GeneORator: a novel and high-throughput method for the synthetic biology-based improvement of any enzyme

GeneORator：一种新颖的高通量方法，用于基于合成生物学的任何酶的改进

基本信息

批准号：
BB/S004955/1
负责人：
Douglas Kell
金额：
$ 25.73万
依托单位：
University of Liverpool
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2019
资助国家：
英国
起止时间：
2019 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FS004955%2F1
关键词：
GeneORator novel throughput method synthetic

项目摘要

Enzymes have significant uses in biotechnology, for instance as components of 'biological' washing powders. The total enzyme market is large, some $8Bn per year.Natural enzymes are normally very poor. We can improve them by changing their sequences. However, this still scales as powers of their size: for 14 residues the number is greater than the lifetime in s of the known Universe (~100,000,000,000,000,000). We have a new method that allows one to do this additively (for 14 residues it is just 280 examples). This allows us to study the possible variants MUCH more effectively; with one enzyme we have made a variant that is 1210 times quicker than the starting enzyme.However, we now need to show that this was not a 'fluke' by demonstrating our methods on a series of other enzymes, and, as well as automating our methods using robots, this is what this project will do. This should get us to a state where we can attract sufficient investment to commercial our discoveries properly.

酶在生物技术中具有重要用途，例如作为“生物”洗衣粉的成分。酶的市场总量很大，每年约 80 亿美元。天然酶通常很差。我们可以通过改变它们的顺序来改进它们。然而，这仍然是其大小的幂：对于 14 个残基来说，这个数字大于已知宇宙的寿命 (~100,000,000,000,000,000)。我们有一种新方法，可以附加地完成此操作（对于 14 个残基，只有 280 个示例）。这使我们能够更有效地研究可能的变体；使用一种酶，我们制作了一种比起始酶快 1210 倍的变体。但是，我们现在需要通过在一系列其他酶上演示我们的方法以及自动化来证明这不是“侥幸”我们使用机器人的方法，这就是这个项目将要做的。这应该让我们能够吸引足够的投资来正确地将我们的发现商业化。

项目成果

期刊论文数量（8）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

SynBiopython: an open-source software library for Synthetic Biology

DOI：
10.1093/synbio/ysab001
发表时间：
2021-02-22
期刊：
Synthetic Biology
影响因子：
3.2
作者：
Yeoh JW;Swainston N;Vegh P;Zulkower V;Carbonell P;Holowko MB;Peddinti G;Poh CL
通讯作者：
Poh CL

The automated Galaxy-SynBioCAD pipeline for synthetic biology design and engineering.

DOI：
10.1038/s41467-022-32661-x
发表时间：
2022-08-29
期刊：
NATURE COMMUNICATIONS
影响因子：
16.6
作者：
Herisson, Joan;Duigou, Thomas;du Lac, Melchior;Bazi-Kabbaj, Kenza;Azad, Mahnaz Sabeti;Buldum, Gizem;Telle, Olivier;El Moubayed, Yorgo;Carbonell, Pablo;Swainston, Neil;Zulkower, Valentin;Kushwaha, Manish;Baldwin, Geoff S.;Faulon, Jean-Loup
通讯作者：
Faulon, Jean-Loup

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