依赖Na+的新型PiT家族转运蛋白SdpsT的功能鉴定及其重要氨基酸残基的功能分析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31570045
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0103.微生物组学与代谢
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Preliminary experiments suggest that SdpsT may be a novel PiT family transporter with Na+(Li+)/H+ antiport activity, but its function hasn’t been identified experimentally as yet. In this project, we plan to identify the exact function of SdpsT as a novel PiT family transporter by analyzing the uptake of 32P labeled inorganic phosphate or 35S labeled inorganic sulfate based on RSO membrane vesicles containing pUC-sdpsT. Also, we plan to identify whether SdpsT extrudes Na+ indenpendtly as a Na+(Li+)/H+ antiporter or SdpsT extrudes Na+ as a PiT family transporter by being coupled to the transportation of inorganic phosphate or inorganic sulfate through the acridine orange fluorescence dequenching method based on inverted membrane vesicles or by analyzing the uptake of 22Na+ by inverted membrane vesicles containing pUC-sdpsT. As a novel PiT family transporter, identification of SdpsT will be very helpful to not only understand molecular mechanism of inorganic phosphate or inorganic sulfate transportation by SdpsT and halo-alkali tolerant molecular mechanism of SdpsT, but also enhance our knowledge of the key role of PiT family transporters and Na+(Li+)/H+ antiporters in bacterial halo-alkali tolerance.
前期研究暗示SdpsT是一个可能具有钠(锂)/氢逆向转运蛋白功能的新型PiT家族转运蛋白,但其确切功能仍然未定。因此,本项目拟采用基于RSO膜微囊的同位素32P或35S标记的检测技术,鉴定SdpsT具体作为何种PiT家族转运蛋白行使功能;采用基于反转膜微囊的吖啶橙荧光猝灭恢复法或同位素22Na的检测技术,鉴定SdpsT具体是通过行驶钠(锂)/氢逆向转运蛋白功能输出Na+,还是通过偶联PiT家族转运蛋白功能输出Na+。作为新型PiT家族转运蛋白,SdpsT的功能鉴定,不仅可以揭示该蛋白转运无机磷酸/无机硫酸以及耐盐碱的分子机制,而且可以增进人们对PiT家族转运蛋白和钠(锂)/氢逆向转运蛋白在细菌耐盐碱方面的认识。

结项摘要

在本研究中,为了对SdpsT的准确功能进行鉴定,我们将SdpsT构建于表达载体pET19b,并转入大肠杆菌(E. coli)EP432(ΔnhaA, ΔnhaB)。耐盐碱测试表明SdpsT在大肠杆菌(E. coli)EP432中成功表达,可以用于后续Na+(Li+,K+)/H+逆向转运蛋白活性测试。Western blot检测显示,SdpsT定位于细胞质膜。AO荧光猝灭法对其进行蛋白活性检测,表明SdpsT具有Na+(Li+,K+)/H+逆向转运蛋白的活性,并且具有pH依赖性。转运动力学研究表明,Na+、Li+、K+在EP432中K0.5值分别是0.10 ± 0.05 mM、0.57 ± 0.03 mM、0.43 ± 0.06 mM,即SdpsT对Na+、Li+、K+的亲和力分别是Na+ > K+ > Li+。我们进一步通过系统发育分析,发现SdpsT代表一类新型的Na+(Li+,K+)/H+逆向转运蛋白。系统发育学分析和序列比对结果表明SdpsT属于PiT家族蛋白,可能具有转运无机磷酸和(或)硫酸的功能。因此,我们采用同位素示踪技术,以32P和35S检测SdpsT的吸收特性,结果表明,SdpsT在Na+浓度≥ 50 mM时具有吸收无机磷酸的能力而不具有吸收无机硫酸的能力。为了进一步验证该实验结果,我们应用Red同源重组技术敲除大肠杆菌K12中与无机磷酸、硫酸转运相关的基因,即pitA、pstA、cysA和cysZ,获得双突变株E. coli K12ΔpitAΔpstA和E. coli K12ΔcysAΔcysZ,并进行SdpsT的功能互补验证,结果表明SdpsT能利用M56培养基中的无机磷酸而不能利用M9培养基中的无机硫酸,此结果与同位素实验结果是一致的。基于以上结果,SdpsT同时具有依赖Na+的无机磷酸转运蛋白和Na+(Li+,K+)/H+逆向转运蛋白功能且SdpsT应该可以采用独立行使Na+(Li+,K+)/H+逆向转运蛋白活性的方式输出Na+。本项目的研究成果在于:证实SdpsT为PiT蛋白家族新成员,同时代表一类新型的Na+(Li+,K+)/H+逆向转运蛋白。首次报道了PiT蛋白家族成员具有Na+/H+逆向转运蛋白活性。以上研究结果对进一步揭示PiT蛋白家族蛋白功能,拓宽对Na+/H+逆向转运蛋白的认识均具有重要理论价值。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(3)
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    姜巨全;杨立娜;刘艳双;孙开福
  • 通讯作者:
    孙开福
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赵东盐单胞菌新型双组分 Na (Li ,K )/H 逆向转运蛋白的表征
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2017-06-26
  • 期刊:
    Scientific Reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Meng L;Meng F;Zhang R;Zhang Z;Dong P;Sun K;Chen J;Zhang W;Yan M;Li J;Abdel-Motaal H;Jiang J
  • 通讯作者:
    Jiang J
A UPF0118 family protein with uncharacterized function from the moderatehalophile Halobacillus andaensis represents a novel class of Na+(Li+)/H+ antiporter
来自中度嗜盐菌安达盐杆菌的 UPF0118 家族蛋白具有未表征的功能,代表了一类新型 Na (Li )/H 逆向转运蛋白
  • DOI:
    10.1038/srep45936
  • 发表时间:
    2017-04-04
  • 期刊:
    Scientific Reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Dong P;Wang L;Song N;Yang L;Chen J;Yan M;Chen H;Zhang R;Li J;Abdel-Motaal H;Jiang J
  • 通讯作者:
    Jiang J

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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