创制新一代可迁移、可扩展分子力场的基础研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    20473052
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    21.0万
  • 负责人：
    孙淮
  • 依托单位：
    上海交通大学
  • 学科分类：
    B0301.化学理论与方法
  • 结题年份：
    2007
  • 批准年份：
    2004
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2005-01-01 至2007-12-31

项目摘要

本课题的目标是创制一个可迁移、可扩展、准确、易用的新一代通用分子力学力场。研究内容包括：1）确定参数化方法; 2）设计合适的力场函数形式; 3）确定需要参数化的分子片断; 4）分子片断的参数化及力场数据库的建立; 5）验证力场; 6）数据发布与成果共享。本项目的特色与创新之处在于：1）首次提出并构建由分子片断为基本单元的分子力学通用力场。用这一方法构建的全新力场将具有较好的可迁移性和可扩展性，有效地改变现有力场的弊端; 2）创制一个具有较大覆盖面的通用力场，满足多数研究人员的共同需要，并公开发表方法和参数，使得分子模拟方法在具有重大国民经济意义的新药、新材料研发过程中发挥更大的作用; 3）本项目涉及量子化学计算、分子力学力场方法及计算机软件技术和算法，这对培养教育具有理论化学基础及计算机应用技术综合素质的复合型人才有着积极意义。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（8）
专著数量（0）
科研奖励数量（2）
会议论文数量（29）
专利数量（0）
An ab initio study of the alph
阿尔法的从头开始研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
TNAZ的第一原理分子力学力场.
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    含能材料, 2007，6，616-621.
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王喜军;赵立峰;孙淮*.
  • 通讯作者：
    孙淮*.
On the Electrostatic and Coval
关于静电和共价
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Semi-ionic Model for Metal Oxi
金属氧化物的半离子模型
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Lifeng Zhao; Lianchi Liu; Huai
  • 通讯作者：
    Huai
Prediction of the heat of mixi
mixi热度预测
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Jianxing Dai ; Chuanjie Wu ; X
  • 通讯作者：
    X

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其他文献

微乳胶粒的形成与表面活性剂的作用—粗粒化力场分子动力学模拟研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    Scientia Sinica Chimica
  • 影响因子：
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  • 作者：
    孙淮
  • 通讯作者：
    孙淮
磷在P-ZSM-5沸石中存在的形态
  • DOI：
    10.3866/pku.whxb20110733
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    Acta Physico - Chimica Sinica
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    杨静;孙迎新;赵立峰;孙淮
  • 通讯作者：
    孙淮
微乳胶粒的形成与表面活性剂的作用——粗粒化力场分子动力学模拟研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    中国科学:化学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    佟思佳;曹风雷;辛亮;孙淮
  • 通讯作者：
    孙淮
An all-atom force field developed for Zn4O(RCO2)6 metal organic frameworks
为 Zn4O(RCO2)6 金属有机骨架开发的全原子力场
  • DOI：
    10.1007/s00894-014-2146-3
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    Journal of Molecular Modeling
  • 影响因子：
    2.2
  • 作者：
    孙迎新;孙淮
  • 通讯作者：
    孙淮
烷基苯磺酸盐表面活性剂的结构与气-液界面性质研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    计算机与应用化学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    陈清;程涛;李丰;孙淮
  • 通讯作者：
    孙淮

其他文献

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孙淮的其他基金

高通量分子模拟驱动机器学习预测分子热力学和输运性质的算法、软件和数据库
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  • 资助金额：
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  • 项目类别：
    联合基金项目

相似国自然基金

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  • 批准年份：
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  • 项目类别：
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相似海外基金

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  • 批准号：
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  • 财政年份：
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  • 资助金额：
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  • 项目类别：
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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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