
Apparently low reproducibility of true differential expression discoveries in microarray studies
微阵列研究中真实差异表达发现的再现性明显较低
  • DOI：
    10.1093/bioinformatics/btn365
  • 发表时间：
    2008-09-15
  • 期刊：
    BIOINFORMATICS
  • 影响因子：
    5.8
  • 作者：
    Zhang, Min;Yao, Chen;Li, Xia
  • 通讯作者：
    Li, Xia
Extracting consistent knowledge from highly inconsistent cancer gene data sources.
从高度不一致的癌症基因数据源中提取一致的知识
  • DOI：
    10.1186/1471-2105-11-76
  • 发表时间：
    2010-02-05
  • 期刊：
    BMC bioinformatics
  • 影响因子：
    3
  • 作者：
    Gong X;Wu R;Zhang Y;Zhao W;Cheng L;Gu Y;Zhang L;Wang J;Zhu J;Guo Z
  • 通讯作者：
    Guo Z
芯片中重复检测值的处理方法对差异表达基因选择的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物信息学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭政
  • 通讯作者：
    郭政
根据蛋白质互作网络预测前列腺癌相关蛋白质的细致功能
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物信息学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭政
  • 通讯作者：
    郭政

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其他文献

利多卡因在硬膜外麻醉致死犬体内的死后分布
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
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  • 影响因子：
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  • 作者：
    尉志文;张高勤;张潮;郭政
  • 通讯作者：
    郭政
结扎大鼠冠状动脉对心脏神经节细胞表达P物质及乙酰胆碱的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭政
  • 通讯作者：
    郭政
肾细胞癌DNA甲基化标记检测的重复性及其与基因表达改变的相关性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物信息学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    姚晨;李红东;郭政
  • 通讯作者：
    郭政
中原经济区人口与经济空间格局演变研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    长江流域资源与环境
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李娟;董平;陆玉麒;王毅;郭政
  • 通讯作者：
    郭政
3-(3,4-二氯苯基)-N,N-二甲基-3-吗啉-1-丙胺的立体异构体的合成、抗抑郁活性和毒性评价(英文)
  • DOI：
    10.16522/j.cnki.cjph.2019.05.004
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    中国医药工业杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王文韬;郭政;吴建威;张庆伟;李建其
  • 通讯作者：
    李建其

其他文献

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融合组学挖掘非可控性炎症向癌症转化的分子机制
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    面上项目

相似国自然基金

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相似海外基金

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知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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