大豆慢生根瘤菌USDA110高效耐盐基因工程菌株的构建

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31000055
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    19.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

前期研究显示pha2基因簇编码单价阳离子/氢离子逆向转运蛋白,对费氏中华根瘤菌RT19 和苜蓿中华根瘤菌042BM的耐盐性起决定作用。因此,本研究拟采取将pha2基因簇转入具有良好的结瘤固氮能力但耐盐性极差的大豆慢生根瘤菌USDA110中,使pha2基因簇在该菌株中高效表达,通过pha2基因簇表达单价阳离子/氢离子逆向转运蛋白的活性,使USDA110具有转运钠离子等单价阳离子的能力,以提高USDA110的耐盐性,最终达到构建高效耐盐的USDA110基因工程菌株的主要目的。其次,本研究拟采取在遗传研究背景清晰且基因组全序列显示不具有pha2基因簇的USDA110中表达pha2基因簇,通过测试USDA110是否显著提高耐盐性,以达到进一步鉴定pha2基因簇是否对大豆慢生根瘤菌USDA110也具有很好的耐盐作用的目的。

结项摘要

在本研究中,我们首先构建了pha2基因簇的表达载体pVK-pha2。通过三亲本接合,将pVK-pha2和pVK100(负对照)分别转入大豆慢生根瘤菌USDA110,构建工程菌株USDA110/pVK-pha2和USDA110/pVK100。耐盐实验表明,在80 mM NaCl的存在时,前者中的生长情况明显优于后者。进一步使用lacZ报告基因鉴定pha2基因簇在USDA110中成功表达。以上实验表明, pha2基因簇能够在大豆慢生根瘤菌USDA110表达,且能在一定程度上提高其耐盐性。为了进一步提高耐盐工程菌株的耐盐性,我们构建了nhaA表达载体pVKANP(+)并转入USDA110。结果发现,在80 mM NaCl的存在时,USDA110/pVKANP(+)基因工程菌株耐盐能力明显优于USDA110/pVK-pha2。因此,我们构建了基因betS和nhaA的双基因工程菌株。此外,我们也尝试使用强启动子-Trp启动子提高USDA110/ pVKANP(+)中nhaA的表达。结果发现在各种耐盐工程菌株中,USDA110/pVKANP(+)耐盐性最优,其次是USDA110/pVK-pha2。以上研究表明,根瘤菌或大肠杆菌等非耐盐菌中基因的耐盐能力十分有限或者其表达受USDA110调控机制所限,因此无法显著提高其耐盐性。为了克隆高效的耐盐碱基因,我们选择从具有更高效耐盐碱能力的中度嗜盐菌新种中克隆新的或关键的耐盐碱基因,通过这些基因的克隆与功能分析,筛选高效的耐盐碱基因,实现构建USDA110高效耐盐基因工程菌株的目的。最终,我们从中度嗜盐菌新种中克隆得到四个与钠离子输出相关的基因:编码双组分小药物抗性蛋白的基因簇psmrAB、编码新型的NhaD 型钠(锂)/氢逆向转运蛋白基因nhaD、编码由α、β、γ亚基组成的草酰乙酸脱羧酶复合物的基因簇oadGAB和编码依赖Na+的HCT家族转运蛋白的基因sdmlT。我们惊喜地发现sdmlT能够将大肠杆菌(E. coli)的耐盐性从0.8 M NaCl提高到1.5 M NaCl。这表明该基因具有在异源宿主高效表达的能力,应该是一个高效耐盐碱的关键基因。在未来的研究中,我们一方面鉴定其功能,另一方面拟将其导入USDA110,测试其在USDA110中的耐盐性。本研究的开展为我们进一步构建高效耐盐的大豆慢生根瘤菌工程菌株积累了宝贵的经验。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Putative paired small multidrug resistance family proteins PsmrAB, the homolog of YvdSR, actually function as a novel two-component Na+/H+ antiporter
假定的配对小多药耐药家族蛋白 PsmrAB(YvdSR 的同源物)实际上充当新型双组分 Na /H 反向转运蛋白
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    FEMS Microbiology Letters
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Jiang; Juquan;Wang; Lei;Zhang; Hua;Wu; Haiping;Huang; Haipeng;Yang; Lifu
  • 通讯作者:
    Lifu
松嫩平原盐碱地中耐(嗜)盐菌的生物多样性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    姜巨全;黄海鹏;孟婧;肖鸿禹;李成;孟琳;洪闪;刘贺男;王雪枫
  • 通讯作者:
    王雪枫
Halomonas zhaodongensis sp. nov., a slightly halophilic bacterium isolated from saline-alkaline soils in Zhaodong, China
肇东盐单胞菌 sp.
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    Tingting Su;Yuanyuan Pan;Lin Meng;Shaoxin Hu;Xiaoxia Zhang;Baozhong Hu;Jing Meng;Cheng Li;Haipeng Huang
  • 通讯作者:
    Haipeng Huang
Cloning and identification of a novel NhaD-type Na+/H+ antiporter from metagenomic DNA of the halophilic bacteria in soil samples around Daban Salt Lake
达坂盐湖周边土壤嗜盐细菌宏基因组DNA中新型NhaD型Na/H逆向转运蛋白的克隆与鉴定
  • DOI:
    10.1007/s00792-013-0600-2
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Lifu Yang;Zhenhui Wang;Lei Wang;Ren Mu;Zhi Zou;Kun Yuan;Yuekun Wang;Haiping Wu;Juquan Jiang
  • 通讯作者:
    Juquan Jiang
偶联钠离子转运的草酰乙酸脱羧酶研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    东北农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    姜巨全;黄海鹏;孟婧;胡宝忠
  • 通讯作者:
    胡宝忠

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    孙开福
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    姜巨全;洪闪;徐桐;张爽;张诚
  • 通讯作者:
    张诚

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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