SRLS APPROACH FOR STUDIES ON ORIENTED MEMBRANE PROTEINS BY SOLID-STATE NMR
通过固态核磁共振研究定向膜蛋白的 SRLS 方法
基本信息
- 批准号:8364106
- 负责人:
- 金额:$ 0.16万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2011
- 资助国家:美国
- 起止时间:2011-09-01 至 2012-08-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:AccountingAddressDataDiffusionEvolutionFundingGrantLengthMagnetismMembraneMembrane ProteinsMethodsModelingMotionNMR SpectroscopyNational Center for Research ResourcesPhasePhysiologic pulsePrincipal InvestigatorProtein DynamicsProteinsRelaxationResearchResearch InfrastructureResourcesSourceTechnologyTimeUnited States National Institutes of HealthVertebral columncostresearch studysolid state nuclear magnetic resonance
项目摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources
provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. Primary support for the subproject
and the subproject's principal investigator may have been provided by other sources,
including other NIH sources. The Total Cost listed for the subproject likely
represents the estimated amount of Center infrastructure utilized by the subproject,
not direct funding provided by the NCRR grant to the subproject or subproject staff.
In solid-state NMR of oriented membrane proteins, the traditional method of NMR spin relaxation analysis, which assumes predominantly fast isotropic motions, does not extract adequately and fully the information inherent to the experimental data. Here, the primary issue is how to address the great complexity of protein dynamics, including the global and restricted local motions. In general, in oriented membrane proteins one should expect highly constrained local motions of the loop domains and the backbone superimposed onto the overall uniaxial rotational diffusion of the protein (e.g. of the type observed in magnetically aligned bicelles. The unique SRLS approach developed by Freed and co-workers accounts most generally for the relationship between the global and local motions, for the local ordering, and for the relevant magnetic interactions. The implementation of the model for the 2D-ELDOR experiment is directly generalizable to solid-state NMR pulse sequences, which include switching on the transverse B1 field with defined pulse phases and lengths for prolonged periods of time during the evolution. Moreover, the features of the SRLS model allow one to include torsional motions of the protein within the membrane's restoring potential, as well as the effects of collective fluctuations of the membrane on the protein dynamics. We will adapt the SRLS model to solid-state NMR spectroscopy of oriented membrane proteins with the purpose of extracting the dynamic and structural information from the analyses of spectral lineshapes and cross-polarization build-up rates.
该子项目是利用资源的众多研究子项目之一
由 NIH/NCRR 资助的中心拨款提供。子项目的主要支持
并且子项目的主要研究者可能是由其他来源提供的,
包括其他 NIH 来源。 子项目可能列出的总成本
代表子项目使用的中心基础设施的估计数量,
NCRR 赠款不直接向子项目或子项目工作人员提供资金。
在定向膜蛋白的固态核磁共振中,传统的核磁共振自旋弛豫分析方法主要假设快速各向同性运动,无法充分、完整地提取实验数据固有的信息。在这里,首要问题是如何解决蛋白质动力学的巨大复杂性,包括全局和受限的局部运动。 一般来说,在定向膜蛋白中,我们应该预期环域和骨架的局部运动会受到高度约束,叠加到蛋白质的整体单轴旋转扩散上(例如在磁性对齐的 bicelles 中观察到的类型)。Freed 和同事们最普遍地解释了全局和局部运动之间的关系、局部排序以及相关的磁相互作用。2D-ELDOR 实验模型的实现是可以直接推广的。固态 NMR 脉冲序列,其中包括在进化过程中长时间打开具有定义的脉冲相位和长度的横向 B1 场。此外,SRLS 模型的特征允许人们将蛋白质的扭转运动包括在内。膜的恢复电位,以及膜的集体波动对蛋白质动力学的影响,我们将把 SRLS 模型应用于定向膜蛋白的固态核磁共振波谱,目的是从分析中提取动态和结构信息。光谱线形和交叉极化建立速率。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Alexander A. Nevzorov其他文献
Alexander A. Nevzorov的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Alexander A. Nevzorov', 18)}}的其他基金
Resonator Approach to Pulsed Dynamic Nuclear Polarization of Membrane Proteins
膜蛋白脉冲动态核极化的谐振器方法
- 批准号:
10242008 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 0.16万 - 项目类别:
Resonator Approach to Pulsed Dynamic Nuclear Polarization of Membrane Proteins
膜蛋白脉冲动态核极化的谐振器方法
- 批准号:
10004143 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 0.16万 - 项目类别:
相似国自然基金
本体驱动的地址数据空间语义建模与地址匹配方法
- 批准号:41901325
- 批准年份:2019
- 资助金额:22.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
时空序列驱动的神经形态视觉目标识别算法研究
- 批准号:61906126
- 批准年份:2019
- 资助金额:24.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
针对内存攻击对象的内存安全防御技术研究
- 批准号:61802432
- 批准年份:2018
- 资助金额:25.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
大容量固态硬盘地址映射表优化设计与访存优化研究
- 批准号:61802133
- 批准年份:2018
- 资助金额:23.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
IP地址驱动的多径路由及流量传输控制研究
- 批准号:61872252
- 批准年份:2018
- 资助金额:64.0 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Climate Change Effects on Pregnancy via a Traditional Food
气候变化通过传统食物对怀孕的影响
- 批准号:
10822202 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.16万 - 项目类别:
Ultra-precision clinical imaging and detection of Alzheimers Disease using deep learning
使用深度学习进行超精密临床成像和阿尔茨海默病检测
- 批准号:
10643456 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 0.16万 - 项目类别:
Improving Prognostication for Traumatic Brain Injury
改善创伤性脑损伤的预后
- 批准号:
10643695 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 0.16万 - 项目类别:
Gabapentinoid/opioid mixtures: abuse and toxicity
加巴喷丁/阿片类混合物:滥用和毒性
- 批准号:
10639396 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 0.16万 - 项目类别: