Monitoring bacteriophage DNA in aquaculture sites to predict fish bacterial diseases

监测水产养殖场中的噬菌体 DNA 以预测鱼类细菌性疾病

• 批准号: 22K19214
• 负责人: 吉田 照豊
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19214/
• 关键词: Lactococcus garvieae; Seriola quinqueradiata; ファージ; qPCR; Nocardia seriolae; Seriola dumerili; バクテリオファージ; 養殖場; 定量PCR

○ブリ養殖場より、現在流行しているII型レンサ球菌のビルレントバクテリオファージを数種類分離することに成功した。またこのファージのゲノム解析をしたところ、分離したファージはほぼ同じ遺伝構造をしていた。このファージを用いて、教室に保存しているII型レンサ球菌３００菌株のファージ型別を行ったところ、感受性の型と非感染型の2種類のファージ型別が可能となった。○II型レンサ球菌が流行する時期に、効率的に今回分離できたファージを分離することができた。流行時とファージの分離時期がほぼ重なると考えられた。ファージのゲノム解析から、Shiphoviridaeに分類されることが判明した。また、電子顕微鏡による形態観察の結果も同様であった。今回分離したII型レンサ球菌に特異的に感染するファージは、すでに発表したI型レンサ球菌に感染するファージと非常に類似した遺伝構造を有していた。しかしながら、II型ファージはI型及びIII型レンサ球菌に感染せず、血清型II型の菌株に特異的であると考えられた。○ブリ類養殖において、大きな問題となる感染症であるノカルジアに感染するファージの分離に成功した。電子顕微鏡観察から分離したファージの形態は、非常に尾部の長いShiphoviridaeに分類されるファージであった。これらのファージのゲノム解析に成功した。その結果、すでに報告のあるGordoniaに感染するファージと非常に類似したものであった。詳細なゲノム解析の結果、特定のある部位に遺伝構造の違いが認められた。今回分離したファージは、ブリの細菌感染症であるNocardia seriolaeだけではなく、他のノカルジア属細菌にも感染し、宿主範囲が広いことが判明した。

○我们从鰤鱼养殖场成功分离出当前流行的II型链球菌的几种强毒噬菌体。该噬菌体的基因组分析表明，分离的噬菌体具有几乎相同的遗传结构。使用这种噬菌体，我们对教室中保存的 300 株 II 型链球菌进行了噬菌体分型，可以将噬菌体分为两类：敏感噬菌体和非传染性噬菌体。 ○我们能够有效地分离出在II型链球菌盛行时期能够分离到的噬菌体。人们认为爆发的时间和噬菌体分离的时间几乎重叠。对噬菌体的基因组分析显示，它被归类为船帆病毒科（Shiphoviridae）。此外，使用电子显微镜的形态观察结果也类似。此次分离出的特异性感染II型链球菌的噬菌体，其基因结构与之前发表的感染I型链球菌的噬菌体非常相似。然而，II 型噬菌体不感染 I 型和 III 型链球菌，并且被认为对血清型 II 菌株具有特异性。 ○我们成功分离出感染诺卡氏菌的噬菌体，诺卡氏菌是黄尾鱼养殖业的一大问题。电镜分离的噬菌体形态表明，它是属于船尾病毒科的噬菌体，具有很长的尾巴。我们成功地对这些噬菌体进行了基因组分析。结果表明，这些噬菌体与之前报道的感染 Gordonia 的噬菌体非常相似。通过详细的基因组分析，发现某些特定区域的遗传结构存在差异。此次分离的噬菌体被发现宿主范围广泛，不仅感染鰤鱼诺卡氏菌（Nocardia seriolae）这种鰤鱼的细菌感染，还可以感染诺卡氏菌属的其他细菌。